Doğada serbest yaşayan acanthamoeba türlerinin genotiplendirilmesi
Genotyping of free-living acanthamoeba species in enviroment
- Tez No: 331507
- Danışmanlar: PROF. DR. İSMAİL SONER KOLTAŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Parazitoloji, Parasitology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Parazitoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 56
Özet
Acanthamoeba türleri doğada serbest olarak yaşayan, musluk suları, hazır sular, kontakt lens solüsyonları, toprak, hava, toz, yüzme havuzları ve kaplıcalar da bulunabilen parazitlerdir. Acanthamoeba türleri immün sistemi zayıf olan insanlarda ve hayvanlarda Granülomatoz Amebik Ensefalit (GAE) ve keratite sebep olmaktadır. Ayrıca akciğer, deri, kemik, böbrek üstü bezleri, kulak ve sinüslerde de enfeksiyon etkenidir. Acanthamoeba türlerinin morfolojik kriterleri temel alınarak 24?den fazla türü tanımlanmıştır. Bugün moleküler yöntemlerle 18S rRNA gen bölgesi kullanılarak Acanthamoeba?nın en az 16 farklı genotipi (T1- T16) izole edilmiştir, bu genotiplerden T4 çevresel kaynaklarda baskındır. Bu çalışmada Adana, Afyon, Kütahya, Niğde ve Mersin illerinden 50 su ve 50 toprak örneği toplandı. Mikroskop ve kültür incelemeleri sonrasında Acanthamoeba?nın 18S rRNA gen bölgesi hedef alınarak bütün örneklere PCR çalışıldı. PCR yöntemi ile su örneklerinin 21?i (%42) pozitif, 29?u (%58) negatif bulunurken toprak örneklerinden 23?ü (%46) pozitif ve 27?si (%54) negatif bulundu. Su ve toprak örneklerinde kültür ve PCR yönteminin duyarlılığı ve özgüllüğü %100 bulundu. Adana, Afyon, Niğde ve Mersin illerindeki su örneklerinden %100 oranında Acanthamoeba castellanii (T4) izole edilirken Kütahya?dan %10 Acanthamoeba griffini (T3) ve %90 Acanthamoeba castellanii (T4) izole edildi. Bununla birlikte Afyon, Niğde ve Mersin?deki toprak örneklerinde %100 oranında Acanthamoeba castellanii (T4), Adana?dan %67 Acanthamoeba castellanii (T4), %33 Acanthamoeba griffini, Kütahya?dan %80 Acanthamoeba castellanii (T4) ve %20 Acanthamoeba griffini izole edildi. Sonuç olarak Acanthamoeba türlerinden Acanthamoeba castellanii?nin Türkiye?de baskın olduğu görüldü. ANAHTAR KELİMELER: A. castellanii, A. griffini, Su örnekleri, Toprak örnekleri Türkiye
Özet (Çeviri)
Acanthamoeba species are free-living protozoan parasites that diffuse the enviroment and can be found in tap, mineral waters, contact lens solutions and soil, dust, air, swimming pools and thermal waters. Acanthamoeba species lead to Granulomatous Amebic Encephalitis (GAE), a chronic nervous system disaeses of immunocompromised humans and animals and amoebic keratitis. Also species of Acanthamoeba cause infections of the lungs, skin, bones, adrenal gland, and sinuses. Acanthamoeba species identified of more than 24 species have been found based on morphological criteria. Currently, moleculer techniques, sequencing of 18S rRNA genes, are being used to the species phylogeny of Acanthamoeba. Based on sequence differences 16 genotypes (T1-T16) and of these genotype T4 predominates among enviromental sources. In this study 50 water samples and 50 soil samples were taken from Adana, Afyon, Kütahya, Niğde and Mersin cities of Turkey. After using microscopy and cultivation methods 18S rRNA gene as PCR target for Acanthamoeba species and all of samples were examined by PCR method. The sensitivity and specificity of both culture and PCR methods were 100% in water and soil samples. Twenty one (42%) of the 50 water samples were found positive, 29 (58%) water samples were found negative, 23 (46%) soil samples were found positive and 27 (54%) soil samples were found negative according to PCR method. In this investigation, 100% Acanthamoeba castellanii (T4) species were isolated from water samples in Adana, Afyon, Niğde and Mersin cities while 90% Acanthamoeba castellanii and 10% Acanthamoeba griffini (T3) were isolated from water samples in Kütahya city. However, 100 % Acanthamoeba castellanii (T4) were isolated from soil samples in Afyon, Niğde and Mersin cities. Also 67% Acanthamoeba castellanii (T4), 33% Acanthamoeba griffini isolated from soil samples in Adana, while 80% Acanthamoeba castellanii (T4) and 20% Acanthamoeba griffini (T3) were isolated from soil samples in Kütahya. As a result of the study, it has also been shown that Acanthamoeba castellanii dominant species among of Acanthamoeba species in Turkey. KEYWORDS: A.castellanii, A. griffini, water samples, soil samples, Turkey
Benzer Tezler
- Toprakta serbest yaşayan ve insanda parazitlenebilen bazı amiplerin izolasyonu ve moleküler karakterizasyonu
Isolatıon and molecular characterızatıon of some free-lıvıng ameba ın soıl that they can be parasıtısıng ın human
SÜHEYLA DOĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
ParazitolojiErciyes ÜniversitesiParazitoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SÜLEYMAN YAZAR
- Çevresel ve klini örneklerde Acanthamoeba spp. ve Naegleria spp.varlığının araştırılması
The investigation of Acanthamoeba spp. and Naegleria spp. in clinical and environmental samples
ÖNDER YÜNLÜ
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
ParazitolojiCumhuriyet ÜniversitesiParazitoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEMRA ÖZÇELİK
- Doğu ve Güneydoğu Anadolu bölgelerinde doğadan izole edilen serbest yaşayan acanthamoeba türlerin tanısında mikroskobi, kültür ve moleküler yöntemlerin karşılaştırılması
The comparison of microscopy, culture and molecular methods used in diagnosis of free-living acanthamoeba species isolated from environment in east and south east regions
YASİN GENİŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
ParazitolojiÇukurova ÜniversitesiParazitoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İSMAİL SONER KOLTAŞ
- Yaban hayvanlarının doğal yaşam ortamlarında fotoğraflanması
Photographing wild animals in their natural habitats
CENK OĞURTANI
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Sahne ve Görüntü SanatlarıHaliç ÜniversitesiFotoğraf ve Video Ana Sanat Dalı
PROF. YUSUF MURAT ŞEN
DR. ÖĞR. ÜYESİ ZEHRA DOĞAN SÖZÜER
- Evolutionary engineering of freeze tolerance in Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae'da donma toleransının evrimsel mühendisliği
FEYZA ŞERİFE KÜÇÜK
