Terrier ırkı köpeğin normal ve tümörlü meme dokusunda eksprese olan genlerin EST (Expressed Sequence Tags) kütüphanesinin oluşturulması ve karşılaştırılması
Construction and comparison of EST (Expressed Sequence Tags) library for expressed genes in normal and tumoral mammary gland tissue of the terrier dog
- Tez No: 316005
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. NEHİR ÖZDEMİR ÖZGENTÜRK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Yıldız Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 102
Özet
Meme bezi tümörleri köpeklerde çok sık rastlanan tümörlerdir. Dişi köpeklerde gözlenen tüm neoplastik olguların hemen hemen %50'sini meme tümörleri oluşturmaktadır. Köpeklerde meme tümörü oluşumundan sorumlu genler ve oluşum mekanizması ile ilgili veriler oldukça kısıtlıdır. Meme kanseri oluşumunda insan ve köpeklerdeki patogenetik mekanizmaların karşılaştırılması ve köpek meme tümörlerinin insan meme kanseri için uygun bir biyomodel olup olamayacağı hipotezi de son yıllarda birçok komparatif çalışmanın konusu olmuştur.Bu çalışmada meme dokusu örnekleri, biyopsi yöntemi ile sağlıklı Terrier köpeğin normal meme dokusundan ve neoplastik dokusu olan aynı ırktan başka bir köpekten alınmıştır. Dokulardan RNA ve mRNA izolasyonu yapılarak iki ayrı cDNA kütüphanesi oluşturulmuştur. Kurulan cDNA kütüphanelerinden tesadüfi seçilen 2304 klon örneklerinin dizin analizleri yapılarak köpek meme dokusu için EST koleksiyonu oluşturulmuştur. Phrap/Phred, BEAP ve CAP3 programları ile biyoinformatik analizleri yapılarak BLAST yöntemi ile daha önce köpek ve insanlar için yayınlanmış genler birbiri ile karşılaştırılmış, meme patogenezisi üzerine etkisi olan genler tanımlanmıştır. Bu çalışmadaki sonuçların, köpeklerin fonksiyonel genom araştırmalarında önemli bir kaynak teşkil edeceği düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Mammary gland tumor is the main tumor in the dog that frequently concurred. Approximately %50 of the neoplastic cases in female dogs are the mammary gland tumors. Data on genes that are involved in tumorigenesis and mechanism of tumor development are insufficient. Comparative studies have been conducted in order to see if tumorigenesis studies in dog could be a model for human mammary gland tumors.In this study, mammary tissue samples were collected from both normal mammary tissue of a healthy Terrier dog and neoplastic mammary tissue of a sick dog. From the tissues, total RNA and mRNA were isolated for construction of two different cDNA libraries. Total 2304 colonies which are randomly selected from the two libraries were sequenced for developing a dog mammary gland ESTs collection. Phred/Phrap, BEAP and CAP3 programmes were used for bioinformatic analysis. Putative functions of all unique sequences were designed by gene homology based on BLAST. Genes of the human and dog are compared and investigated the effect of these genes on mammary pathogenesis with BLAST method. The results of this study are very valuable resource for functional genome studies of the dogs.
Benzer Tezler
- Malign meme tümörlü köpeklerde operatif girişime ek olarak uygulanan immunoterapi ve homeopatinin etkisi
The effect of homeopathy and immunotherapy applied together with the operation on malign mammary tumours of the dog
NİLGÜN GÜLTİKEN
Doktora
Türkçe
2003
Veteriner HekimliğiAnkara ÜniversitesiDoğum ve Jinekoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. RIFAT VURAL
- Sağlıklı köpeklerde homosistein düzeylerinin araştırılması
Research of homocysteine levels in healthy dogs
CENK ÇAYIR
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Veteriner HekimliğiYüzüncü Yıl Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SÜLEYMAN KOZAT
- Aydın Büyükşehir Belediyesi evcil hayvan bakım ve rehabilitasyon merkezlerinden cerrahi kliniğine getirilen hastaların genel değerlendirilmesi
General evaluation of the patients brought from aydin metropolitan municipality pet care and rehabilitation centers to the surgical clinic
RAMAZAN ONUR DURAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Veteriner HekimliğiAydın Adnan Menderes ÜniversitesiCerrahi (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. RAHİME YAYGINGÜL
- Köpeklerde perikardiyal efüzyonun tanı ve sağaltımı üzerine klinik araştırmalar
Clinical investigations in the diagnosis and treatment pericardial effusions in dogs
BÜŞRA İNAL GÜNAY
Doktora
Türkçe
2021
Veteriner Hekimliğiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaCerrahi (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KÜRŞAT ÖZER
- Kedi ve köpeklerde ağız tümörlerinin tanı ve tedavi seçeneklerinin değerlendirilmesi
Evaluation of the diagnosis and treatment options of the oral tumors in cats and dogs
EMİNE ESMA ÇERKEZ
Doktora
Türkçe
2022
Veteriner Hekimliğiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaCerrahi (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KÜRŞAT ÖZER