Geri Dön

Stafilokoklarda metisilin direncinin belirlenmesinde farklı yöntemlerin karşılaştırılması

Comparison of different methods for determining methicillin resistance in staphylococci

PDF İndir

  1. Tez No: 365425
  2. Yazar: DİLEK YÜZAK
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. TEKİN TAŞ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Stafilokok, metisilin, mecA, mecALGA251, PBP2a, Staphylococcus, methicillin, mecA, mecALGA251, PBP2a
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Abant İzzet Baysal Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 91

Özet

Metisiline dirençli stafilokoklar, hastane ve toplum kökenli enfeksiyonlara neden olmaktadır. Bu nedenle stafilokoklarda metisilin direncinin hızlı ve doğru tanımlanması önemlidir. Çalışmamızda stafilokoklarda metisilin direncinin farklı yöntemlerle belirlenmesi ve bu yöntemlerin karşılaştırılması amaçlanmıştır. Çalışmamızda 84 Staphylococcus aureus ve 82 koagülaz negatif stafilokok (KNS) izolatı kullanıldı. Metisilin direncini belirlemek için disk difüzyon, mikrodilüsyon, oksasilin tuz agar tarama, kromojenik besiyeri ve PBP2a lateks aglütinasyon testleri kullanıldı. Referans yöntem olarak polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) kullanıldı. Sonuçlar Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI), European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) ve British Society for Antimicrobial Chemotherapy (BSAC) kılavuzlarına göre değerlendirildi. CLSI kriterleri göz önünde bulundurulduğunda oksasilin disk difüzyon testine göre S. aureus'ların 29 (%34,5)'u, KNS'lerin 54 (%65,9)'ü; sefoksitin disk difüzyon testine göre S.aureus'ların 32 (%38,1)'si, KNS'lerin 48 (%58,5)'i; oksasilin mikrodilüsyon yöntemine göre S. aureus'ların 33 (%39,3)'ü, KNS'lerin 59 (%72,0)'u; sefoksitin mikrodilüsyon yöntemine göre S. aureus'ların 32 (%38,1)'si; oksasilin tuz agar tarama yöntemine göre S. aureus'ların 33 (%39,3)'ü, KNS'lerin 45 (%54,9)'i; PBP2a lateks aglütinasyon testine göre S. aureus'ların 30 (%37,5)'u, KNS'lerin 32 (%39,0)'si; kromojenik besiyeri testine göre S. aureus'ların 31 (%36,9)'i metisilin dirençli bulunmuştur. PCR yöntemiyle mecA geni S. aureus'ların 31 (%36,9)'inde KNS'lerin 47 (%57,3)'sinde pozitif bulunmuştur. Çalışmamızda mecALGA251 geni saptanmamıştır. CLSI kriterlerine göre değerlendirilerek elde edilen sonuçlar, referans yöntemle kıyaslandığında S. aureus'larda metisilin direncini belirlemede sefoksitin disk difüzyon ve mikrodilüsyon test sonuçlarının aynı olup diğer yöntemlerden daha uygun olduğu görülmüştür (duyarlılık %100,0, özgüllük %98,1). KNS'lerde sefoksitin disk difüzyon yöntemi diğer yöntemlere göre daha uygun bulunmuştur (duyarlılık %97,9, özgüllük %94,3). Çalışmamızda bulunan değerler, CLSI, EUCAST ve BSAC kriterlerine göre değerlendirilip elde edilen sonuçlar referans yöntemle kıyaslandığında CLSI ve EUCAST duyarlılık ve özgüllük açısından birbiriyle uyumlu bulunurken, BSAC için duyarlılık ve özgüllük değerleri değişkenlik göstermektedir. Stafilokoklarda metisilin direncini belirlemek için ülkemizde kullanılmakta olan CLSI kriteleri ile birlikte EUCAST kriterlerinin de kullanılabileceği kanısına varılmıştır.

