Rfamid nöropeptidlerinin teorik konformasyon analizi
Başlık çevirisi mevcut değil.
- Tez No: 35136
- Danışmanlar: DOÇ.DR. YUSUF ŞAHİN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 1994
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Atatürk Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 128
Özet
Glu - Giy - Arg - Phe - NH2, Glu - Leu - Leu - Giy - Giy - Arg - Phe - NH2 ve Glu - Trp - Leu - Lys - Giy - Arg - Phe - NH2 moleküllerinin konfor- masyon analizleri molekülün mekanik modeli gözönüne alınarak atom-atom potansiyellerinin yardımı ile yapılmıştır.Toplam enerji Van der Vals, elektrostatik, dönme ve hidrojen bağı enerjilerinin toplamı şeklinde belirlendi. Van der Vals karşılıklı etkileşme enerjisi hesaplanırken Lenard-Cons potansiyelinin polipep tidier için parametreleştirilmiş ifadesinden yararlanıldı. Elektrostatik karşılıklı tesir enerjisi, monopol yaklaşımda atomların kısmi yükünün CNDO/2 kuantum mekanik yöntemle bulunmuş değerleri gözönüne alınmak suretiyle, dielektrik katsayısı polar ortam için belirlenerek hesaplandı. Dönme enerjileri deneysel sonuçlardan bulunan parametrelerin kullanılmasıyla hesaplandı. Hidrojen bağı enerjisi Morse potansiyel ifadesi kullanılarak hesaplandı, enerjinin minimumu“koşma gradiyentler metodu”ile bu lundu. Bu çalışma yapılırken önce ip ve t]} için herbir monopeptidin enerji haritası çizildi. Bu haritanın çiziminde -180° ile 180° aralığında 20° lik adımlar kullanıldı. Bu enerji haritalarında en düşük enerjili durumlar en iyi seçenekler olarak tesbit edildi. Bu en iyi seçeneklerden monopeptidler için konformasyon imkanları incelendi ve sonuçlar dipeptidlerin incelenmesinde kullanıldı. Glu - Giy - Arg - Phe - N H 2 nöropeptid molekülünün Glu1 - Giy2 ve Arg3 - Phe4 - NH2 dipeptidleri ayrı ayrı incelendi. Bunların en düşük enerjili durumları tesbit edilerek molekülün tamamının konformasyonunda kullanıldı. Monopeptidlerin konformasyon imkanlarının incelenmesinden elde edilen düşük enerjili durumlar Glu1 - Leu2 ve Glu1 - Trp2 dipeptidlerin incelenmesinde kullanıldı. Dipeptidlerin hesaplanan sonuçlarından yararlanılarak Glu1 - Leu2 - Leu3 ve Glu1 - Trp2 - Leu3 tripeptidleri incelendi. Tripeptidlerin düşük enerjili durumlarından yararlanılarak Glu1 - Leu2 - Leu3 - Giy4 ve Glu1 - Trp2 - Leu3 - Lys4 tetrapepti- dlerin konformasyon imkanları irdelendi. Daha Sonra, Glu1 - Leu2 - Leu3 - Giy4 - Gly5-Arg&-Phe7-NH2yeGlu1-Trp2-Leu3-Lys4-Gly5-Arg6-Phe7-NH2 nöropeptid moleküllerinin tamamının uzay yapısı, adı geçen tetrapeptidlerin heri- kisi de Arg6 - Phe7 - NH2 dipeptidine Giy5 monopeptidi yardımıyla bağlanarak mümkün olan tüm variantların enerjilerinin minimizasyonu sonucu bulundu.
Özet (Çeviri)
Conformation analysis of Glu - Gly - Arg - Phe - NH
Benzer Tezler
- Sıçanlarda rfamid ilişkili peptit-3'ün davranış üzerinde nörogenez aracılı olası etkisinin araştırılması
Investigation of the possible neurogenesis-mediated effect of rfamide related peptide-3 on behaviour in rats
YASEMİN BÖYÜKÇAM
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
FizyolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiFizyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SELİM KUTLU
- İmmortalize rHypoE-7 hücrelerinde RFRP-3 salgılanmasının leptin tarafından kontrolü üzerine in vitro çalışmalar
In vitro studies on secretion of RFRP-3 controlling by leptin in immortalize rHypoE-7 neurons
TUĞRUL SAATÇI
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
FizyolojiFırat ÜniversitesiFizyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALUK KELEŞTİMUR
- Puberte ve üremenin nöroendokrin kontrolünde kisspeptin, RFRP-3 ve Nesfatin-1'in etkileşimi üzerine deneysel araştırmalar
Experimental studies on interaction between kisspeptin, RFRP-3- and, Nesfatin-1 in neuroendocrine regulation of the puberty and reproduction
ZAFER ŞAHİN
- Sıçan duyusal sinir hücrelerinde kisspeptinin hücre içi kalsiyum sinyalleşmesi üzerine etkisi
Kisspeptin leads to calcium signaling in cultured rat dorsal root ganglion neurons
FERAH BULUT