Theoretical modeling of derivatives of RGD
RGD türevlerinin teorik olarak modellenmesi
- Tez No: 342756
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. SEDAT COŞGUN, DOÇ. DR. LEVENT SARI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Fatih Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu yüksek lisans tez çalı?masında, arjinin-glisin-aspartik asit (RGD) sekansının ester ve amit türevlerinin teorik olarak modellenmesi çalı?ıldı. ?laç ta?ıma sisteminde önemli role sahip olan RGD küçük bir tripeptit sekansıdır. Bu sekans ?5ß1 integrin protein ile spesifik olarak bağlanır. Son yıllarda, bu transmembran proteinini hedefleyen anti-kanser ilaç molekülü geli?tirmek için birçok RGD temelli ilaç ta?ıma sistemi ara?tırılmaktadır. Sürfaktan molekülünün kümelenme parametresi (P) değeri, sonuç multimoleküler kümelenmeyi kontrol ettiğinden dolayı kümelenme parametresinin teorik olarak molekülü sentezlemeden önce çalı?ılması yararlı olur. Bu çalı?mada DFT ve HF metoduyla hesaplanmı? kümelenme parametresi hidrofobik zincir uzunluğuna bağlı olarak kar?ıla?tırıldı, ilaveten P değeri hidrofobik kuyruk ve hidrofilik ba? grup arasındaki bağ türüne bağlı olarak hesaplandı.
Özet (Çeviri)
In this master thesis, theoretical modeling of amide and ester derivatives of arginine-glycine-aspartic acid (RGD) sequence has been studied. RGD is a small tripeptide sequence which has important role at drug delivery systems. This sequence specifically binds to ?5ß1 integrin proteins. In recent years, many RGD based drug delivery systems have been investigated for the development of the anti-cancer drug molecules that target these transmembrane proteins. The Packing Parameter (P) values of the surfactant control the resulting multimolecular aggregates, and therefore it will be useful to calculate the packing parameter theoretically before the synthesis of molecules. In this study packing parameters calculated by DFT and HF methods were compared in terms of the length of the hydrophobic chains and also the bond type between hydrophobic tail and hydrophilic head group.
Benzer Tezler
- Constitutive modeling and experimental identification of material parameters of viscoelastic materials by variable order non-integer derivatives
Viskoelastik malzemelerin değişken-tam sayı olmayan türevleri ile kuramsal modellenmesi ve deneysel olarak malzeme parametrelerinin belirlenmesi
MUHAMMED ÇAKIR
Doktora
İngilizce
2025
Makine MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ERGİN TÖNÜK
PROF. DR. HAMDULLAH YÜCEL
- Teorik moleküler modelleme ve deneysel FT-IR ve raman spektroskopisi teknikleri ile tarihi eserlerin incelenmesi
Investigation of historical artifacts with theoretical molecular modeling and experimental FT-IR and raman spectroscopy techniques
ALİYE DEMET DEMİRAĞ
Doktora
Türkçe
2022
Fizik ve Fizik Mühendisliğiİstanbul ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞEN ÖZEL
PROF. DR. SEVİM AKYÜZ
- Constitutive and numerical modeling of hydro-mechanically coupled behavior of unsaturated soils
Doygun olmayan zeminlerin hidro-mekanik bağlaşık davranışının bünyesel ve sayısal modellenmesi
MUSTAFA MERT EYÜPGİLLER
Doktora
İngilizce
2025
İnşaat Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiDeprem Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET BARIŞ CAN ÜLKER
- Two essays in modeling and analysis of exchange rate dynamics
Döviz kuru modellemesi ve analizi üzerine çalışma
CANER ERATAMAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2011
Endüstri ve Endüstri MühendisliğiBoğaziçi ÜniversitesiEndüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. REFİK GÜLLÜ
- A microstructural approach to intraday analysis of Turkish derivatives market
Türk türev piyasasının gün içi analizinde mikro yapısal yaklaşım
BERNA AYDOĞAN