Effect of transcriptional factors ComK and Hpr on the expression of bacABCDE, ywfH and yvfI genes in Bacillus subtilis
Bacillus subtilis?de ComK ve Hpr yazılma faktörlerinin bacABCDE, yvfI ve ywfH genleri üzerine etkisi
- Tez No: 310701
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AYTEN YAZGAN KARATAŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Bacillus, Bacillus
- Yıl: 2011
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İstanbul Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Quorum sensing mekanizması birçok bakteri tarafından, çeşitli bakteriyel davranışlar geliştirmek için kullanılan önemli bir mikroorganizmalar arası iletişim biçimidir. Bu bilgi doğrultusunda, Bacillus subtilis ,hücre yoğunluğuna bağlı olarak yönetilen sinyal ve düzenlenme mekanizmasını anlayabilmek için iyi bir örnektir. Bakteriler de örneğin besin yetersizliği gibi zor koşullara maruz kaldıklarında, canlı kalabilmek için, hücreler metabolizmalarının ve fizyolojilerinin yönünü, bu zor koşullarla başa çıkmak için değiştirirler. Yani, proteaz, amilaz gibi enzimleri kodlayan genlerin anlatımı eksponensiyal fazda bir çok düzenleyici protein tarafından baskılanır, bu proteinlere geçiş durumu düzenleyicileri adı verilir. Hpr en iyi karakterize edilmiş geçiş durumu düzenleyicilerinden biridir. Bacillus subtilis PY79 şuşunda basilisin üretimiyle ilgili genleri açığa çıkarmak için son zamanlarda yapılan Tn10 mutagenesis çalışmaları, transkripsiyonel düzenleyiciye benzeyen yvfI geninin (GntR ailesi) basilisin biyosenteziyle ilgisi olduğunu kanıtlamıştır.
Özet (Çeviri)
Quorum sensing-regulatory mechanism is used by many bacterial species for establishing different bacterial behaviors. Bacillus subtilis is a good example in order to understand the signaling and regulation mechanism managed through a celldensity dependent manner. In B. subtilis, competence development is under the control of Quorum sensing regulatory pathway.In bacteria, cells redirect their metabolism and physiology to overcome hostile conditions just like the depletion of nutrients during transition to stationary phase. Most of the genes expressed during transition state are controlled by a group of regulatory proteins described as ?transition state regulators?. Hpr (ScoC) is one of the best-characterized transition state regulator. Furthermore in order to elucidate whether if ComK and Hpr regulatory proteins exert their regulatory pattern directly or indirectly on yvfI, ywfH genes and bacABCDEywfG operon, gel retardation assays were also performed.
Benzer Tezler
- Regulatory effect of transcriptional factors ComK and SinR on the expression of bacABCDEywfG operon in Bacillus subtilis
Bacillus subtilis'de ComK Ve SinR Transkripsiyonel Faktörlerinin bacABCDEywfG Operonu Üzerine Etkisi
ALI MOHAMMED NASSER HAIDER
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. AYTEN KARATAŞ
- Detection of YvfI-SinR co-regulated genes and the effect of DegU transcriptional factor on the expression of YvfI gene in Bacillus subtilis
YvfI-SinR proteinleri tarafından birlikte düzenledikleri genlerin belirlenmesi ve Deg-U transkripsiyon faktörünün Bacillus subtilis' deki YvfI gen ekspresyonuna etkisi
BÜŞRA ÖZTÜRK
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
Mikrobiyolojiİstanbul Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYTEN YAZGAN KARATAŞ
- Regulatory effect of transcriptional factor SinR and LutR on the expression of bacABCDEywfG operon in Bacillus subtilis
Bacillus subtilis'de SinR ve LutR transkripsiyon faktörlerinin bacABCDEywfG operonu üzerine düzenleyici etkisi
HASAN DEMİRCİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. AYTEN KARATAŞ
- Modeling the combined effect of RNA-binding proteins and micrornas in post-transcriptional regulation
Transkripsiyon-sonrası kontrolde RNA'ya bağlanan proteinler ve mikrorna'ların etkisinin birlikte modellenmesi
SABER HAFEZQORANI
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
BiyoistatistikOrta Doğu Teknik ÜniversitesiSağlık Bilişimi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YEŞİM AYDIN SON
YRD. DOÇ. DR. HİLAL KAZAN
- Identification of the transcriptional regulators of ATB7B gene by genomic locus proteomics and their effect on cisplatin resistance
ATB7B geninin transkripsiyonel regülatörlerinin genomik lokus proteomik yöntemi ile tanımlanması ve cisplatin direncine etkilerinin araştırılması
AYÇA AÇAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyolojiKoç ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CEYDA AÇILAN AYHAN