Shewanella putrefaciens bakterisinden alpha,ß-hydrolase geninin klonlanması ve lipaz aktivitesinin araştırılması
Molecular cloning, expression and purification of alpha,ß-hydrolase gene for lipase activity from Shewanella putrefaciens
- Tez No: 342784
- Danışmanlar: DOÇ. DR. FAHRİ AKBAŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Shewanella putrefaciens, lipaz, klonlama, genin ifade edilmesi, Shewanella putrefaciens, lipase, cloning, gene expression
- Yıl: 2013
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Fatih Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Shewanella putrefaciens topraktan ve denizden izole edilebilen, lipaz aktivitesi içeren gram negatif bir bakteridir. Metabolik olarak manganez kullanırlar ve demiri indirgeyebilen fakültatif anerobtur. Hem katı hem de sıvı ortamda parlak pembe renkleriyle ayrılırlar. Ortam koşullarının değişmesine çok dayanıklı bir mikroorganizmadır. Lipazların mantar ve gelişmiş bitkilerin yani sıra çoğu bakteri türünde de yaygın olarak bulunduğu, homolojik olarak yapılan protein bilgi bankası ve bakteri genom araştırmaları ile tespit edilmiştir. Lipaz geni hem fungal sistemlerden hem de çeşitli bakterilerden klonlanıp fonksiyonel analizleri yapılmıştır. Bu çalışmada, daha önce lipaz geninin varlığı bilinen ancak karakterizasyonu yapılmamış olan S. putrefaciens ATCC 8071 seçildi. S. putrefaciens'teki lipaz geni indüklenebilir bir ekspresyon vektörüne klonlandı ve E.coli bakterisine aktarıldı. Aynı zamanda, lipaz enzimi saflaştırılarak karakterizasyonu yapıldı.
Özet (Çeviri)
Shewanella putrefaciens is a gram negative bacterium. S.putrefaciens is also a facultative anaerobe with the ability to reduce iron and manganese as the terminal electron acceptor in the electron transport chain in both solid and liquid media. S.putrefaciens is also recognized by its bright pink colour. They are resistant to changeable environmental conditions. Lipases are also found to be widespread among bacteria, based on homology searches in protein databases and bacterial genomes. Lipase genes have been cloned from fungi and bacteria and then have been searched enzyme activity. In this study, we preferred S. putrefaciens ATCC 8071 because its lipase enzyme was not characterized before. Lipase genes in Shewanella putrefaciens were transferred into E. coli with molecular cloning techniques. Also, lipase enzyme was purified and characterized.
Benzer Tezler
- Moleculer cloning, expression and purification of laccase enzyme from Shewanella putrefaciens
Shewanella putrafaciens? den lakkaz enziminin moleküler klonlanması, genin ifade edilmesi ve saflaştırılıması
ZEYNEP AYDIN
Yüksek Lisans
İngilizce
2012
BiyoteknolojiFatih ÜniversitesiGenetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. FAHRİ AKBAŞ
- Mezgit balıklarında shewanella putrefaciens'in bozulma üzerine etkisi
The spoilage effect of shewanella putrefaciens in whiting fishes
ÖZGÜR ÇADIRCI
Doktora
Türkçe
2003
Besin Hijyeni ve TeknolojisiAnkara ÜniversitesiBesin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞERİF KAYMAZ
- Molecular and microbiological investigations of the metal reducing bacteria Shewanella putrefaciens
Metal indirgeyen bakteriler grubuna dahil olan Shewanella putrefaciens üzerinde moleküler ve mikrobiyolojik araştırmalar
CEMİLE ÜMRAN CEYLAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2009
BiyoteknolojiFatih ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FAHRETTİN GÜCİN
YRD. DOÇ. DR. FAHRİ AKBAŞ
- Effects of antibiotics and hormones on electricity generation using microbial fuel cells
Mikrobiyal yakıt hücrelerinde kullanılan antibiyotik ve hormonların elektrik üretimi üzerine etkileri
SEVİL AKTAN
Doktora
İngilizce
2011
Çevre Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMİNE UBAY ÇOKGÖR
PROF. DR. FAHRETTİN GÜCİN
- Antimicrobial, antioxidant properties and chemical composition of some spices/herbs
Bazı baharat/bitkilerin antimikrobiyal, antioksidan özellikleri ve kimyasal bileşimleri
HATİCE YAVUZDURMAZ
Doktora
İngilizce
2013
Gıda Mühendisliğiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. AYŞE HANDAN BAYSAL