Geri Dön

Characterization of three partially conserved amino acid mutations in CBB3-type oxidase enzyme of rhodobacter capsulatus

Rhodobacter capsulatus ın CBB3-tipi sitokrom oksidaz enzimininde kısmi olarak korunmuş üç aminoasit mutasyonunun karakterizasyonu

PDF İndir

  1. Tez No: 342506
  2. Yazar: GULGEZ GOKCE YILDIZ
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MEHMET ÖZTÜRK
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Abant İzzet Baysal Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Bölümü
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 210

Özet

Demir-Bakır Oksijen (DBO) redüktazlar oksijeni suya indirgemekten ve ATP sentezi için kullanılacak olan elektrokimyasal farkı yaratmaktan sorumludurlar. cbb3-tipi oksidazlar, DBO ailesinin en farklı üyeleri olup, düşük oksijen konsantrasyonunda yüksek aktivite gösterme ve düşük proton pompalama özellikleri ile karakterize olurlar. Süper aile içerisinde yapılan sekans karşılaştırmaları ve korunmuş aminoasitler üzerine yapılan mutasyon çalışmaları cbb3-tipi oksidazların, süper ailenin diğer üyeleri ile bazı ortak özelliklere sahip olduğunu göstermiştir ancak bu enzimin çalışma mekanizması halen çok iyi bilinmemektedir. Bu çalışmada, oldukça çeşitlilik gösteren C-tipi oksijen redüktaz ailesinin çalışma mekanizmasını, yapısını ve çeşitliğini incelemek amacıyla, bu aileye özgü kısmi olarak korunmuş olan üç aminoasit, asparajin 265, tirozin 420 ve fenilalanin 480 yönlendirilmiş mutagenez yöntemi ile sırasıyla valin, fenilalanin ve alanin?e dönüştürülmüştür. Rhodobacter capsulatus?aaitcbb3-tipi oksidazmutantları enzim aktivitesi, yapısı ve proton pompalama sitokiyometri özelliği bakımından incelenerek karakterizasyonları yapılmıştır. N265 ve Y420 pozisyonundaki mutasyonların enzim aktivitesine ve yapısına etki ettiği, F480 mutasyonunun ise proton translokasyonu üzerinde etkisi olduğu bulunmuştur. Araştırma sonuçları kısmi olarak korunmuş olan aminoasitlerinde cbb3- tipi oksidaz enzimi üzerinde yapı ve/veya fonksiyonel olarak önemli yere sahip olduğunu göstermiştir.

Özet (Çeviri)

Heme-Copper Oxygen reductases are responsible for catalyzing the reduction of oxygen to water and generate an electrochemical gradient, which is used for ATP synthesis. cbb3-type oxidases are the most distinct members of the HCOs which are characterized by high catalytic activity at low oxygen concentrations and reduced proton pumping. Analyses on genomic sequences for C-type oxygen reductase family and mutagenesis studies on conserved residues showed that each of these conserved residues has a critical role in structure and/or function of the enzyme. In this study, three partially conserved residues Aspargine 265, Tyrosine 420 and Phenylalanine 480, which are unique to C-type oxygen reductase family, were substituted to Valine, Phenylalanine and Alanine respectively by site directed mutagenesisfor the investigation ofthe diversity, mechanism and structure of this highly diverse family. Characterization of the mutants from Rhodobacter capsulatuswas done with respect to their effects on activity, assembly and proton pumping stoichiometry.Mutations at the position of N265 and Y420 showed that, they have critical role on the enzyme activity and assembly while F480 has role in function,proton translocation.Findings support the assumption that partially conserved residues may also have important role in the structure and/or function of thecbb3-type oxidases.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    547620

    Mucize buğdayda (Triticum turgidum var. mirabile) başak ve çiçek meristem kimlik genlerinin klonlanması ve karakterizasyonu

    Cloning and characterization of spike and floral meristem identity genes in miracle wheat (Triticum turgidum var. mirabile)

    DAMLA GÜVERCİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyolojiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YAŞAR KARAKURT

  2. Tez No

    439561

    Isolation and characterization of genomic and cDNA sequences encoding the laccase CpLcc2 from Coriolopsis polyzona MUCL 38443

    Coriolopsis polyzona MUCL 38443 suşundaki CpLcc2 lakkazını kodlayan genomik ve cDNA dizilerinin izolasyonu ve karakterizasyonu

    DİCLE MALAYMAR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYTEN KARATAŞ

  3. Tez No

    83737

    Molecular cloning and characterization of the common 1b subtype of HCV from Turkey

    Türkiye'de baskın olarak görünen hepatit C virüsü 1b alt tipinin moleküler klonlanması ve karakterizasyonu

    ASLI ÖZTAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK

  4. Tez No

    434745

    Tomato chlorosis virus (ToCV) izolatlarının örtü protein gen bölgesinin moleküler olarak belirlenmesi

    Molecular analysis of coat protein region of Tomato chlorosis virus isolates

    SALİSU SULLEY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    ZiraatAnkara Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    Prof. Dr. İBRAHİM ÖZER ELİBÜYÜK

  5. Tez No

    650568

    Tomato spotted wilt virus biber izolatlarının popülasyon çeşitliliği ve biber genotiplerinin reassortant izolatlara tepkisi

    Population structure of Tomato spotted wilt virus and resistance response of pepper genotypes to reassortant isolates

    SELİN CEREN BALSAK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    ZiraatKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NİHAL BUZKAN

Geri Dön