Geri Dön

Tuz stresi uygulanan Beta vulgaris ve Beta maritima bitkilerinde kromatin yeniden düzenlenme modellerinin araştırılması

Investigation of chromatin remodeling in Beta vulgaris and Beta maritima under salt stress conditions

  1. Tez No: 405265
  2. Yazar: SEHER YOLCU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. FİLİZ ÖZDEMİR
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Histon asetilasyonu, tuz stresi, şeker pancarı, yabani pancar, peroksidaz, Histone acetylation, salt stress, sugar beet, wild beet, peroxidase
  7. Yıl: 2015
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 116

Özet

Bitkilerde histon asetilasyonu çevresel streslere karşı gen ifadesinin düzenlenmesinde rol oynamaktadır. Model bitkiler dışındaki farklı bitki türlerinde stres uygulamalarının hedef genlerdeki histon modifikasyonu seviyelerini ne şekilde etkilediği hala bilinmemektedir. Tez çalışmamızda 0, 250 ve 500 mM NaCl uygulanan Beta vulgaris (şeker pancarı) ve tuza toleranslı akrabası Beta maritima (yabani pancar) bitkilerinde büyüme parametreleri, bağıl su içeriği (RWC), yaprak ozmotik potansiyeli, fotosentez, lipid peroksidasyonu, peroksidaz (POX) enzim aktivitesi, POX trankripsiyon düzeyleri, POX geninde H3K9 ve H3K27 asetilasyon seviyeleri incelendi. Çalışmamızda tuz uygulanan B.vulgaris ve B.maritima bitkilerinde süperoksit dismutaz (SOD), peroksidaz (POX), askorbat peroksidaz (APX), katalaz (CAT) ve glutatyon redüktaz (GR) antioksidan enzimlerini kodlayan genlerin düzenlenmesinin histon modifikasyonları ile ilişkisinin incelenmesi hedeflendi. Tuz stresi koşullarında POX enzimini kodlayan gende H3K9 ve H3K27 asetilasyon seviyeleri ChIP (kromatin immünopresipitasyon) ve kantitatif real time-PCR yöntemleri ile analiz edildi. H3K9 ve H3K27 asetilasyonlarının POX gen ifadesi ile ilişkili olduğu saptandı. Tuz uygulamalarının B. maritima'da H3K9 ve B. vulgaris'de ise H3K27 asetilasyon düzeylerini arttırdığı tespit edildi.

Özet (Çeviri)

Histone acetylation have functions in responses of plants to environmental stress. It is still unknown the levels of histone modifications on target genes in different plant species other than model plants under various environmental stress factors. In this work, we investigated the effects of 0, 250 and 500 mM NaCl concentrations on growth parameters, leaf osmotic potential, chlorophyll fluorescence, relative water content (RWC), lipid peroxidation, peroxidase (POX) enzyme activity, POX relative transcript abundance, H3K9 and H3K27 acetylation levels of POX gene in Beta vulgaris (sugar beet) and salt tolerant Beta maritima (wild beet). We aim to indicate the relationship between histone modifications and expression of five genes that encode antioxidant enzymes such as superoxide dismutase (SOD), peroxidase (POX), ascorbate peroxidase (APX), catalase (CAT) and glutathione reductase (GR) in NaCl treated two beet species, B. vulgaris and B. maritima. In this study, we analyzed the levels of H3K9ac, and H3K27ac on the beet POX gene under salinity by ChIP procedure combined quantitative real-time PCR. H3K9 and H3K27 acetylations were found to be correlated with expression of POX gene. We found that the levels of H3K9 acetylation in B. maritima and H3K27 acetylation in B. vulgaris were increased after NaCl treatment.

Benzer Tezler

  1. Tuz stresi koşullarında fotorespirasyon ve GABA yolu arasındaki ilişkinin incelenmesi

    Understanding the relation between photorespiration and GABA shunt under salt stress conditions

    MERVE KAHRAMAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyolojiEge Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MELİKE BOR

  2. Şeker pancarında (Beta vulgaris L.) çinko ve rizobakteri uygulamasının verim ve kalite üzerine etkileri

    The effects of zinc and rhizobacteria on the production and quality of sugar beet (Beta vulgaris L.)

    GÜLNUR SAMATLI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    ZiraatErciyes Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AZİZ ŞATANA

  3. The effects of seed priming treatments on seedling quality and performance in sugar beet

    Şeker pancarı tohumlarında priming uygulamalarının fide kalitesi ve performansı üzerine etkileri

    HARUN MERAL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    ZiraatKonya Gıda ve Tarım Üniversitesi

    Bitkisel Üretim ve Teknolojileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜSEYİN ÖZKAN SİVRİTEPE

  4. Salt stress responsive proteins identification in wild sugar beet (Beta maritima) by mass spectrometry

    Yabani şeker pancarında (Beta maritima) tuza duyarlı proteinlerin kütle spektrometre kullanılarak tanımlanması

    EMİNE PINAR BAYDARA

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2008

    Kimyaİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TALAT YALÇIN

    YRD. DOÇ. DR. H. ÇAĞLAR KARAKAYA

  5. Farklı bitkilerin antioksidan aktivitelerinin belirlenmesi

    Determination of antioxidant activities of different plants

    DUYGU ELİF BİLGE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    KimyaSakarya Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLNUR ARABACI