Özet (Çeviri)

Methicillin-resistant Staphylococcus strains cause hospital acquired infections and community acquired infections. Therefore rapid and accurate identification of methicillin resistant strains is important. In the present study, we aimed to investigate the detection of methicillin resistance in clinically isolated Staphylococcus strains by different methods and to compare the specifity and sensitivity of these methods. In this study, 84 S. aureus and 82 coagulase negative Staphylococcus (CNS) strains were used. We used to determine the methicillin resistance with disc diffusion, microdilution, oxacillin salt agar screening, chromogenic media and PBP2a latex agglutination tests. Polymerase chain reaction (PCR) technique was used as reference. Test results were evaluated according to the guidelines which are Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI), European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) and British Society for Antimicrobial Chemotherapy (BSAC). In the oxacillin disk diffusion test, 29 (%34,5) of the S. aureus and 54 (%65,9) of the CNS isolates; in the cefoxitine disk diffusion test, 32 (%38,1) of the S. aureus and 48 (% 58,5) of the CNS isolates; in the oxacillin microdilution test, 33 (%39,3) of the S. aureus and 59 (%72,0) of the CNS isolates; in the cefoxitin microdilution test, of the 32 (%38,1) S. aureus and 33 (%39,3) of the CNS isolates; in the oxacillin salt screen agar test, 33 (%39,3) of the S. aureus and 45 (%54,9) of the CNS isolates; in the latex agglutination test, 30 (%37,5) of the S. aureus and 32 (%39,0) of the CNS isolates; in the chromogenic media test, 31 (%36,9) of the S. aureus isolates were found to be resistant. According to PCR technique 31 (% 36,9) of the S. aureus and 47 (%57,3) of the CNS isolates were found to be resistant. In our study, mecALGA251 gene was not found in any of the Staphylococci isolates. When the results obtained according to CLSI compared reference methods, the microdilution and cefoxitin disk diffusion test results were the same was found to be more suitable than other methods for determining the methicilin resistance in S.aureus isolates (sensitivity %100, spesificity %98,1). Cefoxitin disk diffusion test was found more suitable than other methods for CNS isolates. When the resuts provided by the study were evaluated according to the criteria of CLSI, EUCAST, and BSAC, and were compared to the reference method, CLSI and EUCAST criteria were found to be accordant with each other, and BSAC criteria showed variability in terms of sensitivity and specificity. In order to determining methicillin resistance in Staphylococci, EUCAST could also be used instead of CLSI which criteria that are being used in our country was concluded.,

Benzer Tezler

  1. Tez No

    412466

    Çeşitli klinik örneklerden izole edilen metisiline dirençli stafilokoklarin identifikasyonu ve stafilokokkal kaset kromozom mec (SCCMEC) tiplerinin belirlenmesi

    Identification and staphylococcal caset chromosome mec (SCCMEC) typing of staphylococci isolated from various clinical samples

    TUBA VİLKEN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEZAHAT GÜRLER

  2. Tez No

    416142

    Yöremizde çeşitli infeksiyonlardan soyutlanan stafilokokların patojenite testleri bakteriyofajla tiplendirimleri ve antibiyotik duyarlılıkları

    Başlık çevirisi yok

    İBRAHİM SEZEN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1980

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıAtatürk Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. METE BABACAN

  3. Tez No

    418713

    Klinik örneklerden izole edilen stafilokoklar'da mecA varlığının araştırılması

    Investigation of mecA and genes in staphylococci strain isolated from clinical

    AYFER KOYUNCU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    BiyolojiKırıkkale Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYSUN ERGENE

  4. Tez No

    419667

    Monitoring methicillin-resistant bacteria in river water by using meca-specific DNA probe

    Meca-spesifik DNA probu kullanarak nehir suyunda metisilin dirençli bakterilerin takip edilmesi

    ELNAZ SEYEDMONİR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    BiyokimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BÜLENT İÇGEN

  5. Tez No

    419918

    Mastitisli sütlerden izole edilen stafilokokların biyofilm üretme yeteneğinin fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması

    Investigation of biofilm producing ability of staphylococcus spp. with phenotypic and genotypic methods which are isolated from mastitis milk

    BAHAR KOÇ BÜYÜKTARAKÇI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    MikrobiyolojiAdnan Menderes Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SERAP SAVAŞAN

Geri Dön