Geri Dön

Gliomaların oluşmasındaki genetik faktörlerin incelenmesi

Investigation of genetic factors that play role in gliomagenesis

PDF İndir

  1. Tez No: 375127
  2. Yazar: BÜŞRA ŞENKUN
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. YAVUZ OKTAY
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Moleküler Tıp, Nöroloji, Genetics, Molecular Medicine, Neurology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Acıbadem Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyokimya ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 75

Özet

Beyin dokusundan kaynaklanan en sık görülen kanser tipi“gliomalardır”. Son 5 yıl içinde yapılan çalışmalar, glial tümörlerin gelişiminde“izositrat dehidrogenaz”(IDH) enzim mutasyonlarının kanserleşmenin erken safhalarında rol oynadığını göstermiştir. Bu tezin konusu olan araştırmanın amacı, bu SNP'lerin gliomalar ile ilişkisini ilk defa Türkiye kaynaklı bir hasta popülasyonunda analiz etmek ve diğer onkogenik değişimler ile olası ilişkisini ortaya çıkarmaktır. Bu yüzden, glioma hastalarından elde edilen periferik kan ve tümör örnekleri ile kontrol popülasyonunda periferik kandan elde edilen DNA'larda rs4295627 genotiplemesi yapılmıştır. Daha sonra, risk alelinin gliomalarda sık görülen onkogenik bozukluklarla ve yine 8q24.21 yerleşimli SNP rs55705857 ile ilişkisi analiz edilmiştir. Çalışmada glioma histopatolojik tanısı ile opere edilen 135 hasta ve 164 sağlıklı kontrole ait örnekler kullanılmıştır. Bu 135 tümör dokusu kanserleşmenin farklı evrelerindeki (grade-II, grade-III, grade-IV) ve farklı alt tipteki (oligodendroglioma, astrositom, oligoastrositom, glioblastoma multiform ve gliomatoz serebri) glioma örneklerinden seçilmiştir. Analize tabi tuttuğumuz Türkiye kaynaklı hasta popülasyonunda elde ettiğimiz sonuçlar, 8q24.21 yerleşimli rs4295627 numaralı SNP ile gliom yatkınlığı arasında güçlü bir ilişki olduğunu ortaya koymuştur. Bu ilişki özellikle grade-2 ve grade-3 tümörlerde ve oligodendrogliomalarda daha güçlü biçimde gözlenmiştir; IDH mutasyonu taşıyan gliomalarda ise daha zayıf bir ilişki görülmüştür. Diğer taraftan, rs4295627 genotipi ile tümör örneklerinde belirlenmiş olan yaygın onkogenik bozukluklar (1p19q kaybı, p53 ifadesi, p16 ifade kaybı, PTEN ifade kaybı, hTERT promotor mutasyonları, hTERT-C228T mutasyonu) ya da rs4295627'in yatkınlık etkisinden sorumlu olduğu iddia edilen rs55705857 numaralı SNP ile istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki gözlenmemiştir. Son olarak, rs4295627'nin etkisinin artan tümör derecesi (grade) ile ters korelasyon gösterdiği görülmüştür.

Özet (Çeviri)

Gliomas are the most frequent type of cancer arising from the brain tissue. Isocitrate deyhdrogenase (IDH)" plays an important role in the development of gliomas. The aim of the research is to analyze these SNPs in Turkish populatiın for the first time and to investigate a possible relation with common oncogenic changes seen in gliomas. A total of 135 patients and 164 healthy controls were included in the study. Rs4295627 has been genotyped in genomic DNA from blood/tumor samples of glioma patients and from blood samples of healthy donors. Next, the relation between rs4295627 genotype and rs55705857 genotype and common oncogenic mutations in gliomas was analyzed Our results show that a strong relation exists between 8q24.21-localized rs4295627 genotype and increased glioma risk. The association was particularly strong for grade-2 and grade-3 gliomas and oligodendrogliomas, while the previously reported association with IDH-mutation was relatively weaker. On the other hand, analysis of the relation between rs4295627 genotype and oncogenic changes common to gliomas (1p19q codeletion, p53 expression by immunohistochemistry, p16 expression loss, PTEN expression loss, hTERT promotor mutations and particularly C228T mutation) did not reveal any statistically significant association by chi-square test. The same was true fort he relation between rs4295627 and the more recently identified SNP rs55705857, which was claimed to be the causal change that is responsible for rs4295627's association with glioma. Besides molecular changes, the relation between rs4295627 genotype and tumor grade was analyzed and a very strong association with lower grade (II and III) was observed.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    802441

    Glioma hücrelerinde rosmarinik asitin antikanser moleküler mekanizmalarının araştırılması

    Investigation of anticancer molecular mechanisms of rosmarinic acid in glioma cells

    ASLIHAN ŞENGELEN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Biyolojiİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EVREN ÖNAY UÇAR

  2. Tez No

    230268

    Serebral gliomaların evrelendirilmesinde; difüzyon MR, perfüzyon MR ve MR spektroskopi bulguları ile histopatolojik bulguların karşılaştırılması

    Comparison of histopathological finding with diffusion-weighted imaging, perfusion MR and MR spectroscopy in the grading of cerebral gliomas.

    YELİZ GÜL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Radyoloji ve Nükleer TıpFırat Üniversitesi

    Radyodiagnostik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HANEFİ YILDIRIM

  3. Tez No

    878273

    PiDeeL: metabolic pathway-informed deep learning model for survival analysis and pathological classification of gliomas

    PiDeeL: gliomalarin sağkalim analizi ve patolojik siniflandirmasi için metabolik yolak bilgili derin öğrenme modeli

    GÜN KAYNAR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ABDULLAH ERCÜMENT ÇİÇEK

  4. Tez No

    609319

    Glioblastoma multiforme (gbm) hücre hattına glikojen sentaz kinaz 3 inhibisyonunun, apoptoz ve hücre sinyal yolakları özelinde etkisinin araştırılması

    Effects of glycogen synthase kinase inhibitor on gliblastoma multiforme cell line via apoptosis and cell signaling pathways

    MAHMUT ÇAMLAR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Histoloji ve EmbriyolojiEge Üniversitesi

    Kök Hücre Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜSEYİN AKTUĞ

  5. Tez No

    193633

    Düşük dereceli gliomalarda egfr, pten, pdgfr-alfa, MGMT ifadelerindeki, TP53 ve P53 yolağı (MDM-2 ve P14arf) genlerindeki düzensizlikler ve klinik etkileri

    Aberrations in egfr, pten, pdgfr-alfa, MGMT expressions, TP53 and P53 pathway (MDM-2 and P14arf) genes in low grade gliomas and their clinical effects

    PINAR EREN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Moleküler TıpMarmara Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. TÜRKER KILIÇ

    PROF.DR. AYŞE ÖZER

    PROF.DR. BEYAZIT ÇIRAKOĞLU

Geri Dön