Geri Dön

28S ve ITS2 primerlerinin bazı Sphecidae (Insecta: Hymenoptera) türlerinin moleküler sistematiğinde kullanılabilirliğinin test edilmesi

Testing the usage of 28S and ITS2 primers in molecular systematics of some Sphecidae (Insecta: Hymenoptera) species

PDF İndir

  1. Tez No: 338639
  2. Yazar: İLYAS CAN
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. YAŞAR GÜLMEZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Zooloji, Biology, Zoology
  6. Anahtar Kelimeler: Sphecidae, PCR, ITS2, 28S-D2 rDNA, Gen, Sekans, Sistematik, Sphecidae, PCR, ITS2, 28S-D2 rDNA, Gene, Sequence, Systematic
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gaziosmanpaşa Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 34

Özet

Ribozomal DNA gen bölgeleri, bazı böcek taksonların ayırımında morfolojik karakterlere ek olarak yaygın şekilde kullanılmaktadır. Bu çalışmada, 28S-D2 ve ITS2 gen bölgelerine ait primerlerin (TcITS2, TrITS2, TICKITS2, 28S-D2 rDNA), Sphecidae (Hymenoptera) familyasına ait Ammophila sabulosa, Ammophila heydeni, Prionyx kirbyi, Prionyx nudatus, Sphex flavipennis, Sphex funerarius, Sphex melanocnemis, Sphex pruinosus, Sceliphron spirifex türlerinin ayırt edilmesi ve teşhisinde kullanılabilirliği ilk kez test edilmiştir. Seçilen türlere ait örneklerden DNA izolasyonu yapılarak Polimer Zincir Reaksiyonu (PZR) yöntemiyle çoğaltılmış ve agaroz jel elektroforeziyle görüntülenmiştir. Prionyx kirbyi - Prionyx nudatus, Ammophila sabulosa - Ammophila heydeni ve Sphex melanocnemis - Sphex pruinosus, Sceliphron spirifex türlerinin DNA örneklerinden TcITS2 ve TrITS2 primerleri kullanılarak elde edilen PCR ürünleri, ayırt edici bantlar göstermiştir, bu yüzden TcITS2 ve TrITS2 primerlerinin türlerin birbirinden ayrılmasında ve teşhisinde kullanılabileceği görülmektedir. Buna karşın 28S-D2 rDNA ve TICKITS2 primerlerinin, ne DNA bantları ne de bunların DNA dizileri bakımından incelenen türlerin ayırt edilmesinde kullanışlı değildir. Sonuç olarak TcITS2 ve TrITS2 primerleri, çalışılan Sphecid türlerini teşhisinde kullanışlıdır, ancak diğer Sphecid türlerini ayırt etmek için farklı gen bölgelerini tarayabilen ilave primerlerin test edilmesine ihtiyaç bulunmaktadır.

Özet (Çeviri)

Ribosomal DNA gene regions are widely used to differentiate insect taxa in addition to morphologic characters. In this study, the usability of the primers (TcITS2, TrITS2, TICKITS2, 28S-D2 rDNA) belonging to 28S-D2 and ITS2 gene regions were tested to identify and differentiate species belonging to Sphecidae family, namely Ammophila sabulosa, Ammophila heydeni, Prionyx kirbyi, Prionyx nudatus, Sphex flavipennis, Sphex funerarius, Sphex melanocnemis, Sphex pruinosus, Sceliphron spirifex for the first time. DNA samples isolated from the selected species were amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR) and visualized by agarose gel electrophoresis. PCR products obtained from DNA samples of Prionyx kirbyi - Prionyx nudatus, Ammophila sabulosa - Ammophila heydeni and the Sphex melanocnemis - Sphex pruinosus species, Sceliphron spirifex displayed distinctive DNA bands indicating that these species could be differentiated and identified by using Tc ITS2 and Tr ITS2 primers. However, TICKITS2 and 28S-D2 rDNA primers were not useful to differentiate species examined, neither by means of DNA sequence nor the DNA bands. As a result, Tc ITS2 and Tr ITS2 primers were useful to identify sphecid species examined, however additional primers scanning different gene regions to differentiate the other sphecid wasp species, are needed to be tested.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    390818

    Avanos yöresi sokak köpeklerinde dirofilaria immitis'in PCR ile araştırılması

    Investigation of dirofilaria immitis in stray dogs by PCR technique in avanos province

    FERAY YABANERİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Veteriner HekimliğiErciyes Üniversitesi

    Parazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ABDULLAH İNCİ

  2. Tez No

    512063

    Sucul çevrelerden lignolitik enzim üretici mikroorganizmaların izolasyonu, tanılanması ve endüstriyel atıkların parçalanması için ortam optimizasyonu

    Isolation and identification of lignolytic enzymes producing microorganisms from aquatic environments and media optimization for biodegredation of industrial pollutants

    SULTAN KÜBRA TOKER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyolojiEge Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ALİ KOÇYİĞİT

  3. Tez No

    531960

    Küflü peynirlerden izole edilen küflerin moleküler tanımlanması ve karakterizasyonu

    Molecular identification and characterization of moulds isolated from mouldy cheeses

    HATİCE EBRAR KIRTIL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Gıda MühendisliğiYıldız Teknik Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUHAMMET ARICI

  4. Tez No

    889145

    Doğu Karadeniz Bölgesi yaprak lahana (Brassica oleracea var. Acephala) üretim alanlarındaki kist nematodları (Heterodera spp.)'nın tespiti ve bulaşıklık durumunun belirlenmesi

    Determination and distribution of cyst nematodes (Heterodera spp.) in kale (Brassica oleracea var. Acephala) production areas in eastern Black Sea Region of Türkiye

    BUĞRA GÜVERCİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    ZiraatOrdu Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FARUK AKYAZI

  5. Tez No

    390819

    Erciyes dağı akarsularında simulium türlerinin araştırılması ve moleküler klasifikasyonu

    Investigation and molecular clasification of simulium species in the streams of Erciyes mountain

    AHMET DEMİRCİOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Veteriner HekimliğiErciyes Üniversitesi

    Parazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ABDULLAH İNCİ

Geri Dön