Genetic mapping in almond using 'Gülcan-2 x Lauranne' and 'Guara x Nurlu' F1 populations by SSR markers
Bademde Gülcan-2 x Lauranne ve Guara x Nurlu F1 populasyonları kullanılarak SSR markörlerı İle genetık haritalaması
- Tez No: 430198
- Danışmanlar: PROF. DR. SALİH KAFKAS
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 94
Özet
Literatürde bademde bugüne kadar yayımlanan bir kaç tane SSR (Basit Dizi Tekrarları) tabanlı genetik haritalar bulunmaktadır. Ama, bu haritalardaki SSR markör sayısı yeterli değildir. Bu çalışmanın amacı Gülcan-2 x Lauranne' ve 'Guara x Nurlu' F1 populasyonlarını kullanarak bademde SSR makörleri ile iyi bir genetik harita oluşturmaktadır. Bu çalışmada farklı Prunus türlerinde geliştirilen toplamda 275 SSR primeri her iki populasyonda da test edilmiştir. Gülcan-2 x Lauranne' populasyonunda 175 SSR lokusu açılım gostermiş ve 162 SSR lokusu 8 bağlantı grubu üzerinde haritalanmıştır. Toplam harita uzunluğu 514.6 cM ve markörler arasındaki ortalama uzaklık 3.2 cM olarak belirlenmiştir. Bağlantı gruplarının ortalama uzunluğu 40,1 cM (LG6) ile 84.6 cM (LG1) arasında değişmiştir. Bağlantı gruplarındaki markör sayısı 12 (LG6) ile 29 adet (LG2) arasında değişmiştir. 'Guara x Nurlu' populasyonunda ise 159 markör açılım göstermiş ve 153 SSR lokusu haritalanmıştır. Toplam harita uzunluğu 493.9 cM ve markörler arasındaki ortalama uzaklık 3.2 cM olarak belirlenmiştir. Bağlantı gruplarının uzunluğu 49.8 cM (LG5) ile 85.1 cM (LG1) arasında değişmiş ve ortalamas LG uzunluğu 64.1 cM olmuştur. Bağlantı gruplarındaki markör sayısı 15 (LG4) ile 25 adet (LG2) arasında değişmiştir. Sonuç olarak, bu çalışmada bademde iki adet F1 populasyonunda SSR markör esaslı ebeveyn genetik haritaları ile birlikte populasyon haritaları da oluşturulmuştur. Bu genetik haritalar ekonomik öneme sahip fenotipik karakterlerin QTL (Kantitatif Özellik Lokusları) analizlerinde kullanılabilecek ve böylece ileride bademde yapılacak çeşit ıslah programlarında marköre dayalı seleksiyon (MAS) yapmak üzere DNA markörleri geliştirilebilecektir.
Özet (Çeviri)
There are several SSR (simple sequence reepat) based genetic linkage maps in almond in the literature. However, they have inadequate number of markers. The objective of this study was to construct well saturated, SSR-based genetic linkage maps using 'Gülcan-2 x Lauranne' and 'Guara x Nurlu' F1 populations in almond. A total of 275 SSR primer pairs selected from the previous studies from various Prunus species were tested in both populations. A total of 175 SSR loci segregated in 'Gülcan-2 x Lauranne' population and 162 SSR loci were mapped into eight linkage groups. The total map length was 514.6 cM, with an average marker density of 3.2 cM. The LG lengths varied from 40.1 cM (LG6) to 84.6 cM (LG1). The number of markers in eight LGs changed between 12 (LG6) and 29 (LG2). In 'Guara x Nurlu' population, 159 markers segregated and 153 SSR loci were mapped. The total map length was 493.9 cM with an average marker distance of 3.2 cM. The LG lengths varied from 49.8 cM (LG5) to 85.1 cM (LG1), and the average length was 64.1 cM. The number of markers changed between 15 (LG4) and 25 (LG2). In conclusion, individual parental maps and consensus SSR-based genetic linkage maps in almond were constructed in two F1 populations in this study. The maps can be used in QTL (Quantitative Trait Loci) analysis of economically important phenotypic characters in almond, and this may provide linked DNA markers for marker assisted selection (MAS) in cultivar breeding programs in the future.
Benzer Tezler
- Construction of high-density genetic linkage maps and QTL analysis in almond
Bademde yüksek yoğunlukta genetik haritanın oluşturulması ve QTL analizi
AIBIBULA PAIZILA
Doktora
İngilizce
2020
BiyoteknolojiÇukurova ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SALİH KAFKAS
- Şeftali (Prunus persica L.) transkripsiyon faktörü genlerinin karakterizasyonu, gen-spesifik markör dizaynı ve türler arası transfer analizleri
Characterization of peach (Prunus persica L.) transcription factor genes, gene-spesific marker design and interspesific transferability analyses
CANSU YÜRÜKÇÜ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyoteknolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞE ÖZGÜR UNCU
- Antepfıstığında Siirt x bağyolu f1 populasyonu kullanılarak SSR markörleri ile genetik haritalama
Genetic mapping in pistachio using Siirt x bağyolu population by SSR markers
MERYEM AYLİN AKYÜZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
BiyoteknolojiÇukurova ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SALİH KAFKAS
- Amasya elmasında SSR markörleri ile genetik haritalama
Genetic mapping in Amasya apple by SSR markers
NERGİZ ASLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
ZiraatÇukurova ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SALİH KAFKAS
- Yulaf genetik haritalama popülasyonu ogle1040 / tam O-301'in yağ içeriği ve yağ asidi kompozisyonlarının belirlenmesi
Oat population genetic mapping ogle 1040 / full determination of O-301 oil content and fatty acid composition
HİLAL KARAKUZULU
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BiyoteknolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ZİYA DUMLUPINAR