Bağlı veri ile istenmeyen ilaç etkileşimlerinin tespiti için bir sistem
A system for the detection for the detection of adverse drug interaction with linked data
- Tez No: 411336
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. AHMET EGESOY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Computer Engineering and Computer Science and Control
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 82
Özet
Potansiyel İlaç-İlaç Etkileşimlerinin (İİE) tespiti ilaç yönetimi ve ilaç gelişmeleri ile ilgili maliyetleri ciddi bir şekilde azaltabilir. Ayrıca ölüme neden olan ciddi advers ilaç reaksiyonlarını önleyebilir ve ilaçların yeniden konumlandırılması (ilacın başka bir amaç için kullanılması) hususunda da önemli ilerlemeler sağlayabilir. Bu tez İİE'leri tahmin etmek için iki farklı çözüm önerisi sunmaktadır. İlk olarak İİE ağının ilaç benzerlik skorları ile ağırlıkladırılmasıyla oluşan yapının İİE tahminine olan etkisi incelenmiş. Daha sonra ise bu ağa ilaç-hedef verisinin eklenmesiyle oluşan heterojen ağın İİE tahminine etkisinin belirlenmesi hedeflenmiştir. Değerlendirme ölçütü olarak AUC ve Hassasiyet kullanılmıştır. Drugbank veri setinden elde edilen homojen İİE ağları üzerinde hem AUC hem de Hassasiyet açısından önemli performans artışı elde ettik. Ayrıca İlaç-hedef bilgisinin ve İİE ağının oluşturduğu heterojen ağ ise ağırlıklı ve ağırlıksız olarak iki şekilde test edilmiştir. Sonuç olarak heterojen ağ üzerinde İİE tahmininin arttığı gözlemlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Detection of potential Drug-Drug Interactions (DDI) can reduce the costs associated drug administration and drug development. It can also prevent serious adverse drug reactions possibly causing death and it may enable advances in drug repurposing (using drug for different purposes). This thesis purposes two different solutions for prediction of DDI. In first part the effect of the DDI network weighted by drug similarity scores on DDI prediction has been investigated. Then, the effect of the heterogeneous network combined with the drug-target data has been investigated. AUC and Precision has been used as evaluation metrics. Significant performance enhancement has been obtained both in terms of AUC and Precision on DDI networks extracted from Drugbank. In addition to this heterogenous network formed by drug-target knowladge and DDI network were tested as weighted and unweighted forms. Consequently it has been obseved that DDI prediction on heterogenius network has been increased.
Benzer Tezler
- Kanser ve bağışıklık hastalıklarında hedef olan TIPE2 and PAK1 ve pak1 proteinleriyle olan etkileşimlerinin moleküler seviyede ve dinamik olarak incelenmesi
Molecular and Dynamic Investigation of the Interactions of RAC1, a Target in Cancer and Immune Diseases, with TIPE2 and PAK1 Proteins
HACI ASLAN ONUR İŞCİL
Yüksek Lisans
İngilizce
2025
Biyofizikİstanbul Medeniyet ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SALİHA ECE ACUNER ZORLUUYSAL
- Developing a process mining-based model for detecting patient safety errors in healthcare
Sağlık sektöründe, hasta güvenliğine yönelik hataların tespit edilmesinde süreç madenciliğine dayalı bir model geliştirilmesi
AHMET MURAT SÜMER
Doktora
İngilizce
2025
Endüstri ve Endüstri Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiEndüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. CEMİL CEYLAN
- Automatic determination of plant type and phenological stage with deep learning methods
Tarla görüntülerinden bitki türü ve fenolojik evresinin derin öğrenme yöntemleri ile otomatik saptanması
AIGERIM KAIROLDAYEVA
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİstanbul Teknik ÜniversitesiBilgisayar Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ULUĞ BAYAZIT
- Ankara ilinde reçetelenen ilaçlara bağlı istenmeyen etkilerin izlenmesi ve farmakovijilans konusunda farkındalığın artırılması
Monitoring the unintended effects of prescribed drugs in Ankara and improving the awareness of pharmacovigilance
NERGİZ TEMİZ NEMUTLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Eczacılık ve FarmakolojiHacettepe ÜniversitesiFarmasötik Toksikoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BELMA KOÇER
- İnsan hareketlerinin takibinde karşılaşılan problemlerin çözümüne yeni yaklaşımlar
New approaches to solve encountered problems in tracking of human movements
MUHAMMED FATİH TALU
Doktora
Türkçe
2010
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolFırat ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İBRAHİM TÜRKOĞLU
PROF. DR. MEHMET CEBECİ