Geri Dön

Early postzygotic mutations contribute to de novo variation in a healthy monozygotic twin pair

Sağlıklı bir tek yumurta ikiz çiftinde erken postzigotik mutasyonların de novo mutaston oranına katkısı

PDF İndir

  1. Tez No: 373008
  2. Yazar: GÜLŞAH MERVE KILINÇ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. TAYFUN ÖZÇELİK
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

De novo mutasyonların özellikleri ve oranının bilinmesi hastalıkların ve evrimsel süreçlerin anlaşılabilmesi için büyük önem taşımaktadır. De novo tek nükleotid değişikliklerinin (SNV) doğrudan incelenmesi ile insanda bir nesilde ortaya çıkan yeni tek nükleotid değişikliği oranı 0.82 – 1.70 ×10-8 baz çifti olarak belirlenmiştir. Ancak, bu tek nükleotid değişikliklerinin gelişimin hangi evresinde ortaya çıktığı ve dolayısıyla erken post-zigotik mutasyonların toplam de novo mutasyon oranına olan katkısı bilinmemektedir. Bu noktada, insanda bir nesilde ortaya çıkan yeni mutasyon oranını ortaya çıkma zamanına göre belirlemek amacıyla; anne, baba ve sağlıklı bir erkek ikiz çiftinden oluşan ailede toplam 170 X kapsamalı tüm genom dizilemesi yaptık. Bulunan her bir mutasyon için her bir bireyin genotiplerini karşılaştırmalı ve eş zamanlı olarak analiz ederek de novo tek nükleotid değişikliklerinin belirledik. Sanger dizilemesi ile yapılan doğrulamanın ardından toplam 32 de novo tek nükleotid değişikliğini karakterize ettik. Bu mutasyonlardan 23 tanesi ikizlerin her ikisinin genomunda, 8 tanesi ikizlerden birinde 1 tanesi ise diğerinde bulunmaktadır. Toplam de novo mutasyon oranını ikizlerden biri için 1.31 × 10-8, diğeri için 1.01 × 10-8 olarak hesapladık. Toplam mutasyon oranı içinde, erken post-zigotik mutasyonların oranını ise ikizlerden biri için 0.34 × 10-8 ve diğeri için 0.04 × 10-8 olarak belirledik. Bulgularımız erken post-zigotik mutasyonların sebep olduğu genom mozaisizminin hastalıkların anlaşılması için önem taşıdığını göstermiştir.

Özet (Çeviri)

Characterizing the patterns and rate of de novo mutations is crucial for our perception of evolution and genetic basis of human disease. Direct observation of de novo single nucleotide variation (SNV) rate in healthy individuals revealed a rate in a range of 0.82 – 1.70 ×10-8 base pair per generation. However, the developmental timing of the de novo mutations is unknown and thus, contribution of the early post-zygotic mutations to the human de novo SNV rate remained unknown. In an attempt to estimate the rate of de novo mutations regarding the developmental timing of mutagenesis, we sequenced the whole genomes of a healthy monozygotic twin pair and their parents with a total of 170 fold coverage. We identified the de novo SNVs through examination of the genotypes of each individual for each of the variants in a synchronous manner. Subsequent to the Sanger sequencing based validation, we conservatively characterized a total of 32 de novo SNVs. Of these 23 were shared by the twin pair, 8 were specific to twin I, and 1 was specific to twin II. We estimated the overall de novo SNV rate of 1.31 × 10-8 for twin I and 1.01 × 10-8 for twin II. The rate of the early post-zygotic de novo SNVs was calculated to be 0.34 × 10-8 and 0.04 × 10-8 for twin I and twin II, respectively. These data indicate the growing importance of genome mosaicism which might be resulted from de novo mutations of early post-zygotic origin in disease pathogenesis.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    15528

    Early stage phase transformations and coarsening of an Al-Li-Zr alloy

    Al-Li-Zr alaşımında faz dönüşümleri ilk aşamaları ve çökelti büyümesi

    MEHMET KADRİ AYDINOL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1991

    Metalurji MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    DOÇ. DR. ŞAKİR BOR

  2. Tez No

    21564

    Early republican secularism in Turkey: A theoretical approach

    Başlık çevirisi yok

    NURAY MERT

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    1992

    Siyasal BilimlerBoğaziçi Üniversitesi

    PROF. BİNNAZ TOPRAK

  3. Tez No

    51978

    Early republican reforms from the perspective of elite vs. the people, with particular reference to the alphabet and language reforms

    Aydın ve halk ayrımı bağlamında, özellikle alfabe ve dil devrimleri bazında cumhuriyet dönemi devrimleri

    ALİ DİKİCİ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1996

    TarihBoğaziçi Üniversitesi

    DOÇ.DR. LÜTFULLAH KARAMAN

  4. Tez No

    81351

    Early verbs and the acquisition of Turkish aegument structure

    İlk eylemler ve Türkçe eylem öğe yapılarının edinimi

    FATMA NİHAN KETREZ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    DilbilimBoğaziçi Üniversitesi

    Dilbilim Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ESER ERGUVANLI TAYLAN

    PROF. DR. AYHAN AKSU KOÇ

  5. Tez No

    161359

    A study on the structural and process quality of early childhood education and care centers in Ankara

    Ankara ilindeki okulöncesi eğitim kurumlarının yapısal ve işlevsel kalitesi üzerine bir çalışma

    BELKIS TEKMEN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2005

    Eğitim ve ÖğretimOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    İlköğretim Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ZEYNEP ERDİLLER

Geri Dön