Koronavirus replikasyonunda kaspaz 8'i hedefleyen mir-4778-5p ve mir-371b-5p'nin ifade seviyelerinin araştırılması
Investigation of expression levels of mir-371b-5p and mir-4778-5p targeting caspase-8 in coronavirus replication
- Tez No: 379263
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA ULAŞLI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Apoptozis, Gen ifadesi, Genler, Kaspazlar, Korona virüsler, Mikro RNA, RNA virüsleri, Apoptosis, Gene expression, Genes, Caspases, Coronaviridae, Micro RNA, RNA viruses
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Giriş ve Amaç: Koronavirüsler insanlarda ve çeşitli hayvanlarda önemli enfeksiyonlara neden olan pozitif zincirli RNA virüsleridir. Koronavirüslerin hücre kültürü ortamında replikasyon ve transkripsiyon mekanizmalarının ayrıntılı olarak anlaşılabilmesi icin fare hepatit virüs (MHV) model sistem olarak kullanılmaktadır. Yapılan çalışmalar Koronavirüs enfeksiyonlarının çeşitli hücre hatlarında programlı hücre ölümünü ciddi oranda artırdığını göstermektedir. MikroRNA'lar protein çevrimini baskılayan yada hedef mRNA'yı yıkarak gen ifadesini düzenleyen küçük kodlanmayan RNA'lardır. miRNA'lar hücre çoğalması, hücresel farklılaşma ve programlı hücre ölümünü de içeren birçok hücresel süreçte önemli roller vardır. Bu tez çalışmasında programlı hücre ölümünü başlatıcı bir protein olan kaspaz 8 ve kaspaz-8'i hedefleyen hsa-miR-4778-5p ve hsa-miR-371b-5p'in koronavirüs enfeksiyonu sonrasında ifade seviyeleri araştırılmıştır. Gereç ve yöntem: HeLa-CEACAM1ahücreleri fare hepatit virüsü MHV-A59 ile enfekte edilmiştir. Koronavirüs ile enfekte edilen HeLa-CEACAM1ahücreleri 3, 6, 12 ve 24 saat inkübasyona bırakılmıştır. HeLa-CEACAM1ahücrelerinden total RNA elde edilerek hsa-miR-4778-5p ve hsa-miR-371b-5p'in ifade seviyeleri BioMark HD Real-Time PCR system kullanılarak tespit edilmiştir. Ayrıca kaspaz-8'in gen ifade seviyesi de RT-PCR yöntemi ile çalışılmıştır. Sonuçlar: Koronavirüs enfeksiyonu sonrasında kaspaz-8 mRNA ifade seviyesi anlamlı şekilde arttığı tespit edilmiştir. Kaspaz-8'i hedefleyen miRNA olan hsa-miR-4778-5p ve hsa-miR-371b-5p'in de koronavirüs enfeksiyonu sonrasında arttığı belirlenmiştir. Tartışma: Koronavirüs enfeksiyonu ile programlı hücre ölümünün tetiklenmesi sonucu kaspaz-8'in anlamlı şekilde arttığı tespit edilmiştir. Ayrıca elde edilen sonuçlar hsa-miR-4778-5p ve hsa-miR-371b-5p'in kaspaz-8'i düzenleyebileceğini göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Giriş ve Amaç: Koronavirüsler insanlarda ve çeşitli hayvanlarda önemli enfeksiyonlara neden olan pozitif zincirli RNA virüsleridir. Koronavirüslerin hücre kültürü ortamında replikasyon ve transkripsiyon mekanizmalarının ayrıntılı olarak anlaşılabilmesi icin fare hepatit virüs (MHV) model sistem olarak kullanılmaktadır. Yapılan çalışmalar Koronavirüs enfeksiyonlarının çeşitli hücre hatlarında programlı hücre ölümünü ciddi oranda artırdığını göstermektedir. MikroRNA'lar protein çevrimini baskılayan yada hedef mRNA'yı yıkarak gen ifadesini düzenleyen küçük kodlanmayan RNA'lardır. miRNA'lar hücre çoğalması, hücresel farklılaşma ve programlı hücre ölümünü de içeren birçok hücresel süreçte önemli roller vardır. Bu tez çalışmasında programlı hücre ölümünü başlatıcı bir protein olan kaspaz 8 ve kaspaz-8'i hedefleyen hsa-miR-4778-5p ve hsa-miR-371b-5p'in koronavirüs enfeksiyonu sonrasında ifade seviyeleri araştırılmıştır. Gereç ve yöntem: HeLa-CEACAM1ahücreleri fare hepatit virüsü MHV-A59 ile enfekte edilmiştir. Koronavirüs ile enfekte edilen HeLa-CEACAM1ahücreleri 3, 6, 12 ve 24 saat inkübasyona bırakılmıştır. HeLa-CEACAM1ahücrelerinden total RNA elde edilerek hsa-miR-4778-5p ve hsa-miR-371b-5p'in ifade seviyeleri BioMark HD Real-Time PCR system kullanılarak tespit edilmiştir. Ayrıca kaspaz-8'in gen ifade seviyesi de RT-PCR yöntemi ile çalışılmıştır. Sonuçlar: Koronavirüs enfeksiyonu sonrasında kaspaz-8 mRNA ifade seviyesi anlamlı şekilde arttığı tespit edilmiştir. Kaspaz-8'i hedefleyen miRNA olan hsa-miR-4778-5p ve hsa-miR-371b-5p'in de koronavirüs enfeksiyonu sonrasında arttığı belirlenmiştir. Tartışma: Koronavirüs enfeksiyonu ile programlı hücre ölümünün tetiklenmesi sonucu kaspaz-8'in anlamlı şekilde arttığı tespit edilmiştir. Ayrıca elde edilen sonuçlar hsa-miR-4778-5p ve hsa-miR-371b-5p'in kaspaz-8'i düzenleyebileceğini göstermektedir.
Benzer Tezler
- Gebe ineklerde uygulanan aşıların kolostrum ve buzağıda IgG konsantrasyonu üzerine etkileri
Effectiveness of vaccination on colostrum and calf blood serum IgG concentrations in pregnant cows
ÖRSAN GÜNGÖR
Doktora
Türkçe
2003
Veteriner HekimliğiAnkara ÜniversitesiVeterinerlik Doğum ve Jinekolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYHAN BAŞTAN
- Buzağılarda enterik bovine coronavirus enfeksiyonlarının araştırılması ve epidemiyolojide klinik olarak sağlıklı sığırların rolü
Investigation of enteric bovine coronavirus infections in calves and the role of clinically healthy cattle in epidemiology of coronavirus infections
SİBEL HASIRCIOĞLU
- Yeni bir infeksiyöz bronşitis virusu olan 4/91 (793B)'in Ege bölgesinde varlığının ortaya konulması
Determination of presence of a new infectious bronchitis virus 4/91(793B) in Aegean Region
MURAT ÇELEBİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
MikrobiyolojiAdnan Menderes ÜniversitesiVeterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SERAP SAVAŞAN
- Akut solunum yolu infeksiyonlarında Human Coronavirus insidansı
The incidence of Human Coronaviruses in acute respiratory tract infections
FADİME GÜL
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMEL BOZKAYA
- Neonatal kuzu morbidite ve mortalitelerinin klinik sebepleri ve muhtemel risk faktörlerinin belirlenmesi
Neonatal lamb morbidity and mortality, their clinical causes and associated likely risk factors
ERHAN GÖKÇE
Doktora
Türkçe
2007
Veteriner HekimliğiKafkas ÜniversitesiVeterinerlik İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. HİDAYET METİN ERDOĞAN