Geri Dön

Development of a new immobilization procedure for detection of staphylococcal enterotoxin B (SEB) and Candida albicans

Staphylococcal enterotoksin B (SEB) ve Candida albicans saptaması için yeni tutundurma prosedürü geliştirilmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 313822
  2. Yazar: DENİZ ERTÜRKAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. HALUK KÜLAH, PROF. DR. CANAN ÖZGEN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Kimya Mühendisliği, Biotechnology, Chemical Engineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 110

Özet

Patojenlerin (bakteri, bakteri toksinleri ve virüsler) kısa zamanda ve düsükderisimlerde dahi hızlı ve doğru saptanması çok önemlidir. Geleneksel yöntemlerzaman alan, pahalı aletlere ihtiyaç duyulan ve hastalardan fazla miktarda kanalınması gereken yöntemlerdir. Son zamanlarda, patojenlerin saptanması içinminyatür, duyarlı, biyo-uyumlu, az enerji gereksinimi olmaları nedeni ileimmünosensörler kullanılmaktadır. Birlesmis Milletler Hastalık Kontrol ve Korunma Merkezine göre besin zehirlenmesisebebi ile her yıl Amerikada 76 milyon insan hasta olmakta ve bu hastaların 5000'ihayatını kaybetmektedir. Ayrıca, besin zehirlenmesine sebep olan StaphylococcalEnterotoksin B (SEB) Birlesmis Milletler Hastalık Kontrol ve Korunma Merkezincebiyolojik silah olarak listelenmistir. Böylece, kısa sürede doğru ve seçici SEB toksinisaptaması çok önemlidir.Candida albicans (C. albicans) maya benzeri mantardır ve endise, uykusuzluk,kabızlık, fıtık, panik atak, ayrıca, ağız, dudak, dis eti ve protez implantasyoniltihabına sebep olur. Ayrıca, eğer hastanın bağısıklık sistemi kanserden,kemoterapiden ve A?DS'den zarar görmüs ise C. albicans ölüm nedeniolabilmektedir.Bu çalısmada, atomik kuvvet mikroskobu (AFM) ve yüzeyde kuvvetlendirilmisRaman saçılması (SERS) kullanılarak SEB toksininin ultra duyarlı saptanması içinyeni bir prosedür gelistirilerek, basit ve oldukça seçici homojen sandviç tutunmadeneyi ile gerçeklestirilmistir. Gelistirilen prosedürde, tiyoller bulunan antikorlarüretilerek, SEB toksini antikorlar yardımıyla sensor yüzeyine tutundurulmustur.Ayrıca, SEB toksininin altın yüzeyine bağlanması teorisi ile toksin ve onun antikoruarasındaki reaksiyon hız sabiti hesaplanmıstır. Ayrıca, gelistirilen prosedürkullanılarak C. albicans mayası mikroskop ile saptanmıstır. Böylece, gelistirilenprosedürün farklı patojenleri saptamada da kullanılabileceği kanıtlanmıstır. Bununyanında, bu çalısmada SEB toksininin antikoru ile BSA proteini arasında nonspesifik olmayan etkilesim belirlenmistir. Diğer taraftan, gelistirilen prosedür ileliteratürde kullanılan farklı bir prosedür karsılastırılmıstır. ?kinci prosedürde,kendinden birlesen tek tabakalı yapılar olusturularak, antikorlar bu yapılaratutundurulmustur. Sandviç yapılar ikinci prosedür kullanılarak olusturulduktan sonra,altın yüzeyin pürüzlülüğü ve saptanabilen en az SEB konsantrasyonu sırasıyla AFMve SERS ile saptanmıstır.

Özet (Çeviri)

Fast and accurate detection of pathogens such as bacteria, their toxins and viruses atlow concentrations is very important. The conventional techniques are timeconsuming where expensive equipment is required with a consumption of excessamount of blood from patients. Recently, immunosensors are used for the detectionof pathogens because they are miniature, sensitive, biocompatible and require lowpower.According to the Centers for Disease Control and Prevention (CDCP), 76 millionpeople become ill due to food poisoning and 5,000 of them die each year in UnitedStates. In addition, SEB causing food poisoning has listed as a bioterrorism agent byCDCP. Thus, accurate and selective detection in short time is very important for SEBdetection.Candida albicans (C. albicans) is a yeast-like fungus and causes anxiety, insomnia,constipation, hiatal hernia, panic attacks, denture-induced stomatitis, angularcheilitis, gingivitis and prosthetic implant infections. In addition, it can cause death ifthe immune system of patient is under failure due to cancer, chemotherapy andAIDS.In this study, a new procedure was developed. A simple and highly selectivehomogeneous sandwich immunoassay was obtained for ultrasensitive detection ofStaphylococcal Enterotoxin B (SEB) using Atomic Force Microscopy (AFM) andSurface Enhanced Raman Scattering (SERS) probe. In the developed procedure,thiolated antibodies were produced and SEB was immobilized on the biosensorsurface using these antibodies. In addition, theory of SEB adsorption on a goldsurface was studied and the reaction rate constant between SEB and its toxin wascalculated. Moreover, C. albicans was detected using the developed procedure by amicroscope. Thus, it is proved that, the developed procedure can be used fordetection of different pathogens. Furthermore, nonspecific interaction between SEBantibody and BSA was determined in this study. Also, the developed procedure and aprocedure found from literature were compared. In the procedure used in theliterature (second procedure), self-assembled monolayer (SAM) was formed andantibodies were immobilized on SAM. After formation of sandwich structure, theroughness of gold surface and the minimum concentration of SEB detected weredetermined by AFM and SERS, respectively.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    465273

    Yüzey plazmon rezonans temelli trombin biyosensörünün geliştirilmesi

    Development of a surface plasmon resonance based thrombin biosensor

    DEMET ATAMAN SADIK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Bilim ve TeknolojiHacettepe Üniversitesi

    Nanoteknoloji ve Nanotıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İSMAİL HAKKI BOYACI

  2. Tez No

    662022

    Development of a new ethanol biosensor based on polyfluorene-g- poly(ethyleneglycol) and multiwalled carbon nanotubes

    Polifluorene-g-poli(etilenglikol) ve çok duvarlı karbon nanotüp yapısına dayalı yeni etanol biyosensensör geliştirilmesi

    SIDDIKA AYBÜKE DENİZ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    KimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Fizikokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. LEVENT KAMİL TOPPARE

    DOÇ. DR. SANİYE SÖYLEMEZ

  3. Tez No

    421200

    E vitamininin elektrodöndürme yöntemiyle enkapsülasyonu ve elektrodöndürmeyi etkileyen parametrelerin incelenmesi, nanoliflerin karakterizasyonu

    Nanoencapsulation of vitamin E via electrospinning and the investigation of factors affecting electrospinning, characterization of nanofibers

    TUĞBA YILMAZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FİLİZ ALTAY

  4. Tez No

    222978

    Development of new optical sensors for metal ion sensing

    Metal iyonu duyar optik sensör geliştirilmesi

    NUR AKSUNER

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2008

    KimyaEge Üniversitesi

    Kimya Bölümü

    PROF. DR. EMÜR HENDEN

  5. Tez No

    197582

    Development of QCM based DNA biosensors for detection of genetically modified organisms

    Genetiği değiştirilmiş organizmalar için işaretsiz saptama metodlarının geliştirilmesi

    İREM KARAMOLLAOĞLU

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2007

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. HÜSEYİN AVNİ ÖKTEM

Geri Dön