Geri Dön

Protein mühendisliği yoluyla ligand bağlayıcı protein ve fotoprotein temelli genetik kodlanmış sensörlerin tasarlanması

Designing of ligand binding protein and photoprotein based genetically encoded sensors via protein engineering

PDF İndir

  1. Tez No: 371445
  2. Yazar: CANAN ÖZYURT
  3. Danışmanlar: PROF. DR. AZMİ TELEFONCU, DOÇ. DR. SERAP EVRAN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyokimya, Biochemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 147

Özet

Genetik olarak kodlanmış sensörler biyolojik süreçlerin aydınlatılması için güçlü araçlardır. Bu tür sistemler otofloresans proteinlerin ilgili analiti tanıma ve bağlama yeteneğine sahip olan biyoloji makromoleküller ile genetik olarak birleştirilmesi ile kolaylıkla geliştirilebilirler. Bu tez kapsamında genetik olarak kodlama yöntemi ile çeşitli ligand bağlayıcı proteinler ve fotoproteinlerden oluşan biyosensör sistemleri tasarlandı. Biyosensörlerin tasarımı için, floresans proteinlerin ligand bağlayıcı proteinlere doğrudan füzyonu ve biyoluminesans rezonans enerji transferi (BRET) stratejileri kullanıldı. Maltoz bağlayıcı protein, aspartat dehidrogenaz ve alloz bağlayıcı proteinin tanıma elemanı olarak kullanıldığı biyosensörler ile maltoz, L-aspartat, ve D-alloz analizleri gerçekleştirildi. Genetik olarak kodlanmış biyosensörlerin en önemli özelliklerinden birisi in vivo uygulama potansiyelidir. Bu tez kapsamında in vitro karakterizasyonları gerçekleştirilmiş olan maltoz, aspartat ve alloz biosensörleri, in vivo uygulamalar için de model sistemlerdir.

Özet (Çeviri)

Genetically encoded sensors are powerful tools for elucidation of biological processes. These systems can be simply developed by genetically fusing autofluorescent proteins to biological macromolecules, which are capable of recognizing and binding the analyte of interest. In this thesis, biosensor systems consisting of photoproteins and ligand binding proteins have been designed via various genetically encoding strategies. Fusion proteins of fluorescent proteins and ligand binding proteins were developed by using either bioluminescent resonance energy transfer (BRET) strategy or a direct fusion approach. Maltose binding protein, aspartate dehydrogenase and allose binding protein were used as recognition elements in those biosensors. Analysis of maltose, L-aspartate and D-allose was achieved by the developed biosensors. One of the most important features of the genetically encoded sensors is their potential for in vivo applications. Therefore, maltose, L-aspartate and D-allose biosensors, which have been characterized in vitro could be considered as model systems for in vivo applications.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    730192

    Development of novel inhibitors targeting DRP1-MID49/51 interaction at mitochondrial fission

    Mitokondriyal fizyon mekanizmasındaki DRP1-MID49/51 etkileşimini hedef alan inhibitör geliştirilmesi

    BEHNAZ GHADERKALANKESH

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİstanbul Teknik Üniversitesi

    Bilgisayar Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SEFER BADAY

  2. Tez No

    658454

    Hierarchically porous high surface area polymers with interconnected pores for fast and selective albumin adsorption

    Hızlı ve seçici albümin adsorpsiyonu için hiyerarşik ve birbirine bağlı gözenek yapısına sahip olan yüksek yüzey alanlı polimerler

    MERVE SÜSLÜKAYA

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    Polimer Bilim ve Teknolojisiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Polimer Bilim ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ERDEM YAVUZ

  3. Tez No

    611630

    In Silico and experimental determination of IL1β-receptor inhibitor peptides

    Bilgisayar ortamında ve deneysel olarak IL1-β reseptör inhibitörü peptitlerin belirlenmesi

    FULYA AKŞİT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    Kimya MühendisliğiKoç Üniversitesi

    Kimya ve Biyoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. CEM ALBAYRAK

    PROF. DR. BURAK ERMAN

  4. Tez No

    310529

    Constructing peptide (GEPI)-protein molecular hybrids by using genetic engineering methods for materials and medical applications.

    Malzeme ve medikal uygulamalar için gen mühendisliği yoluyla peptid (GEPI)-protein hibritlerin oluşması.

    DENİZ ŞAHİN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2011

    Biyomühendislikİstanbul Teknik Üniversitesi

    İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CANDAN TAMERLER

    PROF. DR. MEHMET SARIKAYA

  5. Tez No

    747468

    Structure dynamics guided enzyme improvement of endo-beta-1, 4-xylanase i

    Yapı dinamiklerine dayalı endo-beta-1, 4-ksilanaz ı enziminin iyileştirilmesi

    UĞUR UZUNER

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    BiyokimyaTexas A&M University

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. JOSHUA S YUAN

Geri Dön