Geri Dön

Klinik Staphylococcus aureus izolatlarının identifikasyonu, antibiyotik direnç özelliklerinin moleküler olarak belirlenmesi ve plazmit içeriklerinin tespit edilmesi

The identification of clinical isolates of Staphylococcus aureus, molecular determination of antibiotic resistance and detection of plasmid content

PDF İndir

  1. Tez No: 415179
  2. Yazar: ZERİFE ORHAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MURAT ARAL
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyomühendislik, Mikrobiyoloji, Bioengineering, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2015
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 179

Özet

Staphylococcus aureus, tüm dünyada hem toplum kaynaklı hem de hastane kaynaklı enfeksiyonlara yol açan tehlikeli bir patojendir. Hastane enfeksiyonları arasında Staphylococcus aureus en yüksek morbidite ve mortaliteye neden olan ajandır. Günümüzde Staphylococcus aureus'un birçok antibiyotiğe direnç gösteren izolatlarının ortaya çıkması çoğu hastane için önemli bir sorun haline gelmiştir. Bu durum tedavi seçeneklerini büyük ölçüde sınırlamaktadır. Özellikle de metisiline direncin heterojen olması nedeniyle fenotipik yöntemler ile tespitte problemler olabilmektedir. Bu çalışmada Staphylococcus aureus izolatlarındaki antibiyotik direncinin moleküler olarak daha hızlı ve güvenilir bir şekilde tespit edilmesi amaçlanmıştır. Ocak-Ekim 2014 tarihleri arasında Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarına çeşitli kliniklerden gönderilen örneklerden, standart bakteriyolojik yöntemlerle izole edilen 100 Staphylococcus aureus izolatı kullanılmıştır. Tüm izolatların antbiyotik direnci ve plazmit içerikleri araştırılmıştır. Staphylococcus aureus izolatlarının farklı antibiyotiklere (gentamisin, penisilin, oksasilin, trimetoprim-sulfametoksazol, vankomisin, klindamisin, eritromisin, fusidik asit, linezolid, yüksek düzey mupirosin, siprofloksasin, rifampin, tetrasiklin ve kinupristin-dalfopristin) duyarlılıkları BD phoenix otomatik mikrobiyoloji sistemi ile belirlenmiştir. Metisilin direnci sefoksitin diski kullanılarak disk difüzyon testi ile de araştırılmıştır. Ayrıca dirençten sorumlu olan hedef genler ise gentamisin (aac(6')/aph(2'')), penisilin (blaZ), oksasilin (mecA, femA), trimetoprim- sulfametoksazol (dfrA), vankomisin (vanA, vanB), eritromisin (ermA, ermB, ermC ve msrA), fusidik asit (fusA, fusB, fusC), linezolid (cfr), yüksek düzey mupirosin (ileS-2), siprofloksasin (gyrA, gyrB), rifampin (rpoB), tetrasiklin (tetK, tetM) ve kinupristin-dalfopristin (vatA, vatB, vatC) polimeraz zincir reaksiyonu yöntemiyle araştırılmıştır. Staphylococcus aureus izolatlarındaki antibiyotik direnç oranları phoenix yöntemi ile sırasıyla gentamisin %2, penisilin %100, oksasilin %19, sefoksitin %19 (disk difüzyon yöntemi), trimetoprim- sulfametoksazol %1, klindamisin %25, eritromisin %26, yüksek düzey mupirosin %2, siprofloksasin %6, rifampin %9 ve tetrasiklin %18 olarak belirlenmiştir. Vankomisin, fusidik asit, linezolid ve kinupristin-dalfopristin dirençleri tespit edilmemiştir. Moleküler verilere göre ise direnç sırası ile aac(6')/aph(2'') %2, blaZ %100, mecA %19, femA %100, dfrA %1, ermA %6, ermC %27, fusA %98, fusC %1, gyrA %100, gyrB %100, rpoB %100 ve tetK %17, tetM %3 olarak belirlenmiştir. Fakat potansiyel antibiyotik ilişkili vanA, vanB, ermB, msrA, fusB, cfr, ileS-2, vatA, vatB ve vatC'de direnç genleri PCR ile tespit edilmemiştir. Plazmid içerikleri araştırıldığında, toplam 79 izolatta plazmit tespit edilirken, bunların 62'sinde bir plazmit, 13'ünde iki ve dördünde ise üç farklı büyüklükte plazmit tespit edilmiştir.

