Klinik örneklerden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarından elde edilen bakteriyofajlarda bulunan SCIN, CHIPS, SEI, SEK toksin genlerinin varlığının PZR ve southern blot yöntemi ile kıyaslanması
Comparison of PCR and southern blot methods for detection of the presence of toxin genes including SCIN, CHIPS,SEI, SEK in bacteriophages obtained from Staphylococcus aureus strains isolated from clinical samples
- Tez No: 318384
- Danışmanlar: DOÇ. DR. FİKRET ŞAHİN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Biotechnology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 62
Özet
Bakteriyofajlar, taşıdıkları toksin genleri sayesinde bakterilere farklı fenotipik özellikler kazandırırlar. Bu özelliklerin tespit edilmesi ve araştırılması, mikrobiyal biyoteknoloji çalışmaları açısından önemlidir. Bu amaçla çeşitli moleküler yöntemler geliştirilmiştir. Staphylococcus aureus, hastane ve toplum kaynaklı enfeksiyonlara sebep olan en önemli patojenlerden biridir. Bu çalışmada, S. aureus suşlarından elde edilen fajlarda bulunan SCIN, CHIPS, SEI, SEK toksin genlerinin varlığı PZR ile tespit edilmiştir. Southern Blot hibridizasyon yöntemi ile bu toksin genlerinin varlığı doğrulanmıştır. Bu iki yöntem duyarlılık ve özgüllük açısından karşılaştırılmıştır. Son yıllarda bulunan bu toksin genleri ile ilgili az sayıda çalışma bulunmaktadır. Analizler sonucunda; PZR yönteminde daha az konsantrasyonda DNA'ya ihtiyaç duyulurken, Southern Blot hibridizasyon yönteminde daha fazla konsantrasyonda DNA'ya ihtiyaç olduğu görülmüştür. PZR ve Southern Blot Hibridizasyon yöntemlerinin özgüllük açısından benzer olduğu tespit edilmiştir.
Özet (Çeviri)
Bacteriophages provide different phenotypic features for bacteria with toxin genes. The detection and investigation of these features are important for studies of microbial biotechnology. For these purpose, several molecular methods have been developed. Staphylococcus aureus is one of the most important pathogen which is caused infection by community and nasocomial. In this study, presence of toxin genes including SCIN, CHIPS, SEI, SEK in bacteriophages obtained from S. aureus strains were detected by PCR. Presence of this toxin genes were confirmed by Southern Blot hybridization method. This methods were compared for sensitivity and specificity. There are few studies about these toxin genes. According to our results, while PCR method need less concentration of DNA, Southern Blot hybridization method needs more concentration of DNA. Southern Blot hybridization and PCR analysis have similar specificities.
Benzer Tezler
- Toplum kaynaklı metisilin dirençli staphylococcus aureus (CA-MRSA) suşlarında kromozomal kaset tiplerinin polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemleri ile araştırılması
Investigation of cassette chromosome types with polimerase chain reaction (PCR) in community-associated methicillin resistant staphylococcus aureus (CA-MRSA) strains
SAEID BARKAR
Doktora
Türkçe
2009
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. A. MURAT AKSOY
- Klinik örneklerden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarında Mupirosin duyarlılığının araştırılması
Mupirocin resistance of Staphylococcus aureus isolated from clinical specimens
JALE GÖKTEPE
- Klinik örneklerden izole edilen metisilin dirençli staphylococcus aureus (MRSA) suşlarında siprofloksasin'in yeşil çay ile sinerjik etkisinin dama tahtası yöntemiyle araştırılması
Investigation of the synergic effect of ciprofloxacin and green tea in methicillin-resistant staphylococcus aureus (MRSA) strains isolated from clinical samples by the checkerboard dilution method
YALÇIN DİCLE
Doktora
Türkçe
2018
MikrobiyolojiAtatürk ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALİL YAZGI
- Metisilin dirençli staphylococcus aureus, klebsiella pneumoniae ve escherichia coli suşlarında seftarolin fosamile duyarlılığın irdelenmesi
Investigation of ceftaroline fosamil sensitivity in methicillin resistant staphylococcus aureus, klebsiella pneumoniae and escherichia coli strains
KADİR EFE
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
MikrobiyolojiUludağ ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CÜNEYT ÖZAKIN
- Daptomisinin metisiline dirençli staphylococcus aureus izolatlarında in vitro etkinliğinin araştırılması
Investigation of in vitro activity of daptomycin against methicillin-resistant staphylococcus aureus isolates
GÜLİN ÖZGE DİLER
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
MikrobiyolojiAbant İzzet Baysal ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FIRAT ZAFER MENGELOĞLU