Geri Dön

Nalidiksik asit ve uv ışığı uygulamasının escherichia coli K12 şuşlarında DNA onarımı ve rekombinasyona etkileri

Effects of UV light and nolidixic acid treatment and DNA repair and rocambination on escherichia coli K12 strains

  1. Tez No: 34224
  2. Yazar: SÜHEYLA İNAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ALİ KALAYCIOĞLU
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Tıbbi Biyoloji, Biology, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 1994
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 123

Özet

IV ÖZET Bu çalışmada atasal E. coli K12 susundan türemiş bazı E. coli K12 mutantları (KL386recA, AB2470recB21), KL398mutS, 2110mutH mutatorları ve bunların yaban tiplerinin (HfrCavalli, KL14, KL398) DNA onarımı, rekombinasyona et kileri karşılaştırıldı. Escherichia coli recA gen ürünü, RecA proteini olarak ad- landırılır.İn vitro şartlar altında yapılan çalışmalardan elde edilen verilere göre, RecA proteinin ATP varlığında DNA'nın tek iplikçiğine bağlandığı ve homolog eşleşmeyi (sinapsis) yürüttüğü bilinmektedir. RecA proteinin genetik rekombinas- yonda esaslı rol oynadığı belirtilmektedir. Genel rekombi- nasyon mekanizması için gerekli olan recA+ genotipi ve bunun mutantı recA“ ile yapılan konjugasyon deneyleri sonu cunda, (HfrxF”) recA“ genotipinde, rekombinasyon veriminin yok denecek düzeyde gerçekleştiği gözlendi. recB”mutant- larında rekombinasyon veriminin yok olmadığı, ancak yaban tipi recB+ genotipine nazaran 100 kat azaldığı tespit edildi. UV ışını ile yapılan deneylerde; recB“ genotipinin UV'ye, ya ban tipi recB+ genotipine göre daha hassas olduğu, ancak recB”genotipinin konjugasyonla recB+ genotipini tekrar ka zandığında UV'yi karşı dayanıklılığının yaban tip düzeyine e- riştiği gözlendi. Konjugasyonla elde edilen rekombinant tipleri gen bağlılığı (linkage) yönünden incelendiğinde, E. coli K12 gen haritasına uygunluk gösterdi. Çalışmanın özgün yanı ise, E. coli K12 suşlarında nalidiksik asit mutasyonu gyrA (nalA) yaratıldığında, bunun rekombi nasyon, DNA onarımı ve mutasyon mekanizmalarını nasıl et kileyeceği idi. Bilindiği gibi E. coli giraz (gyrase) enzimi 400 K. dal tetram- er yapısında olup gyrA (nalA) ve gryB (nalB) genlerinin ürü-nüdür. Nalidiksik asit gyrA geni aktivitesini inhibe eden bir madde olduğundan nalidiksik asite rezistan olan suşlar da, nalidiksik asit varlığında giraz enziminin de inhibe olduğu düşünülür. UV ışını DNA da timin dimerleri oluşturarak mu- tajenik etki gösterir. Giraz enzim aktivitesi nalidiksik asit tarafından inhibe edildiğinden E. coli K12 suşlarının farklı UV ışını dozlarından sonra canlı hücre sayılarında hızlı dü şüş oldu. Zaten giraz enzimi replikasyon transkripsiyon, re- kombinasyon ve DNA onarımında görev yapar. Nitekim gyrA mutasyonu taşıyan suşlar atasal yaban tipleriyle karşılaştı rıldığında rekombinasyon verimi, DNA onarımı ve mutasyon sıklığında daha düşük değerler verdiler. Bu sonuçlar giraz enzimin inhibisyonuna bağlandı.

Özet (Çeviri)

Vi ABSTRACT In this study derivative of some of the E. coli K12 recombi nation mutans (KL386recA, AB2470recB21, KL398mutS, 2110mutH) and their wild types has been compared for their effects on recombination and DNA repair. The product of recA+ gene of Escherichia coli is called RecA protein. According to the results of experiment done under in vitro conditions, it is known that recA protein is bound to the single strand DNA and it promotes homologous pairing (synapsis) in the presence of ATP. It was proposed that recA protein plays an essential role in genetic recombination. As the result of conjugation experiments done with recA+ gene- type, necessary for general recombination and its mutant recA“, it was observed that the productivity of the recombi nation of the (HfrxF”) recA“ genotype was formed at a very low level. It was seen that in the recB”mutants, the produc tivity of the recombination was not disappear, but it was 100 fold decreased with respect to wild type recB+. Experi ments done by the use of UV light show that recB“ genotype was more sensitive to UV light than wild genotype recB+, however when recB”genotype was converted to recB+ geno type by conjugation it was observed that its resistance to UV light reached to that of wild type. Recombinants obtained after conjugation showed convenien ce with the map of E. coli K12 gene in terms of gene linkage. The aim of this research is to show how the recombination and mutational mechanisms will be effected when nalidixic acid mutation, gyrA ( nalA), is introduced into E. coli K12 strains. As it known that E. coli gyrase appears to be a 400 K. dal tetramer of gyrA (nalA) and gryB (nalB) gene products. Since the gyrase A activitiy is inhibited by nalidixic acid,Vii Since the gyrase A activitiy is inhibited by nalidixic acid, one woud expect that a strain resistant to nalidixic acid has also no gryase activitiy. UV-light shows mutagenic effects by forming thymine dimers in DNA. As gyrase enzyme activi tiy was inhibated by nalidixic acid it was seen that rapid decreases occurs in the amount of the living cells of the E. coli K12 strains with respect to different UV-light dozes. Gyrease is involved in DNA replication.transcription, recom bination and DNA repair. In fact when the strains which carry gryA mutation are compared with wild type, they all gave low values in recombination prouctivity, DNA repair and mutation frequency. These results are explained by grase inhibition.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    19060

    Nalidiksik asit-avicel öğütülmüş karışımları ve kapsüllerinde çözünme hızı araştırılmaları

    Başlık çevirisi yok

    ZEYNEP İLHAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1991

    Eczacılık ve FarmakolojiMarmara Üniversitesi

    DOÇ.DR. BETÜL DORTUNÇ

  2. Tez No

    826657

    Olası Pseudonocardia izolatının tüm genom sekansı ve karakterizasyonu

    Whole genome sequencing and characterization of putative Pseudonocardia isolate

    KEVSER SANHUEZA GÜREŞEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyolojiGebze Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK

  3. Tez No

    507274

    Anne sütünde izole edilen laktik asit bakterilerinin 16S rRNA dizi analizi ile tanımlanması, antibiyotik dirençlilik ve antibakteriyal aktivitelerinin belirlenmesi

    The identification of lactic acid bacteria isolated in mother's milk with 16S rRNA sequence analysis and determination of antibiotic resistance and antibacterial activities

    MEHMET SÖNMEZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    MikrobiyolojiMuş Alparslan Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ YUSUF ALAN

  4. Tez No

    390352

    Tavuk yumurtasında kinolon grubu antibiyotik kalıntılarının araştırılması

    Investigation of quinolone antibiotic residues in chicken eggs

    MEHMET ALİ AYDIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Besin Hijyeni ve TeknolojisiEge Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FERAH SAYIM ÖZKAN

  5. Tez No

    194978

    Sağlıklı çocuklarda dışkıda kinolon dirençli Escherichia coli taşıyıcılığının ve direnç mekanizmalarının saptanması

    Detection of quinolone resistant escherichia coli carriage and resistance mechanisms in the fecal flora of healthy children

    ÖZLEM GÜVEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MUSTAFA SAMASTI

Geri Dön