In situ biofilm formation and bacterial death monitoring using surface-enhanced raman scattering
Yüzeyde zenginleştirilmiş raman saçılması ile biyofilm oluşumu ve bakteri ölümünün yerinde izlenmesi
- Tez No: 327103
- Danışmanlar: PROF. DR. MUSTAFA ÇULHA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 66
Özet
Yüzeyde zenginleştirilmiş Raman saçılması (YZRS) parmak izi özelliği, oldukça dar spektral band aralığı ve kolay örnek hazırlanması sebebiyle biyolojik moleküllerin ve moleküler yapıların karakterizasyonu için güçlü bir tekniktir. YZRS?de, Raman saçılması,ilgili molekül ya da moleküler yapıların nanoyapılar halindeki altın ve gümüş gibi soymetaller ile yakın veya temas durumuna getirilerek 1014 kat zenginleştirilebilir. YZRS, bakteri ya da biyofilm gibi kompleks biyokimyasal sistemlerin bileşenlerinin tanımlanması ve karakterizasyonu için kullanılabilir. Bu tezde, biyofilm bileşenlerinin tanımlanması ve karakterizasyonu YZRS kullanılarak araştırıldı. Çekirdek AgNP-kabuk kitosan tabaka şeklinde yapı, AgNP?ların kitosan tabaka ile kaplanmasıyla hazırlandı ve bu yapılar biyofilm oluşumu ve bakteri ölümünün gözlemlenmesi için YZRS substratı olarak kullanıldı. Kitosanın absorptif özelliğinden dolayı, bakteri tarafından üretilen biyomateryaller biyofilm bileşenlerinin AgNP ile seçici etkileşimlerinden dolayı metalyüzeyini doyurmadan kabuk içerisine girebilir. Ayrıca bakteri ölümü sırasındaki moleküler değişikliklerin yerinde izlenebilirliği gösterildi. YZRS?nin bakteri hücre duvarındaki morfolojik değişimler ve bakteri dekompozisyonu sırasında salınan DNA/RNA gibimoleküler yapılar hakkında önemli bilgi sağlayabildiği bulunmuştur. Ayrıca, 678 cm -1deki bandın bakterinin ölümünün izlenmesinde kullanılabileceği bulunmuştur
Özet (Çeviri)
Surface-enhanced Raman scattering (SERS) is a powerful technique for characterization of biological molecules and molecular structures due to the fingerprinting property, very narrow spectral bandwidth, and easy sample preparation. In SERS, Raman scattering can be enhanced up to 10 14 times by bringing the molecule or molecular structure of interest close to or in contact with nanostructured noble metals such as gold and silver. SERS can be used for the characterization and identification of components of complex biochemical systems such as bacteria and biofilm. In this thesis, characterization and identification of biofilm components were investigated using SERS. The core AgNP- shell chitosan layer type structure was prepared by coating the AgNPs with a layer of chitosan (c-AgNPs) and they were used as a SERS substrate for biofilm formation and bacterial death monitoring. Due to absorptive property of chitosan, biomaterials that were produced by bacteria can penetrate into shell without saturating the metal surface due to the selective interaction of biofilm components with the AgNPs. The feasibility of in situ monitoring of molecular changes during the bacterial death was also demonstrated. It was found that SERS spectra could provide significant information about the morphologic changes on the bacterial cell wall and released molecular structures such as DNA/RNA bases during the decompositionof bacteria. It was also found that the band at 678 cm -1 could be used for monitoring bacterial death.
Benzer Tezler
- Preventing biofilm formation on laser treated titanium implants
Lazer ile işleme tabi tutulmuş titanyum implantların yüzeylerınde bıyofılm oluşumunun engellenmesi
ARZU EROL
Doktora
İngilizce
2017
Biyomühendislikİstanbul ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İLVEN MUTLU
- Üreteral stent uygulanan hastalarda stent kolonizasyonu ve üriner trakt enfeksiyonları ile ilişkili faktörlerin analizi
Analysis of factors associated with stent coloniization and urinary tract infections in patients with ureteral stent
SAFI KOLKIRAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiÜroloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİHAT SATAR
- Poliindol/poli[2-(dimetilamino) etil metakrilat-ko-metil metakrilat] iletken kompozitlerin sentezi ve karakterizasyonu
Synthesis and characterization of polyindole/poly[2-(dimethylamino) ethyl methacrylate-co-methyl methacrylate] conductive composites
LOKMAN GÜREL
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Mühendislik BilimleriUşak ÜniversitesiMalzeme Bilimi ve Nanoteknoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CENGİZ SOYKAN
- Synthesis and characterization of poly(diethylamino ethyl methacrylate-co-ethyl methacrylate)/polyindole composites
Poli(dietilamino etil metakrilat-ko-etil metakrilat)/poliindol kompozitlerin sentezi ve karakterizasyonu
BURAK TÜFEKÇİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Polimer Bilim ve TeknolojisiUşak ÜniversitesiMetalurji ve Malzeme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CENGİZ SOYKAN
- Azerbaycan'ın farklı süt ürünlerinden probiyotik bakteri izolasyonu ve tanımlanması
Identification of probiotic bacteria from different dairyproducts of Azerbaijan
KAMALA MAMMADOVA
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyolojiEskişehir Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET BURÇİN MUTLU