Geri Dön

The gene knock-out in N. benthamiana L. and P. somniferum L. by using RNA-guided CRISPR/Cas9 system

The gene knock-out in N. benthamiana L. and P. somniferum L. by using RNA-guided CRISPR/Cas9 system

PDF İndir

  1. Tez No: 395737
  2. Yazar: YAĞIZ ALAGÖZ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. TURGAY ÜNVER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2015
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 94

Özet

Bitki genom modifikasyonları antik çağlardaki çifçilerin zamanından başlayarak günümüzün bilim insanları tarafından da klasik ıslah ve GM teknikleri uygulanarak insanlık tarafından yüzyıllardan beri yapılmaktadır. Şimdilerde, transkripsiyonel seviyedeki manipulasyonlar için sentetik yeni bir non-GM teknoloji geliştirildi. CRISPR sistemi, RNA kılavuzlu transiyent bir genom düzenleme aracıdır. Hedef spesifik olarak dizayn edilmiş bir kimerik sgRNA ve Cas9 endonükleazından oluşmakta olup, DNA da çift zincir kırıkları (DSB) oluşturarak genomda istenilen gen yada genlerde çerçeve kayması mutasyonu ile gen nakavtı yapar. CRISPR sistemi, DNA da kırık oluşumuna sebep olduktan sonra, bitkinin kendi tamir mekanizmaları olan HR ve NHEJ mekanizmalarını devreye sokar. Tip II CRISPR/SpCas9, yüksek oranda spesifik ve güvenilir bir sistem olup, bitki çalışmalarına adapte edilmiş diğer genom düzenleme teknolojileri arasındaki en uç teknolojidir. Bu çalışmada, en popüler tıbbi aromatik bitkilerden biri olan haşhaş (Papaver somniferum L.), ve iyi bilinen bir model organizma olan Nicotina benthamiana L.'nın genomları viral ve sentetik tabanlı olarak transkribe olan sgRNA ler kullanılarak CRISPR/Cas9 sisteminin uygulanabilirliği açısından incelenmiştir. Pap4OMT2 ve NbPDS genlerisini hedefleyen sgRNA ler spesifik olarak dizayn edilmiş ve SpCas9 endonükleaz ile beraber istenilen gen segmentleri hedeflenmiş olup oluşan InDel ler gösterilmiştir. Böylece, CRISPR/Cas9 sisteminin model olmayan Papaver türlerinde uygulanabilirliği literatürde ilk kez gösterilmiştir.

Özet (Çeviri)

Genome modifications in plants have been doing for many centuries by mankind since from the times of ancient farmers to the scientists for now by applying selective breeding and GM techniques. Recently, a new synthetic non-GM technology has been developed for transcriptional-level manipulations. CRISPR system is an RNA-guided transient genome editing tool, that is generally composed of a target-specifically designed chimeric sgRNA and a Cas9 endonuclease, which forms DSBs in DNA and results a frame-shift mutation to knock-out any desired gene or genes in genome. CRISPR system employs genome repair mechanims of HR or NHEJ after introducing a cut into DNA and mediates genome editing by using organisms own repair mechanisms. Type II CRISPR/SpCas9 is a highly-specific and robust system which is a state of art among the other genome-editing technologies that is adapted to plant sicence. In this study, Opium poppy (Papaver somniferum L.), one of the most popular medicinal aromatic plants, and a well-known model organism Nicotina benthamiana L. genomes were investigated on the applicabilitiy of CRISPR/Cas9 system by using synthetic and viral based transcribed sgRNAs. sgRNAs targeting Pap4OMT2 and NbPDS genes were specifically designed and used to target those specific gene segments with SpCas9 endonuclease and formed InDels were demonstrated. Thus, the applicability of CRISPR/Cas9 system in non-model papaver species was shown for the first time in literature.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    858116

    Knock out of GSH2 gene and production of γ-GC in nicotiana benthamiana leaves with Cas9 vector/cell penetrating peptide complex

    Cas9 vektörü/hücreye nüfuz eden peptit kompleksi ile nicotiana benthamiana yapraklarinda GSH2 geninin knock out edilmesi ve γ-GC üretimi

    OĞUZHAN YAPRAK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyolojiBaşkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. CEYHUN KAYIHAN

  2. Tez No

    400902

    HMA2.A transmembrane Zn2+ transporting ATPase from Arabidopsis thaliana

    Başlık çevirisi yok

    ELİF EREN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2006

    KimyaWorcester Polytechnic Institute

    DR. JOSE M. ARGUELLO

  3. Tez No

    518566

    Investigation of micrornas that interact with the NFIX 3′untranslated region

    NFIX 3'utr bölgesi ile etkileşen mikrornaların araştırılması

    ECE ÇAĞDAŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ASLI KUMBASAR

  4. Tez No

    449156

    Investigating the biological role of sialidase NEU4 and GalNAc-T enzymes in a mouse model of Tay-Sachs disease

    Tay-Sachs hastalığı fare modelinde sıalıdaz NEU4 ve GalNAc-T enzimlerinin biyolojik rolünün araştırılması

    EDANUR ATEŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    Genetikİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. VOLKAN SEYRANTEPE

  5. Tez No

    907401

    Gen düzenleme teknolojisi (CRISPR) ile elde edilen domates genotiplerinin canavar otuna (Phelipanche spp.) karşı dayanıklılık ve gen ekspresyon seviyelerinin belirlenmesi

    Determination of the resistance and gene expression levels of tomato genotypes obtained by CRISPR/CAS9 technology against broomrape (Phelipanche spp.)

    ESRA ÇİĞNİTAŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyoteknolojiAkdeniz Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ YASİN EMRE KİTİŞ

Geri Dön