Bardet biedl sendromlu hastalarda moleküler analiz ile fenotip-genotip korelasyonu
Phenotype-genotype correlations with molecular analysis in bardet biedl syndrome
- Tez No: 374914
- Danışmanlar: PROF. DR. FERDA ÖZKINAY
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 114
Özet
Bardet Biedl Sendromu (BBS) obezite, rod-kon distrofi, post aksiyal polidaktili, renal anomali, genital anomali ve öğrenme güçlüğü ile karakterize nadir görülen otozomal resesif geçişli bir silyopatidir. BBS'nin sıklığı toplumlar arası farklılık göstermektedir. KuzeyAvrupa'da 160.000'de 1 iken, akrabağa evliliğinin daha sık olduğu bazı Arap toplumlarında 13.500'de 1 görülmektedir. Türkiye'deki sıklığı ise bilinmemektedir. Bugüne kadar belirlenmiş BBS'den sorumlu olan 18 gen mevcuttur; BBS1, BBS2, BBS3 (ARL6), BBS4, BBS5, BBS6 (MKKS), BBS7, BBS8 (TTC8), BBS9, BBS10, BBS11 (TRIM32), BBS12, BBS13 (MKS1), BBS14 (NPHP6), BBS15 (WDPCP), BBS16 (SDCCAG8), BBS17 (LZTFL1), BBS18 (BBIP1). Bu çalışmada klinik olarak BBS tanısı konulan 15 olguda, hedeflenmiş yeni nesil dizi analizi ile 16 BBS geninde mutasyon dağılımı ve fenotip-genotip korelasyonu araştırılmıştır. Çalışmaya alınan 15 olgunun 13'ünde, araştırılan genlerde hastalığa sebep olan mutasyon saptandı. BBS1 geninde, 1'i tanımlı (Y284SfsX5), 2'si yeni (IVS1-3C>G, Q338X) 3 mutasyon, BBS2 geninde 1 yeni mutasyon (G88AfsX6), BBS4 geninde 1 yeni mutasyon (IVS6-2A>G), BBS7 geninde 1'i tanımlı (R238EfsX59), 1'i yeni (L317V) 2 mutasyon, BBS9 geninde 1 yeni mutasyon (N35X), BBS10 geninde 1'i tanımlı (S311A), 3'ü yeni (K619IfsX10, I342NfsX20, T516NfsX8) 4 mutasyon saptanmıştır. Olgular klinik bulguları ve moleküler genetik özellikleri ile fenotip-genotip korelasyonu açısından değerlendirilmiştir. Bu çalışma, BBS moleküler tanısı ve fenotip-genotip korelasyonu ile ilgili Türkiye'de ilk ve dünya literatründeki az sayıda çalışmalardan biridir. Olgulardaki moleküler bozukluğun ortaya konması, gelişebilecek komplikasyonların önlenebilmesine ve sağlıklı nesillerin yetişmesine katkı sağlayacaktır.
Özet (Çeviri)
Bardet-Biedl Syndrome (BBS) is a rare, autosomal-recessive ciliopathy characterized by obesity, rod-cone dystrophy, postaxial polydactyly, renal abnormalities, genital abnormalities and learning difficulties. The prevalence of BBS varies between populations; from 1:160 000 in northern Europe to 1:13 500 in Arabic communities, where a higher level of consanguinity rates. The incidence is unknown in Turkey. To date, mutations in 18 different genes have been described to be responsible for BBS; BBS1, BBS2, BBS3 (ARL6), BBS4, BBS5, BBS6 (MKKS), BBS7, BBS8 (TTC8), BBS9, BBS10, BBS11 (TRIM32), BBS12, BBS13 (MKS1), BBS14 (NPHP6), BBS15 (WDPCP), BBS16 (SDCCAG8), BBS17 (LZTFL1), BBS18 (BBIP1). In this study mutations in 16 BBS genes, were investigated in 15 clinically diagnosed BBS patients via NGS technology. In the 13 of the 15 patients studied, disease causing mutations were identified. These mutations and genes harbouring these mutations were as follows; BBS1 gene: 1 previously reported (Y284SfsX5), 2 novel (IVS1-3 C>G, Q338X) 3 mutations, BBS2 gene: 1 novel mutation (G88AfsX6), BBS4 gene: 1 novel mutation (IVS6-2 A>G), BBS7 gene: 1 previously reported (R238EfsX59), 1 novel (L317V) 2 mutations, BBS9 gene: 1 novel mutation (N35X), BBS10 gene:1 previously reported (S311A), 3 novel (K619IfsX10, I342NfsX20, T516NfsX8) 4 mutations identified. Regarding clinical features and molecular analysis results, phenotype- genotype correlation was discussed. This is the first study investigating molecular genetic etiology and phenotype- genotype correlation in patients with BBS from Turkey and one of the few studies investigating such a wide spectrum of BBS genes in BBS syndrome. Identification of molecular defects in BBS patients, prevent complications that may develop and contribute the growing of a healthy generation.
Benzer Tezler
- Disease gene discovery by linkage mapping and exome analysis
Bağlantı haritalaması ve eksom analizi ile hastalık geni keşfi
ESRA YILDIZ BÖLÜKBAŞI
Doktora
İngilizce
2018
GenetikBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NESRİN ÖZÖREN
PROF. DR. ASLIHAN TOLUN
- Çocuklarda kistik böbrek hastalıklarının demografik,klinik ve laboratuvar özelliklerinin tanımlanması ve hastalığın progresyonuna neden olan faktörlerin araştırılması
Defining demographic, clinical and laboratory characteristics of cystic kidneydiseases in children and investigation of factors causing progression
ABDURRAHMAN KARAHAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıKaradeniz Teknik ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ELİF BAHAT ÖZDOĞAN
- Son on yılda kliniğimizde takip edilen hipogonadotropik hipogonadizm olgularının gözden geçirilmesi
The review of patients with hypogonadotropic hypogonadism followed up at our clinic in last ten years
FATİH KÜRŞAT YILMAZEL
- Kalıtsal retinal distrofi hastalarında saptanangenetik varyantların değerlendirilmesi
Başlık çevirisi yok
ŞENOL DEMİR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
GenetikMarmara ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BİLGEN BİLGE GEÇKİNLİ
PROF. DR. AHMET ARMAN
- Kliniğimizde takip ettiğimiz bardet biedl sendromlu hastaların fenotipik dağılımına yönelik klinik veri bankası oluşturulması ve genetik danışma verilmesi
Establishing the clinical data bank for phenotypic distribution of the bardet bi̇edl sydnrome pati̇ents which we follow at our clinic and giving genetic counseling
DEFNE ALİKILIÇ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıMarmara ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HURİYE NURSEL ELÇİOĞLU