Kapiler jel elektroforez yöntemiyle Salvia türlerinde DNA tayini
Determination of DNA in Salvia species by capillary gel electrophoresis
- Tez No: 334832
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ÜLKÜ DİLEK UYSAL, DOÇ. DR. NİLGÜN ÖZTÜRK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Kapiler Jel Elektroforez, Agaroz Jel Elektroforez, Bitki DNA?sı, Salvia, RAPD, Filogenetik Ağaç, Capillary Gel Electrophoresis, Agarose Gel Electrophoresis, Plant DNA, Salvia, RAPD, Phylogenetic Tree
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Anadolu Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 161
Özet
Bu çalışmada, Türkiye Florasında geniş yayılış gösteren ve pek çok endemik türe sahip olan Lamiaceae familyasına ait 10 farklı Salvia (adaçayı) türünün agaroz jel elektroforez ve kapiler jel elektroforez yöntemleri ile DNA parçalarının tayini yapılmıştır. Bu amaçla, öncelikle Eskişehir bölgesinden toplanan Salvia L. türlerinin yapraklarından genomik DNA'lar izole edilmiştir. Genomik DNA'ların bazı bölgeleri OPA?03, OPA?04, OPA?05 ve OPA?15 oligonükleotit primerleri kullanılarak RAPD yöntemi ile çoğaltılmıştır. DNA parçaları agaroz jel elektroforezi ile ayrılmış ve bu DNA bantları UV ışık kaynağı kullanılarak görüntülenmiştir. Salvia L. türleri için filogenetik ilişki belirlenmiştir. Bu sonuçlar genetik olarak en uzak türlerin S. fruticosa ve S. dichroantha olduğunu, buna karşın en yakın türlerin ise S. bracteata ve S. fruticosa olduğunu göstermektedir.Kapiler jel elektroforez ile DNA ayırımları için hidroksietil selüloz kullanılarak dinamik kaplama yöntemi geliştirilmiştir. 14 farklı büyüklükteki standart DNA parçası için bu yöntem kullanılarak etkili bir ayırım ve tekrarlanabilir sonuçlar elde edilmiştir. Salvia L. türlerinden seçilen DNA parçaları kapiler jel elektroforez ile tayin edilmiştir. Elde edilen bu sonuçlar agaroz jel elektroforez sonuçlarıyla karşılaştırılmış ve birbiriyle uyumlu olduğu gözlenmiştir.
Özet (Çeviri)
In this study, DNA fragments of ten different Salvia (sage) species from Lamiacea family, which have a wide range in Turkey Flora and many of the endemic species, were determined by using agarose gel electrophoresis and capillary gel electrophoresis. For this purpose, the genomic DNAs were firstly isolated from the leaves of Salvia species collected from Eskişehir region. Some parts of genomic DNAs were amplified using OPA-03, OPA-04, OPA-05 and OPA-15 oligonucleotide primers by RAPD method. The DNA fragments were seperated by agarose gel electrophoresis, and these DNA bands were visualized by irradiating with a UV light source. Phylogenetic relation for these Salvia L. species were investigated. The results indicate that the furthest genetically species are S. fruticosa and S. dichroantha, while the most genetically similar species are S. bracteata and S. fruticosa.Dynamic coating method was developed using hydroxyethyl cellulose by capillary gel electrophoresis for DNA separation. An effective separation and reproducible results were obtained for 14 different size of standard DNA fragments by the method. DNA fragments selected from Salvia L. species were determined by capillary gel electrophoresis. The obtained results were also compared with those results by the agarose gel electrophoresis and they were consistent with each other.
Benzer Tezler
- Adli bilimlerde diş örneklerinde DNA teknolojisinin kullanımı
DNA technology in forensic science in the use of dental representative
NİLÜFER AKMAN DOĞAN
Doktora
Türkçe
2015
Adli Tıpİstanbul ÜniversitesiFen Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMEL HÜLYA YÜKSELOĞLU
- Sıçanlarda, radyoterapi sonrası kaldırılan toraks arkası fasyokutan fleplerin VSF(vaskuler stromal fraksiyon) ile yaşayabilirliğinin artırılması
Enhancement of flap viability in rat dorsal thoracic fasciocutaneous flaps after radiotheraphy by using vascular stromal fraction ( VSF)
SELÇUK YÜCE
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
Plastik ve Rekonstrüktif CerrahiPamukkale ÜniversitesiPlastik Rekonstrüktif ve Estetik Cerrahi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İNCİ GÖKALAN KARA
- Poliklinik hastalarının venöz ve kapiller kan örneklerindeki hematolojik parametrelerin karşılaştırılması
Başlık çevirisi yok
AYŞEN BAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
1994
HemşirelikAtatürk ÜniversitesiHemşirelik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET GÜNDOĞDU
- Preparation of reactive-polyacrylate capillary monoliths and their use as stationary media in hydrophilic interaction chromatography
Reakti̇f poli̇akri̇lat kapi̇ler monoli̇tleri̇n sentezi̇ ve hi̇drofi̇li̇k etki̇leşi̇m kromatografi̇si̇nde sabi̇t faz olarak kullanimi
SEDEF DAMLA ERKAKAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
Kimya MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SÜLEYMAN ALİ TUNCEL
- Diyabetik makula ödemi tedavisinde intravitreal ranibizumab vedeksametazon implant etkinliklerinin karşılaştırılması
The comparison of effectiveness of intravitreal ranibizumab and implant dexamethasone in diabetic macular edema treatment
ALPER GÜNEŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
Göz HastalıklarıGaziosmanpaşa ÜniversitesiGöz Hastalıkları Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SELİM DEMİR