Geri Dön

Mir-96 ifadesinin otofaji üzerinde etkisinin meme kanseri hücre hatlarında araştırılması

Investigation of the effect of mir-96 expression on autophagy in breast cancer cell lines

PDF İndir

  1. Tez No: 359615
  2. Yazar: SEVİL KIRKBEŞ
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA ULAŞLI
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: MiR-96, otofaji, meme kanseri hücre hatları, trastuzumab, everolimus, Mir-96, autophagy, breast cancer cell lines, trastuzumab, everolimus
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 86

Özet

Kanser hücrelerinde mikroRNA'ların (miRNA) ifade seviyelerindeki farklılıklar kanser araştırmacıları için ciddi bir araştırma konusu olmuştur. Tüm kanserlerde olduğu gibi meme kanserinde de kanserleşmeyi teşvik eden veya kanserinin oluşmasını baskılayan miRNA'lar bulunmaktadır ve her geçen gün bunlara yenileri eklenmektedir. miRNA'ların günümüzde meme kanserinin teşhisi, tedavisi, ilerleyişi ve kanserin ilaca verdiği cevap konusunda kullanılabileceği düşünülmektedir. miR-96 meme kanserinde kanserin seyrinin kötüleşmesine sebep olduğu bulunmuştur. Meme kanserinde otofaji yolağının rolünün aydınlatılması kanserin tedavisinde ve ilaçların etkileşimlerinde büyük önem arz etmektedir. Her2 pozitif meme kanserinde trastuzumab ilacı sıklıkla kullanılmaktadır fakat bu ilaç çok fazla etkin değildir. Ayrıca özellikle üçlü negatif meme kanserinde de etkin bir ilaç henüz bulunamamıştır. Everolimus ilacı da mTOR baskılayıcı, dolayısıyla otofaji yolağını uyarıcı rolü olan bir ilaçtır ve meme kanserinde faz çalışmaları yapılmaktadır. Bu çalışmada meme hücre hatlarında miR-96 ifadesi ve miR-96'nın tahmini olarak hedeflediği otofaji ile ilişkilendirilen ATG16L1, ATG9A, ATG7, CTSB, TP73 genlerinin gen ifade seviyeleri ilaç verilmeden, trastuzumab ve everolimus ilaçları ayrı ayrı ve birlikte verilerek araştırılmıştır. miR-96 RT-PCR, ATG16L1, ATG9A, ATG7, CTSB, TP73 genleri fluidigm cihazı ile qRT-PCR yöntemi kullanılarak ifade seviyelerine bakılmıştır. Yapılan gen ifade analizlerinde miR-96'nın normal epitelyum hücre hattına göre MCF-7 ve SKBR-3 meme kanseri hücre hatlarında anlamlı bir artış saptanmıştır. MiR-96'nın tahmini hedeflediği genlerde normal epitelyum hücre hattına göre: SKBR-3'te ATG16L1, ATG9A, ATG7 genlerinde düşüş; CTSB geninde her iki hücre hattında da düşüş; TP73 geninde ise sadece MCF-7'de aşırı bir artış anlamlı olarak gözlemlenmiştir. Everolimus ilacı verildiğinde MiR-96'da bütün hücre hatlarında anlamlı bir artış saptanmış; everolimus ve trastuzumab ilaçlarının her ikisi verildiğinde ise sadece MCF-7'de anlamlı bir artış gözlemlenmiştir.

Özet (Çeviri)

The difference of microRNAs (miRNA) expression level in cancer cells has been an important subject of cancer researchers. As in all cancers, miRNAs promoting or suppressing tumorigeneses in breast cancer were found and additional miRNAs are still being included. miRNAs are thought to be able to use in the subjects of breast cancer diagnosis, treatment, prognosis and also response of cancer to drug. The elucidation of the role of autophagy pathway in breast cancer is greatly important for cancer treatment and drug interactions. Overexpression of miR-96 was associated with poor prognosis in breast cancer. The drug, Trastuzumab, is often used in HER2 positive breast cancer but this drug is not effective enough. Moreover, no drug which is effective in especially triple negative breast cancer has been found yet. The drug, Everolimus, suppresses mTOR pathway, thus stimulates the autophagy pathway, and phase trials have been conducted in breast cancer. In this study, the expression levels of miR-96 and its theoretically targets associated with autophagy, ATG16L1, ATG9A, ATG7, CTSB, TP73 genes were investigated in breast cell lines. In addition, the expression levels were measured in the absence drug treatment and after treatment of trastuzumab and everolimus combination. qRT-PCR for miR-96 and qRT-PCR in fluidigm device for ATG16L1, ATG9A, ATG7, CTSB, TP73 genes were used to measure the expression levels. According to the gene expression analysis, a significant increase in miR-96 expression were detected in MCF-7 and SKBR-3 breast cancer cell lines, compared to normal epithelial cell line. Among genes theoretically targeted by miR-96, significant decrease in ATG16L1, ATG9A, ATG7 genes' expressions in SKBR3, significant decrease in CTSB gene expression in both cell lines and significant increase in TP73 gene expression in only MCF-7 were detected, compared to normal epithelial cell line. When everolimus was administered, miR-96 expression was found significantly increased in all cell lines; when everolimus and trastuzumab were administered together, a significant increase in miR-96 expression was measured in only MCF-7.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    342803

    Quantitative pcr analysis of gene expression in endothelial cells exposed to shear stress at branching points in arteries leading to atherosclerosis

    Kesme maruz kalan endotel hücreleri gen ifadesinin kantitatif pcr analizi stres ateroskleroz yol açan arterlerde noktaları dallanma de

    SIBGHA TAHIR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    GenetikFatih Üniversitesi

    Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NURULLAH ARSLAN

    YRD. DOÇ. DR. FAHRİ AKBAŞ

  2. Tez No

    837672

    Mikrorna-21 baskılanmış meme kanseri kök hücrelerinin insan kemik iliğinden izole edilen telositler ve telosit kaynaklı mitokondriler ile ko-kültürü

    Co-culture of microrna-21 impressed breast cancer stem cells with telocytes isolated from human bone marrow and telocyte-derived mitochondria

    SENA BABADAĞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyokimyaHacettepe Üniversitesi

    Kök Hücre Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BETÜL ÇELEBİ SALTIK

  3. Tez No

    665847

    Relationship between disease severity and microRNA-4520-3p levels related to ras homolog enriched in brain/ mammalian target of rapamycin pathway in patients with familial Mediterranean fever

    Ailevi Akdeniz ateşi hastalarında hastalık şiddeti ile beyinde zenginleştirilmiş ras homolog / rapamisinin memeli hedefi yolağı ile ilişkili mikroRNA-4520-3p düzeylerinin etkisi

    ABDIKADIR HASSAN ABDULLAHI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    BiyokimyaYıldız Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. VOLKAN SÖZER

    PROF. DR. HAFİZE UZUN

  4. Tez No

    560908

    miR96 and miR182-driven regulation of cytoskeleton in glioblastomas

    Glioblastomalarda hücre iskeletinin miR96 ve miR182 aracılı regülasyonu

    ENES YAĞIZ AKDAŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ARZU KARABAY KORKMAZ

  5. Tez No

    538589

    Otofaji ile ilişkili mikroRNA'ların akciğer kanserindeki rollerinin araştırılması

    Role of autophagy related microRNAs in lung cancer

    SEÇİL EROĞLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    GenetikGaziantep Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SİBEL OĞUZKAN BALCI

    PROF. DR. AHMET FERİDUN IŞIK

Geri Dön