Özet (Çeviri)

Staphylococcus aureus is a dangerous pathogen causing both community-based and nosocomial infections in all around the world. Staphylococcus aureus is an agent that causes the highest morbidity and mortality among the nosocomial infections. These days, the emergence of Staphylococcus aureus isolates which is resistant to many antibiotics has become a serious problem for most hospitals. This case reduces the treatment options to this pathogen significantly. Especially, heterogeneous resistances to methicillin phenotypic methods are limited capacity to identify this strain. In the present study, antibiotic resistance of Staphylococcus aureus is aimed to detect using quick and reliable molecular method. 100 isolates of Staphylococcus aureus that isolated by standard bacteriologic methods from different clinical isolates that sent to Medical Microbiology Laboratory of Kahramanmaras Sutcu Imam University at the period of January-October 2014 were used in this study. Antibiotic resistance and plasmid content was investigated in all isolates. The antibiotics resistance and plasmid content of all isolates were performed. The sensitivity of Staphylococcus aureus isolates to different antibiotics (gentamicin, penicillin, oxacillin, trimethoprim-sulfamethoxazole, vancomycin, clindamycin, erythromycin, fusidic acid, linezolid, high-level mupirocin, ciprofloxacin, rifampin, tetracycline and quinupristin-dalfopristin) is determined by BD Phoenix automated microbiology system. Methicillin resistance test was done using cefoxitin disk. In addition, the target genes those responsible for the resistance gentamicin (aac (6')/aph (2')), penicillin (blaZ), oxacillin (mecA, femA), trimethoprim-sulfamethoxazole (dfrA), vancomycin (vanA, vanB), erythromycin (ermA, ermB, ermC and msrA), fusidic acid (fusA, fusB, fusC), linezolid (cfr), high-level mupirocin (ileS-2), ciprofloxacin (gyrA, gyrB), rifampin (rpoB), tetracycline (tetK, tetM) and quinupristin-dalfopristin (vatA, vatB, vatC)) was investigated using polymerase chain reaction method. Antibiotic resistance ratios obtained from isolates of Staphylococcus aureus by phoenix method; Gentamicin 2%, penicillin 100%, oxacillin 19%, trimethoprim-sulfamethoxazole 1%, vancomycin 0%, clindamycin, 25%, erythromycin 26%, high level mupirocin 2%, ciprofloxacin 6%, rifampin 9% and tetracycline 18% correspondingly. According to molecular results, resistance based on gene existing were determined in aac(6')/aph(2'') 2%, blaZ 100%, mecA 19%, femA 100%, dfrA 1%, ermA 6%, ermC 27%, fusA 98%, fusC 1%, gyrA 100%, gyrB 100%, rpoB 100% and tetK 17%, tetM 3% ratios but the potential antibiotic responsible genes, vanA, vanB, erm, B msrA, fusB, cfr, ileS-2, vatA, vatB and vatC were not detected by PCR. When plasmid contents of isolates were analyzed, 79 isolates were carrying various numbers of plasmid. Only one plasmid was isolated in 62 isolates, two plasmids in 13 and three plasmids in four isolates.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    195129

    Hacettepe üniversitesi erişkin hastanesinde 2004-2005 yıllarında hastane kaynaklı infeksiyonlardan izole edilen metisiline dirençli staphylococcus aureus (mrsa) suşlarının moleküler tiplendirmesi

    Molecular characteristics of hospital-acquired methicillin-resistant staphylococcus aureus isolated at hacettepe university adult hospital in 2004-2005

    HADİM AKOĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıHacettepe Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. PINAR ZARAKOLU

    PROF.DR. SERHAT ÜNAL

  2. Tez No

    827457

    Mastitisli ineklerden staphylococcus aureus'un moleküler identifikasyonu ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi

    The molecular identification of staphylococcus aureus from cows with mastitis and determination of antibiotic susceptibilies

    İLKER KURT

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiAydın Adnan Menderes Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. UĞUR PARIN

  3. Tez No

    412466

    Çeşitli klinik örneklerden izole edilen metisiline dirençli stafilokoklarin identifikasyonu ve stafilokokkal kaset kromozom mec (SCCMEC) tiplerinin belirlenmesi

    Identification and staphylococcal caset chromosome mec (SCCMEC) typing of staphylococci isolated from various clinical samples

    TUBA VİLKEN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEZAHAT GÜRLER

  4. Tez No

    510000

    Staphylococcus aureus izolatlarında antibiyotik duyarlılığının belirlenmesi

    Determination of antibiotic susceptibility of Staphylococcus aureus strains

    TAHA SELÇUK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    MikrobiyolojiErzincan Binali Yıldırım Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AYTEKİN ÇIKMAN

  5. Tez No

    697809

    Yayla kekiği bitki ekstraktı ile çinko oksit nanopartikülünün (Zno Np) yeşil yöntem kullanarak sentezi ve subklinik mastitisli sütlerden izole edilen Staphylococcus aureus üzerine antimikrobiyel, antioksidan etkilerinin araştırılması

    Green synthesis of zinc oxide nanoparticles using origanum minutiflorum plant extract and their antibacterial, antioxidant activities on staphylococcus aureus isolated from subclinical mastitis

    MEHMET ALİ BOZKURT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Veteriner HekimliğiBurdur Mehmet Akif Ersoy Üniversitesi

    Gıda Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ERHAN KEYVAN

    DOÇ. DR. SONER DÖNMEZ

Geri Dön