Karbapenem dirençli pseudomonas suşlarında OXA-23, OXA-40, OXA-58 genlerinin moleküler yöntemle tesbiti
Detection OXA-23, OXA-40, OXA-58 genes with molecular investigation in carbapenem resistant pseudomonas strains
- Tez No: 375194
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MEHMET ÖZDEMİR
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Necmettin Erbakan Üniversitesi
- Enstitü: Meram Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 66
Özet
Amaç: Bu çalışmada, karbapenem dirençli 184 Pseudomonas spp. suşunda, OXA tipi karbapenemaz (OXA-23, OXA-40, OXA-58) üretiminin ve karbapenem direncine katkısının irdelenmesi hedeflendi. Yöntem: Kasım 2011 ile Ekim 2013 tarihleri arasında, Necmettin Erbakan Üniversitesi Meram Tıp Fakültesi Hastanesi Merkez Mikrobiyoloji Laboratuarına gönderilen klinik örneklerden izole edilen 184 karbapenem dirençli Pseudomonas spp. suşu çalışmaya alındı. Klinik izolatların tiplendirmesi ve antimikrobial duyarlılıkları otomatize sistem (VITEK 2, Biomerieux, Fransa) ve konvansiyonel yöntemler ile yapıldı. Karbapenem direnci saptanan klinik örneklerde, Hyplex CarbOxa ID (Amplex Diagnostics GMBH, Almanya) PZR ticari kiti ile OXA karbapenemazlardan OXA-23, OXA-40 ve OXA-58 varlığı araştırıldı. Bulgular: 184 örnekten 12'sinde OXA-23 pozitifliği saptanırken, OXA-40 ve OXA-58 genlerinden birer pozitiflik bulundu. Sonuç: Bu çalışma bölgemizde ve Türkiyede Pseudomonas suşlarında OXA gurubu karbapenemazları araştıran ve oranlarını ortaya koyan ilk araştırmadır. Karbapenem direncinde en önemli mekanizma, karbapenemaz aracılı enzimatik hidroliz mekanizmasıdır ve bu mekanizma Acinetobacter baumannii'de olduğu gibi Pseudomonas'larda da bulunurlar. OXA karbapenemazların çoğu zayıf karbapenemaz aktivitesi gösterseler de; karbapenem direnci OXA karbapenemazlar ile ikinci bir direnç mekanizmasının kombinasyonundan kaynaklanabilir. Gelecekte karbapenem direnci hasta tedavisinde ciddi bir sorun haline gelebilir.
Özet (Çeviri)
Objective: It was aimed to determine OXA type carbapenemases (OXA-23, OXA-40, OXA-58) production in 184 carbapenem resistant Pseudomonas spp. isolates and to evaluate its contribution to carbapenem resistance. Method: One hundred eighty four carbapenem resistant Pseudomonas spp. isolates were collected from Medical Microbiology Laboratory of Meram Faculty of Medicine, Necmettin Erbakan University between November 2011 and October 2013. Idendification and antimicrobial susceptibilities of clinical isolates were determined by automated system (VITEK 2 Compact, Biomerieux, France) and conventional methods. OXA-23, OXA-40 and OXA-58 of OXA carbapenemases was determineted by a commercial kit Hyplex CarbOxa ID (Amplex Diagnostics GMBH, Germany) PCR in carbapenem resistant clinical samples. Result: 12 of the 184 isolates have OXA-23 genes, OXA-40 and OXA-58 genes were determined only one isolate. Conclusion: This is first investigation of OXA type carbapenemases genes in Pseudomonas strains and determine the rates of these genes in our region and Turkey. The most important mechanism of carbapenem resistance is the enzymatic hydrolysis mediated by carbapenemases. These enzymes are usually OXA type carbapenemases and also found in carbapenem-resistant Pseudomanas. Although most of OXA carbapenemases have weak carbapenemase activity, carbapenem resistance may result from the combination of a second mechanism of resistance. Carbapenem resistance could become a serious problem in the patient treatment in the future.
Benzer Tezler
- Hastane kökenli pseudomonas aeruginosa ve acinetobacter baumaniii̇ suşlarında karbapenem direncine neden olan beta laktamazların fenotipik ve genotipik yöntemlerle belirlenmesi
Phenotypic and genotypic determination of beta lactamases causing carbapenem resistance in hospital acquired pseudomonas aeruginosa and acinetobacter baumannii
ŞAFAK ANDİÇ
Doktora
Türkçe
2015
MikrobiyolojiFırat ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YASEMİN BULUT
- Karbapeneme dirençli pseudomonas aeruginosa suşlarında seftazidim avibaktam'a karşı in vitro duyarlılık yöntemlerinin karşılaştırılması ve bazı karbapenemaz genlerinin araştırılması
Comparison of in vitro susceptibility methods against ceftazidime avibactam in carbapenem-resistant pseudomonas aeruginosa strains and investigation of some carbapenemase genes
İSMAİL AYTAÇ ACAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
MikrobiyolojiHitit ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ HANDE AFŞARLAR
- Pseudomonas aerugınosa şuslarında fenotipik direnç özelliklerinin ve metallo-β-laktamaz enzim varlığının araştırılması
The investigation of phenotypic resistance characteristics and the presence of metallo-β-lactamase enzyme activity on Pseudomonas aeruginosa strains
ÖZGÜR DOĞAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
MikrobiyolojiAkdeniz ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MERAL GÜLTEKİN
- Kan kültüründen izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarında karbapenem direnç mekanizmalarının fenotipik ve moleküler yöntemlerle araştırılması
Investigation of Carbapenem resistance mechanisms by phenotypic and molecular methods in Pseudomonas aeruginosa strains isolated from blood culture
ELİF GÜLSOY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
MikrobiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ESRA ÖZKAYA
- Hastane kaynaklı gram negatif non fermentatif bakterilerde antibiyotik direnci, antibiyotik direnç mekanizmaları ve antibiyotik direnç gelişimine neden olan risk faktörlerinin belirlenmesi
Investigation of patterns and mechanisms of antibiotic resistance and risk factors associated with antibiotic resistance in gram negative non fermentative bacteria isolated from hospital setting
UTKU KAVRUK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2007
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıGATAEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. ORAL ÖNCÜL