Coronavirüs replikasyonunda TRPC gen ailesinin ifadesinin ve rolünün araştırılması
Expression of TRPC genes family on replication of coronavirus
- Tez No: 339448
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA ULAŞLI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Gen ifadesi, Korona virüs enfeksiyonları, Korona virüsler, Solunum sıkıntı sendromu, Gene expression, Coronavirus enfections, Coronaviridae, Respiratory distress syndrome
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Coronavirüsler (CoV) pozitif polariteli genomik RNA?ya sahiptirler ve belirli morfolojik özellik gösterirler. Coronavirüsler dünya çapında ölüme sebebiyet vermektedirler. 10 yıl önce SARS salgını olarak adlandırılan bir hastalık ortaya çıkmış ve hastalık etmeni SARS-CoV olarak tanımlanmıştır. SARS-CoVsekiz binden fazla vakaya sebep olmuş ve yüzlerce insanın ölümüne sebebiyet vermiştir. Çok daha yeni olarak şiddetli solunum yolu enfeksiyonlarına sebep olan ve ölüme sebebiyet veren orta doğu solunum yetmezliği sendromu coronavirüsü (MERS-CoV) tanımlanmıştır. MERS-CoV?ü için pandemi riski birçok bilim adamı tarafından bildirilmiştir. Geçici reseptör potansiyel kanonikal kanalları TRP süper ailesi kanallarının bir alt ailesidir. TRPC kanalları insanlarda, hücre çoğalması, hücre göçü, anjiogenez ve inflamasyon gibi birçok hücresel ve fizyolojik olayın gerçekleşmesinde rol oynar. Bu çalışmada geçici reseptör potansiyel kanonikal kanallarının coronavirüs enfeksiyonundaki rolü ileri teknoloji mRNA analizi ile ortaya konmuştur. Bu çalışmada, HeLa-CEACAM hücre hatları MHV-A59 coronavirüsüyle 6 ve 8 saatlik sürelerle enfekte edilmiştir. Enfeksiyon sonrasında hücrelerden total RNA izolasyonu yapılmıştır. mRNA analizleri için Fluidigm Real-Time-PCR sistemi kullanılmıştır. Bu çalışma sonucunda TRPC5 ve TRPC7genlerinin ifade seviyeleri anlamlı olarak artmış TRPC6?nın ifade seviyesi anlamlı olarak azalmıştır. Böylelikle bu genlerin coronavirüs enfeksiyonuyla ilişkisinin olabileceği ortaya konmuştur. Daha açıklayıcı olarak bu genlerin şiddetli coronavirüs enfeksiyonlarında rollerinin olabileceği düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Coronavirüsler (CoV) pozitif polariteli genomik RNA?ya sahiptirler ve belirli morfolojik özellik gösterirler. Coronavirüsler dünya çapında ölüme sebebiyet vermektedirler. 10 yıl önce SARS salgını olarak adlandırılan bir hastalık ortaya çıkmış ve hastalık etmeni SARS-CoV olarak tanımlanmıştır. SARS-CoVsekiz binden fazla vakaya sebep olmuş ve yüzlerce insanın ölümüne sebebiyet vermiştir. Çok daha yeni olarak şiddetli solunum yolu enfeksiyonlarına sebep olan ve ölüme sebebiyet veren orta doğu solunum yetmezliği sendromu coronavirüsü (MERS-CoV) tanımlanmıştır. MERS-CoV?ü için pandemi riski birçok bilim adamı tarafından bildirilmiştir. Geçici reseptör potansiyel kanonikal kanalları TRP süper ailesi kanallarının bir alt ailesidir. TRPC kanalları insanlarda, hücre çoğalması, hücre göçü, anjiogenez ve inflamasyon gibi birçok hücresel ve fizyolojik olayın gerçekleşmesinde rol oynar. Bu çalışmada geçici reseptör potansiyel kanonikal kanallarının coronavirüs enfeksiyonundaki rolü ileri teknoloji mRNA analizi ile ortaya konmuştur. Bu çalışmada, HeLa-CEACAM hücre hatları MHV-A59 coronavirüsüyle 6 ve 8 saatlik sürelerle enfekte edilmiştir. Enfeksiyon sonrasında hücrelerden total RNA izolasyonu yapılmıştır. mRNA analizleri için Fluidigm Real-Time-PCR sistemi kullanılmıştır. Bu çalışma sonucunda TRPC5 ve TRPC7genlerinin ifade seviyeleri anlamlı olarak artmış TRPC6?nın ifade seviyesi anlamlı olarak azalmıştır. Böylelikle bu genlerin coronavirüs enfeksiyonuyla ilişkisinin olabileceği ortaya konmuştur. Daha açıklayıcı olarak bu genlerin şiddetli coronavirüs enfeksiyonlarında rollerinin olabileceği düşünülmektedir.
Benzer Tezler
- Papatya (Matricaria chamomilla) özütlerinin TRPV gen ifadesi ve coronavirus replikasyonu üzerine etkisinin araştırılması
The effects of chamomile (Matricaria chamomilla) on TRPV gene family expression and coronavirus replication
DURAN KALA
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Tıbbi BiyolojiGaziantep ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA ULAŞLI
- Koronavirus replikasyonunda kaspaz 8'i hedefleyen mir-4778-5p ve mir-371b-5p'nin ifade seviyelerinin araştırılması
Investigation of expression levels of mir-371b-5p and mir-4778-5p targeting caspase-8 in coronavirus replication
AKHEENK MUSTAFA HASAN ZEWKİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
GenetikGaziantep ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA ULAŞLI
- Predicting novel small inhibitors of SARS-CoV-2: Targeting SARS-CoV-2 spike protein, human ACE2 protein and SARS-CoV-2 NsP16 via molecular docking
SARS-CoV-2 için yeni küçük inhibitör moleküllerin tahmini: Moleküler yanaştırma yöntemiyle SARS-CoV-2 spike proteini, insan ACE2 proteini ve SARS-CoV-2 NsP16 hedeflenmesi
ONUR ÖZER
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Biyomühendislikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DOÇ. DR. MERT GÜR
DR. ÖĞR. ÜYESİ SEFER BADAY
- Investigating allosteric modulators for pathogenic enzymes using molecular docking and molecular dynamics simulations
Patojenik enzimler ıçin allosterik modülatörlerin moleküler yerleştirme ve moleküler dinamik simülasyonları kullanılarak araştırılması
MERVE YÜCE
Doktora
İngilizce
2025
Kimya Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞE ÖZGE KÜRKÇÜOĞLU LEVİTAS
- Generation of plasmid-based eukaryotic model to investigate biology of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus nucleoprotein and glycoproteins
Kırım Kongo kanamalı ateşi virüsü nükleoproteinin ve glikoproteinlerinin biyolojisinin çalışılmasında plazmit temelli ökaryotik model oluşturulması
NESİBE SELMA ÇETİN
Doktora
İngilizce
2023
BiyoteknolojiBezm-İ Alem Vakıf ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. MEHMET ZİYA DOYMAZ