Geri Dön

Klinik örneklerden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarından elde edilen bakteriyofajlarda bulunan SCIN, CHIPS, SEI, SEK toksin genlerinin varlığının PZR ve southern blot yöntemi ile kıyaslanması

Comparison of PCR and southern blot methods for detection of the presence of toxin genes including SCIN, CHIPS,SEI, SEK in bacteriophages obtained from Staphylococcus aureus strains isolated from clinical samples

PDF İndir

  1. Tez No: 318384
  2. Yazar: ZEYNEP BURÇİN ÇAVUŞOĞLU
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. FİKRET ŞAHİN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Biotechnology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 62

Özet

Bakteriyofajlar, taşıdıkları toksin genleri sayesinde bakterilere farklı fenotipik özellikler kazandırırlar. Bu özelliklerin tespit edilmesi ve araştırılması, mikrobiyal biyoteknoloji çalışmaları açısından önemlidir. Bu amaçla çeşitli moleküler yöntemler geliştirilmiştir. Staphylococcus aureus, hastane ve toplum kaynaklı enfeksiyonlara sebep olan en önemli patojenlerden biridir. Bu çalışmada, S. aureus suşlarından elde edilen fajlarda bulunan SCIN, CHIPS, SEI, SEK toksin genlerinin varlığı PZR ile tespit edilmiştir. Southern Blot hibridizasyon yöntemi ile bu toksin genlerinin varlığı doğrulanmıştır. Bu iki yöntem duyarlılık ve özgüllük açısından karşılaştırılmıştır. Son yıllarda bulunan bu toksin genleri ile ilgili az sayıda çalışma bulunmaktadır. Analizler sonucunda; PZR yönteminde daha az konsantrasyonda DNA'ya ihtiyaç duyulurken, Southern Blot hibridizasyon yönteminde daha fazla konsantrasyonda DNA'ya ihtiyaç olduğu görülmüştür. PZR ve Southern Blot Hibridizasyon yöntemlerinin özgüllük açısından benzer olduğu tespit edilmiştir.

Özet (Çeviri)

Bacteriophages provide different phenotypic features for bacteria with toxin genes. The detection and investigation of these features are important for studies of microbial biotechnology. For these purpose, several molecular methods have been developed. Staphylococcus aureus is one of the most important pathogen which is caused infection by community and nasocomial. In this study, presence of toxin genes including SCIN, CHIPS, SEI, SEK in bacteriophages obtained from S. aureus strains were detected by PCR. Presence of this toxin genes were confirmed by Southern Blot hybridization method. This methods were compared for sensitivity and specificity. There are few studies about these toxin genes. According to our results, while PCR method need less concentration of DNA, Southern Blot hybridization method needs more concentration of DNA. Southern Blot hybridization and PCR analysis have similar specificities.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    242607

    Toplum kaynaklı metisilin dirençli staphylococcus aureus (CA-MRSA) suşlarında kromozomal kaset tiplerinin polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemleri ile araştırılması

    Investigation of cassette chromosome types with polimerase chain reaction (PCR) in community-associated methicillin resistant staphylococcus aureus (CA-MRSA) strains

    SAEID BARKAR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. A. MURAT AKSOY

  2. Tez No

    272595

    Klinik örneklerden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarında Mupirosin duyarlılığının araştırılması

    Mupirocin resistance of Staphylococcus aureus isolated from clinical specimens

    JALE GÖKTEPE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    MikrobiyolojiMarmara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. BURAK AKSU

  3. Tez No

    509114

    Klinik örneklerden izole edilen metisilin dirençli staphylococcus aureus (MRSA) suşlarında siprofloksasin'in yeşil çay ile sinerjik etkisinin dama tahtası yöntemiyle araştırılması

    Investigation of the synergic effect of ciprofloxacin and green tea in methicillin-resistant staphylococcus aureus (MRSA) strains isolated from clinical samples by the checkerboard dilution method

    YALÇIN DİCLE

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HALİL YAZGI

  4. Tez No

    463970

    Metisilin dirençli staphylococcus aureus, klebsiella pneumoniae ve escherichia coli suşlarında seftarolin fosamile duyarlılığın irdelenmesi

    Investigation of ceftaroline fosamil sensitivity in methicillin resistant staphylococcus aureus, klebsiella pneumoniae and escherichia coli strains

    KADİR EFE

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    MikrobiyolojiUludağ Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CÜNEYT ÖZAKIN

  5. Tez No

    447346

    Daptomisinin metisiline dirençli staphylococcus aureus izolatlarında in vitro etkinliğinin araştırılması

    Investigation of in vitro activity of daptomycin against methicillin-resistant staphylococcus aureus isolates

    GÜLİN ÖZGE DİLER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    MikrobiyolojiAbant İzzet Baysal Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FIRAT ZAFER MENGELOĞLU

Geri Dön