Fasulye (Phaseolus vulgaris L.)'de retrotranspozon genlerinin filogeni analizi
Phylogeny analyses of retrotransposon genes in common bean (Phaseolus vulgaris L.)
- Tez No: 382567
- Danışmanlar: PROF. DR. MUHAMMED BAHATTİN TANYOLAÇ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 82
Özet
Filogeni analizlerinde, genetik kaynakların tanımlanmasında retrotranspozon moleküler teknikler etkili bir biçimde kullanılmaktadır. Bu çalışmada, Türkiye ve dünyanın farklı orjinlerinden 67 fasulye genotipi LTR-retrotranspozonlara dayalı inter-Primer Binding Site (iPBS) markör tekniği uygulanarak, moleküler düzeyde tanımlanmıştır. iPBS markör analizinde, toplam 47 primerden 180 adet polimorfik bant elde edilmiştir. Bu sonuca göre en yüksek PIC değeri iPBS-2394 primeri kullanıldığında 0.94 olarak, en düşük PIC değeri ise iPBS-2375 primeri kullanıldığında 0.03 olarak elde edilmiştir. STRUCTURE programında populasyon yapısı belirlenmiştir ve ΔK değeri 2 olarak hesaplanmıştır. NTSYS programından elde edilen genetik benzerlik dendrogramı kıyaslandığında paralel sonuçlar gözlemlenmiştir, Grup 1: ağırlıklı olarak Türkiye lokasyonuna ait genotipler, Grup 2: farklı ülkelere ait genotipler ve Grup 3: Hindistan'a ait iki genotiptir. iPBS markör analizinde genotipler arasındaki genetik benzerlik oranının 0.14 ile 0.99 arasında değiştiği görülmüştür. En yakın genotiplerin (15) Bandırma/Türkiye (Sarı şeker) ile (42) Türkiye (Volare) olduğu belirlenmiştir. Aralarındaki benzerlik değerinin 0.99 olduğu görülmektedir ve en uzak genotiplerin (9) Bozdağ/Türkiye (Kula barbunya) ile (52) Hindistan (Dolic hos) olduğu, aralarındaki benzerlik değerlerinin 0.09 olduğu saptanmıştır.
Özet (Çeviri)
In phylogeny analysis, retrotransposon based moleculer marker system efficiently used for identification of genetic resources. In this study, 67 common bean genotypes from different origins in Turkey and the world by LTR retrotransposon based inter-Primer Binding Site (iPBS) marker system, has been identified at the molecular level. In iPBS marker systems, 180 polymorphic bands were obtained by 47 primers. According to the result, the highest and lowest PIC value determined as 0.94 (primer iPBS-2394) and 0.03 (primer iPBS-2375), respectively. Population structure was determined using STRUCTURE software and mainly two groups (K=2) were identified among 67 common bean genotypes. Genotypes in separated two main groups, referred to as a mixture, were determined. In the analysis of molecular data, NTSYS program obtained Jaccard (J)'s similarity coefficient that was compared with genetic similarity dendrogram and parallel results were observed. Group 1: mainly belong to Turkey location genotypes, Group 2: genotypes belonging to different countries and Group 3: two genotypes of India. In iPBS marker analyses, the genetic similarity ratio between different genotypes varied between 0.14 to 0.99. The closest genotypes was determined as (15) Bandırma/Turkey (Yellow sugar) and (42) Turkey (Volare) and the similarity value was established as 0.99. The furthest genotypes was determined as (9) Bozdağ/Turkey (Kula barbunya) and (52) India (Dolic hos), and the similarity value observed as 0.09.
Benzer Tezler
- Fasülye (Phaseolus vulgaris l.)'de soğuğa ve dona dayanıklılık üzerine bir araştırma
A Study on cold and frost resistance of common beams (Phaseolus vulgaris l.)
GÖKMEN ELEMAN
- Fasulye (Phaseolus vulgaris L.)'de kaolin uygulamasının verim, verim öğeleri ve tane kalitesine etkisinin belirlenmesi
Effect of kaolin application on yield, yield components and grain quality in dry bean (Phaseolus vulgaris L.)
UĞURHAN YİĞİTARSLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
ZiraatAnkara ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. M. SAİT ADAK
- Fasulye (Phaseolus vulgaris L.)'de doku kültürü ve agrobacterium aracılığıyla gen aktarımı
Tissue culture and transformation of field bean (Phaseolus vulgaris L.) using Agrobacterium
SEVİL SAĞLAM
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
ZiraatAnkara ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF.DR. CEMALETTİN YAŞAR ÇİFTÇİ
- Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) 'de sulamayla verilen azotlu gübrelemelerin verim, verim ögeleri ve nodülasyona etkileri
Effects of nitrogen fertilizations with irrigation on yield, yield components and nodulations in dry bean (Phaseolus vulgaris L.)
CANSU ÖZTÜRK
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
ZiraatAnkara ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET SAİT ADAK
- Fasulye (Phaseolus vulgaris L.)'de ekonomik öneme sahip bazı agronomik karakterleri kontrol eden dna markırlarının ilişki haritalaması ile saptanması
Detection of dna markers controlling some economically important agronomic characters by association mapping in common bean (Phaseolus vulgaris L.)
SEDA NEMLİ
Doktora
Türkçe
2013
BiyoteknolojiEge ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. M. BAHATTİN TANYOLAÇ