Doğu Akdeniz Bölgesi'nde buğdayda Septorya yaprak lekesi (Septoria tritici Rob. ex. Desm.)'nin yaygınlığının belirlenmesi ve patojenin moleküler karakterizasyonu
Estimation of the prevalence of wheat Septoria leaf blotch (Septoria tritici Rob. ex. Desm.) in the Eastern Mediterranean region and and molecular characterization of the pathogen
- Tez No: 387300
- Danışmanlar: PROF. DR. MUKADDES KAYIM
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 78
Özet
Bu çalışmada Doğu Akdeniz Bölgesi'nde buğday yetiştiriciliğinde sorun olan Septorya Yaprak Lekesi Hastalığının (SYLH) yaygınlığını belirlemek üzere Adana, Mersin, Osmaniye, Hatay ve Kahramanmaraş'ta 260 farklı buğday tarlasında sörvey yapılmıştır. Tarlaların % 58,91'inin SYLH ile bulaşık ve hastalık şiddetinin ortalama % 11,62 olduğu saptanmıştır. 142 hastalıklı bitki dokusundan toplamda 74 izolat saflaştırılmış, bunlardan; Adana'dan 47, Mersin ve Osmaniye'den 3'er, Hatay'dan 14 ve Kahramanmaraş'tan 7 izolat elde edilmiştir. En çok izolatın elde edildiği Adana'da hastalık % 87,99 ile en yaygın olarak saptanırken, bunu % 87.44 ile Osmaniye, % 43,59 ile Kahramanmaraş, % 42,68 ile Mersin ve % 26,03 ile Hatay illeri izlemiştir. Hastalık etmeni morfolojik yapının mikroskobik gözlemlerine göre ve moleküler analiz yöntemleri yardımıyla tanımlanmıştır. Elde edilen 74 izolattan 15'i rDNA'nın ITS gen dizileri 5′ ve 3′ yönlerinden dizilimleri elde edilmiş ve NCBI gen bankasında nükleotidler blastn programı ile karşılaştırılmış ve etmeninin Septoria tritici olduğu belirlenmiştir. İzolatlara ait rDNA ITS gen dizileri KP852507, KP852508, KP852509, KP8525010, KP8525011, KP8525012, KP8525013, KP8525014, KP8525015, KP8525016, KP8525017, KP8525018, KP8525019, KP8525020 ve KP8525021 kayıt numaraları ile NCBI gen bankasına yüklenmiştir. Maksimum Parsimoniye göre izolatların birbiri ile olan yakınlığına bakıldığında CU_101 StM26 ve CU_103 StA58 nolu izolatı diğer Septoria tritici izolatlarının genetik orijinini oluşturmuştur. Diğer izolatlar bunlardan 2 farklı alt gruba ayrılmıştır.
Özet (Çeviri)
In this study, 260 different wheat fields were surveyed for the estimation of prevalence of septoria leaf blotch disease in the cities of Eastern Medditerranean Region. Out of 100 % of total wheat crop fields, 58.91% of wheat fields were infected with septoria leaf blotch disease. The mean value of septoria leaf blotch disease virulence was 11.62 %. Out of 142 diseased wheat crop samples, 74 isolates were obtained. Forty seven isolates from Adana, 3 isolates from Mersin, 3 isolates from Osmaniye, 14 isolates from Hatay and 7 isolates from Kahramanmaraş provinces were cultured on PDA-tetplates. The cause of disease agent was identified based on microscobic observation of morphological structure and molecular analysis methods. Consequently, 15 isolates were sequenced for 5′ and 3′ ends of ITS of rDNA and nblast of the ITS sequences has revealed that Septoria tritici was the agent of septoria leaf blotch disease. The highest disease prevalence (87.99%) was observed at Adana, and then followed respectively Osmaniye with 87.44 %, Kahramanmaraş with 43.59 %, Mersin with 42.68 % and Hatay with 26.03 %. The agent has been identified based on microscobic observation and Molecular analysis (PCR and ITS sequences). Fifteen isolates out of 74 has been sequenced 5′ and 3′ end of ITS, and then aligned by blastn in NCBI. The all results come up as S. tritici. The isolates of rDNA ITS have been deposited as KP852507, KP852508, KP852509, KP8525010, KP8525011, KP8525012, KP8525013, KP8525014, KP8525015, KP8525016, KP8525017, KP8525018, KP8525019, KP8525020, and KP8525021 in NCBI. According to phylogenetic tree built by Maximum Parsimony of ITS sequences, Isolates of CU_101 StM26 and CU_103 StA58 have been found origin of other Septoria tritici isolates. Two subclades have branched from these 2 isolates.
Benzer Tezler
- Bazı ekmeklik buğday çeşitlerinde vejetatif periyot, tane dolum periyodu, uyum oranı ve bazı verim özelliklerinin tane verimi ile ilişkilerinin incelenmesi
Investigation of the relationships between grain yield and vegetative period, grain filling period, harmonization ratio and some yield traits in some bread wheat varieties
ABDULKADİR TANRIKULU
Doktora
Türkçe
2017
ZiraatKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TEVRİCAN DOKUYUCU
- Antalya'da depolanmış ürün ve materyalde zararlı böcek ve akar türleri.Yayılışları ve habitatları üzerine araştırmalar.
Başlık çevirisi yok
YILDIRIM YANAROĞLU
- Antalya körfezi ve yakın çevresinde aletsel dönemde oluşmuş depremlerin tektonizma ile ilişkisi
The relationship between tectonism and earthquakes occurred during instrumental period in Antalya gulf (basin) and its surroundings
EMİNE BOZKURT
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
Jeoloji MühendisliğiAkdeniz ÜniversitesiJeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. VOLKAN ÖZAKSOY
- Doğu Akdeniz Bölgesi'nde sofralık erik seleksiyonu
A Plum selection study in the Eastern Mediterranean Region
HAMİT AYANOĞLU
- Doğu akdeniz bölgesi zeytin bahçelerindeki virüslerin yaygınlığının RT-PCR ile belirlenmesi ve karakterizasyonu
RT-PCR detection and characterisation of virus spread in olive orchards in the east mediterranean region
SONGÜL YALÇIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
ZiraatMustafa Kemal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÇİĞDEM ULUBAŞ SERÇE