HIV-1'e karşı direnç sağlayan CCR-5Δ32, CCR2-64I ve SDF1-3'A Allellerinin türk popülasyonundaki dağılımı
Distribution of the HIV-1 resistance-conferring Alleles CCR5-Δ32, CCR2-64I ve SDF1-3'A in turkish population
- Tez No: 409911
- Danışmanlar: PROF. DR. İSMET BERBER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sinop Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 122
Özet
İnsan immün yetmezlik virüsü HIV-1'in neden olduğu AIDS tüm dünyada hızla yayılmaya devam etmektedir. Yapılan tüm çalışmalara rağmen virüsü tamamen yok edecek bir tedavi bulunamamıştır. HIV-1 virüsü genetik yapısını değiştirme yeteneğine sahip olduğu için virüse karşı geliştirilen aşıların tamamı başarısız olmuştur. Bununla birlikte CCR5, CCR2 ve SDF1 genlerinde meydana gelen CCR5-Δ32, CCR2-64I ve SDF1-3'A genetik polimorfizmlerinin HIV enfeksiyonuna karşı koruyucu ve AIDS progresyonunu yavaşlatıcı bir etki sağladıkları gösterilmiştir. Bu çalışmada, Sinop bölgesinden 205 sağlıklı gönüllü bireye ait kan örneklerinden tuzla çöktürme metodu ile elde edilen genomik DNA'lar PCR ve PCR-RFLP yöntemleriyle incelenmiştir. CCR5-Δ32, CCR2-64I ve SDF1-3'A polimorfizmlerinin allel frekansları hesaplanarak Türk popülasyonunun HIV/AIDS'e karşı genetik yatkınlığı değerlendirilmiştir. Popülasyonda bu genlerin allel sıklıkları CCR5-Δ32, CCR2-64I ve SDF1-3'A için sırasıyla %3.17, %17.80 ve %27.07 olarak bulunmuştur ve gözlenen genotip sıklıkları Hardy-Weinberg dengesiyle uyumludur. CCR5-Δ32 allel sıklığı Avrupa ülkeleriyle karşılaştırıldığında nispeten daha düşük olmakla birlikte Asya ve Afrika ülkelerindeki sıklıktan daha yüksektir. CCR2-64I ve SDF1-3'A allel sıklıkları farklı kıtalardaki birçok ülke ve etnik grupla paralellik göstermektedir. Araştırılan polimorfizmin allel sıklıkları komşu ülkeler Yunanistan, Girit, Kıbrıs Yunanlıları ve Bulgaristan ile benzerdir. Tıp dünyası bireysel genetik yapıya göre teşhis ve tedavi yöntemleri uygulamalarına ağırlık vermeye başlamıştır. Genetik polimorfizmlerin araştırılması Türk popülasyonunda HIV-1 enfeksiyonuna karşı yüksek risk taşıyan bireylerin belirlemesi ve HAART tedavisinin gelecekteki bireyselleşmesini etkileyebilme potansiyeli açısından önem taşımaktadır.
Özet (Çeviri)
AIDS caused by Human Immunodeficiency Virus-1 (HIV-1) has continued to spread rapidly throughout the world. Despite all conducted studies, no treatment that can eradicate the HIV virus completely has been found. All of the vaccines developed against the virus failed since the virus is capable of changing its genetic structure. Besides, it has been shown that CCR5-Δ32, CCR2-64I, and SDF1-3'A genetic polymorphisms occurring on CCR5, CCR2, and SDF1 genes in human respectively provide effects that confer resistance to HIV infection and decelerate the progression of AIDS. In this study, genomic DNAs obtained from blood samples with salting-out method from 205 healthy volunteers of Sinop province were investigated by PCR and PCR-RFLP methods. The genetic liability of Turkish population was evaluated by calculating the allele frequencies of CCR5-Δ32, CCR2-64 and SDF1-3'A polymorphisms. Allele frequencies of these genes in the population were found as 3.17%, 17.80% and 27.07% respectively for CCR5-Δ32, CCR2-64I and SDF1-3'A and all the observed genotype frequencies were in accordance with Hardy-Weinberg equilibrium. CCR5-Δ32 allele frequency is relatively lower compared to European countries but higher compared to Asian and African countries. CCR2-64I and SDF1-3'A allele frequencies coincide with many countries and ethnicities in different continents. Allele frequencies of three polymorphisms investigated are similar with neighbour countries Greece, Crete, Greek Cypriots, and Bulgaria. The medical world has begun to focus on the diagnosis and treatment applications based on the individual genetic structure. Investigation of genetic polymorphisms is important in terms of identifying high-risk individuals for HIV-1 infection in Turkish population and potential of future individualization of HAART therapy.
Benzer Tezler
- Türkiye'de HIV'e direnç ile ilgili mutant CCR5-?32 allel sıklığının araştırılması
Investigation of the frequency of mutant CCR5-?32 allel related to HIV resistance in Turkey
GAMZE KARAKAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
BiyolojiKırıkkale ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞÜKRAN ÇAKIR ARICA
- Investigation of the effects of SIV AGM Tat protein on SLPI gene expression in primate cells
SIV AGM Tat proteininin primat hücrelerindeki salgısal lökosit proteaz inhibitörü geni ifadelenmesi üzerindeki etkisinin incelenmesi
DİLARA DEMİRCİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
Genetikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ALPER ARSLANOĞLU
- Investigation of the interaction and oligomerization of HIV capsid and single domain antibody as a biotechnological drug against HIV
HİV'e karşı biyoteknolojik ilaç olmak üzere HİV kapsit ve tek bölgeli antikorun etkileşimi ve oligomerizasyonun incelenmesi
SENİHA GÜNEY
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Biyomühendislikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ HÜMEYRA TAŞKENT SEZGİN
- Synthesis of quaternary poly(4-vinyl pyridine) based submicron particles for preparing biocidal dispersions and permanent antibacterial cotton fabrics
Biyosidal dispersiyonların ve kalıcı antibakteriyel kumaşların hazırlanması için kuaterner poli(4-vinil piridin) esaslı mikronaltı taneciklerin sentezi
BERKAY DEMİRALP
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
Kimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİYAZİ BIÇAK
- Sağlıklı bireylerdeki kemokin reseptörlerinde meydana gelen gen polimorfizmi nedeni ile oluşan HIV direncin saptanması
Detection of HIV resistance due to gene polymorphismin chemokine receptors in healthy individuals
ŞAHAP AKSAÇLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Moleküler TıpYeditepe ÜniversitesiMoleküler Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLDEN ÇELİK