Identification of doxorubicin drug resistance mechanisms by using genomic techniques
Doksorubisin dirençlilik mekanizmalarının genomik yöntemlerle tespit edilmesi
- Tez No: 382939
- Danışmanlar: PROF. DR. AHMET KOÇ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 88
Özet
Kemoterapi, uzun zamandır kanser hastalarının tedavisine önemli katkılarda bulunmuştur. Tedavilerin etkenliği, kullanılan ajanların normal hücreler üzerindeki toksik etkilerinden ve ilaç dirençliliğinden etkilenmektedir. Teröpatik dirençliliğin, kanser durumlarının çoğunda tedavi başarısızlığının nedeni olduğuna inanılır. Dolayısıyla, ilaç dirençliliğinin altında yatan moleküler mekanizmaların anlaşılması, kanser kemoterapi tedavilerinin etkisini arttırmada önemli katkılar sağlayabilir. Doksorubisin, birçok kanser türünün tedavisinde yaygın olarak kullanılan doğal bir ajandır fakat birçok tümör bu ajana karşı dirençlilik göstermektedir. Bu çalışmada, Saccharomyces cerevisiae model organizması kullanılarak, BY4741 yabani tip maya suşu için Doksorubisin toksik seviyesi belirlenmiş ve bu toksik seviyeye karşı dirençlilik gösteren genleri tespit etme amaçlı genom düzeyinde tarama yapılmıştır. CUE5, AKL1, CAN1, YHR177W ve PDR5 genlerinin fazla ifadelenmesi, Doksorubisine karşı, toksik seviyeden daha yüksek ilaç seviyesinde dahi dirençlilik göstermiştir. Bu genler arasında, sadece PDR5 geninin Cisplatin ajanına karşı çapraz-dirençlilik göstermiştir. 2 saatlik, 80μM Doksorubisin muamelesinin ardından, bu genlerin eş-zamanlı PCR ve mikroarray analizleri gerçekleştirilmiş ve ekspresyon açısından anlamlı bir farklılık göstermedikleri görülmüştür. Dolayısı ile bu genlerin fazla ifadelenmesinin, maya hücrelerinde fizyolojik bir yanıt olmadığı düşünülmektedir. Tüm genom mikroarray analizleri, Doksorubisin muamelesinin çeşitli biyolojik ve hücre fonksiyonlarında farklılık yarattığını göstermiştir. Mikroarray analizlerinde bulunan genlerin genel olarak, filamental büyüme, protein übikitinasyonu, otofaji, membran geçişi değişimleri ve metabolik değişiklikler gibi genel-stres yanıtı ile ilgili olaylarda rol oynadığı görülmüştür.
Özet (Çeviri)
Chemotherapy has been an important contributor for the treatment of cancer patients for a long time. The effectiveness of the therapies is influenced from the toxicity effects of the agents on normal cells and from the drug resistance. Therapeutic resistance is believed to cause the failure of the chemotherapy effectiveness in most cancer cases. Therefore, understanding the molecular mechanisms that underlie the drug resistance may contribute to increase the effectiveness of the chemotherapeutic treatment of cancer. Doxorubicin is a natural product that is widely used in treatment of various cancer types, yet many tumors have resistance against these agents. By using the budding yeast Saccharomyces cerevisiae as a model organism, we performed genome-wide screenings to identify the genes that cause resistance against this agent. Overexpression of CUE5, AKL1, CAN1, YHR177W and PDR5 genes have been identified to cause resistance against Doxorubicin at higher concentrations than the identified toxic level. Among these genes, only PDR5 overexpression was found to have cross-resistance to Cisplatin. Real-time PCR and microarray analysis for these genes were also performed. Upon 80μM Doxorubicin treatment for 2 hours, none of the CUE5, AKL1, CAN1, YHR177W and PDR5 genes showed expression changes compared to their correponding untreated wild-type status. Therefore, overexpression of these genes may not be a physiological response of yeast cells against Doxorubicin. Genome-wide microarray analysis showed changes in several cellular and biological functions upon Doxorubicin treatment. Identified genes mainly function in general stress response related events such as, filamentous growth, protein ubiquitination, autophagy, changes in membrane transportation and metabolic processes.
Benzer Tezler
- Kemoterapi ajanı Doksorubisin'in Escherichia coli üzerindeki etkisi ve dirençle ilgili genlerin genom boyu kütüphane zenginleştirme ve tarama çalışmaları ile araştırılması
Investigation of the effect of the chemotherapy agent doxorubicin on escherichia coli and the genes related to resistance by genome-wide library and screening studies
ANI ALTUĞ CURNA
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
Tıbbi BiyolojiAydın Adnan Menderes ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHTAP KILIÇ EREN
- Identification of actionable drug targets in triple-negative breast cancer
Üçlü negatif meme kanserinde hedeflenebilir adayların belirlenmesi
ÜNAL METİN TOKAT
Doktora
İngilizce
2022
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SERKAN İSMAİL GÖKTUNA
- Investigation of docetaxel and doxorubicin resistance in MCF-7 breast carcinoma cell line
MCF-7 meme kanseri hücre hattında dosetaksel ve doksorubisin dirençliliğinin incelenmesi
ÖZLEM DARCANSOY İŞERİ
Doktora
İngilizce
2009
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Bölümü
PROF. DR. FİKRET ARPACI
PROF. DR. UFUK GÜNDÜZ
- Multiomics approaches to overcome drug resistance in cancer
Kanserde ilaç direncinin üstesinden gelmek için multi-omik yaklaşımlar
BARIŞ KÜÇÜKKARADUMAN
Doktora
İngilizce
2021
Genetikİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ OSMAY GÜRE
- Identification of genes conferring resistance to chemotherapeutic drugs
Kemoterapötik ilaçlara karşı direnç kazandıran genlerin belirlenmesi
İRFAN BAKİ KILIÇ
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
BiyoteknolojiAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar ÜniversitesiMoleküler ve Translasyonel Biyotıp Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EMRE DENİZ