Protein mühendisliği yoluyla ligand bağlayıcı protein ve fotoprotein temelli genetik kodlanmış sensörlerin tasarlanması
Designing of ligand binding protein and photoprotein based genetically encoded sensors via protein engineering
- Tez No: 371445
- Danışmanlar: PROF. DR. AZMİ TELEFONCU, DOÇ. DR. SERAP EVRAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Biyosensörler, Optik sensörler, Protein mühendisliği, Biosensors, Optical sensors, Protein engineering
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Genetik olarak kodlanmış sensörler biyolojik süreçlerin aydınlatılması için güçlü araçlardır. Bu tür sistemler otofloresans proteinlerin ilgili analiti tanıma ve bağlama yeteneğine sahip olan biyoloji makromoleküller ile genetik olarak birleştirilmesi ile kolaylıkla geliştirilebilirler. Bu tez kapsamında genetik olarak kodlama yöntemi ile çeşitli ligand bağlayıcı proteinler ve fotoproteinlerden oluşan biyosensör sistemleri tasarlandı. Biyosensörlerin tasarımı için, floresans proteinlerin ligand bağlayıcı proteinlere doğrudan füzyonu ve biyoluminesans rezonans enerji transferi (BRET) stratejileri kullanıldı. Maltoz bağlayıcı protein, aspartat dehidrogenaz ve alloz bağlayıcı proteinin tanıma elemanı olarak kullanıldığı biyosensörler ile maltoz, L-aspartat, ve D-alloz analizleri gerçekleştirildi. Genetik olarak kodlanmış biyosensörlerin en önemli özelliklerinden birisi in vivo uygulama potansiyelidir. Bu tez kapsamında in vitro karakterizasyonları gerçekleştirilmiş olan maltoz, aspartat ve alloz biosensörleri, in vivo uygulamalar için de model sistemlerdir.
Özet (Çeviri)
Genetically encoded sensors are powerful tools for elucidation of biological processes. These systems can be simply developed by genetically fusing autofluorescent proteins to biological macromolecules, which are capable of recognizing and binding the analyte of interest. In this thesis, biosensor systems consisting of photoproteins and ligand binding proteins have been designed via various genetically encoding strategies. Fusion proteins of fluorescent proteins and ligand binding proteins were developed by using either bioluminescent resonance energy transfer (BRET) strategy or a direct fusion approach. Maltose binding protein, aspartate dehydrogenase and allose binding protein were used as recognition elements in those biosensors. Analysis of maltose, L-aspartate and D-allose was achieved by the developed biosensors. One of the most important features of the genetically encoded sensors is their potential for in vivo applications. Therefore, maltose, L-aspartate and D-allose biosensors, which have been characterized in vitro could be considered as model systems for in vivo applications.
Benzer Tezler
- Effect of chymotrypsin on M1 type pyruvate kinase from rabbit muscle and L-type from sheep liver
Başlık çevirisi yok
NİLAY BAŞARAN
Yüksek Lisans
İngilizce
1987
BiyokimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MERAL YÜCEL
- Purification of bacteriorhodopsin from halobacterium halobium and reconstitution studies in liposomes
Başlık çevirisi yok
M.BAKER ZABUT
Yüksek Lisans
İngilizce
1987
BiyokimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MERAL YÜCEL
- Farklı derecelerde ısıtılmış süte farklı oranlarda katılan CaCl2'ün sütün pıhtılaşma süresine ve peynir randımanına etkisi üzerine araştırmalar
Başlık çevirisi yok
B.DİLARA ÖZGEN
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiSüt Teknolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SIDDIK GÖNÇ
- İzmir pazarlarında satılan taze köy peynirlerinin bazı nitelikleri ve özellikle zehirlenmeye neden olan bakteri içerikleri üzerinde araştırmalar
Başlık çevirisi yok
NURSEL VAPURCU
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiSüt Teknolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HASAN YAYGIN