Malign plevral mezotelyomanın patogenezinde ailesel yatkınlığın genetik analizi
Pathogenesis of malignant pleural mesothelioma in familial predisposition genetic analysis
- Tez No: 447526
- Danışmanlar: DOÇ. DR. GÜNTÜLÜ AK
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Göğüs Hastalıkları, Genetik, Chest Diseases, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Aile, Akciğer neoplazmları, Genetik, Genom, Mezotelyoma, Neoplazmlar, Patojenler, Plevra, Family, Lung neoplasms, Genetics, Genome, Mesothelioma, Neoplasms, Pathogens, Pleura
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Göz Hastalıkları Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Malign mezotelyoma (MM) %90'ı plevral kaynaklı olmak üzere plevra, periton ve perikardın seröz yüzeylerinden ve nadiren testiste tunika vajinalisten gelişen malign bir tümördür. Populasyonda nadir görülen bu tümörün günümüzde standart ve küratif bir tedavisi olmayıp prognozu tüm çabalara rağmen iyi değildir. MPM'nın etiyolojisinde rol oynayan önemli ve etyolojik ilişkinin iyi tanımlandığı iki faktör; asbest ve erionittir. Mezotelyoma etyolojisinde tartışılan diğer faktörler radyasyon, SV 40 virüsü ve genetik yatkınlıktır. Mezotelyomada genetik yatkınlık, hastalığın endemik olduğu bölgelerde bazı ailelerde birden fazla aile bireyleri hastalıktan etkilenirken bazı ailelerin hiç etkilenmemesinden dolayı öne sürülmüştür. Genetik yatkınlık fikrinden yola çıkarak tarafımızca tanı konulan aile A'da iki, aile B'de dört, aile C'de iki ve aile D'de iki olmak üzere, toplamda on bireyden oluşan akraba mezotelyoma grubunun periferik kanlarından izole edilen DNA aracılığıyla tüm genom dizileme analizi yapılmıştır. Bu analiz sonucunda on bireyde ortak 8622 varyant saptanmıştır. Biyoinformatik analiz kullanılarak on bireydeki ortak gen mutasyonları filtrelenmiştir. Bu filtrelemeden sonra geriye kalan varyantlardaki; populasyonda çok nadir görülen ve hasar verici gen mutasyonları seçilmiştir. Toplamda on beş kromozomda, otuz yedi gen üzerinde yüz yirmi varyant saptanmıştır. Bu genler arasında mezotelyoma gelişimi ile direk ilişkili PIK3/AKT yolağı üzerinde etkili PIK3R4 geni üzerinde bir adet kompleks mutasyon saptanmıştır. Bunun dışında diğer 36 genin kanser ile ilişkisi literatürde sorgulandığında çalışmamızda on iki gen daha dikkat çekmektedir. Bunlar; SLC25A5, ITGB6, PLK2, RAD17, HLA-B, HLA-DRB1, HLA-DQB1, GRM, IL20RA, MAP3K7, RIPK2, MUC16'dir. Bulunan gen bölgelerinin hasta bireylerin sağlam birinci derece akrabalarında da taranması için ek çalışmalara ihtiyaç vardır.
Özet (Çeviri)
Malignant mesothelioma which devoloped from pleura, peritoneum, pericardium serous surface and rarely the tunica vaginalis and testes, is a mortal malignant tumors. This tumor is rare in the normal population. Despite all efforts today the standard and curative therapy isn't found and the prognosis isn't good. The most important and best-identified role in the etiology of MPM is asbestos and erionite. Radiation, SV40 virus and a genetic predisposition are other etiologic factors. Mesothelioma genetic predisposition has been suggested that in the endemic regions in some families multiple family members are affected by the disease in contrast some families are not affected. Based on the genetic predisposition idea by us diagnosed and followed a total of ten individuals of relatives mesothelioma group created (two individuals from family A, four from family B, two from family C, two from family D). Then DNA isolated from peripheral blood and was made whole genome sequencing analysis. 8622 common variants have been identified in ten individuals with this analysis. Common gene mutations in ten individuals were filtered using bioinformatics. After this filter in the remaining variants; very rare in the population and damaging mutations are selected. In total one hundred twenty variants were found on thirty-seven genes in fifteen chromosomes. Our finding PIK3R4 gene is directly associated with mesothelioma development. In this gene which is effective on PIK3 / AKT pathway, one complex mutations are detected. Other Thirty-six genes have been questioned relations with cancer in the literature. Twelve genes, which are associated with cancer, were detected in literature. These genes are SLC25A5, ITGB6, PLK2, RAD17, HLA-B, HLA-DRB1, HLA-DQB1, GRM, IL20RA, MAP3K7, RIPK2, and MUC16. Additional studies, which scanned in first-degree relatives of individual, are needed to found the specific gene region.
Benzer Tezler
- Malign plevral mezotelyomada pp2a inhibitörlerinden CIP2A ve ANP32E'nin ekspresyonu ve prognoza etkisi
Expression of PP2A inhibitors CİP2A and ANP32E in malignant pleural mesothelioma and their effects on prognosis
SEMA KÖSE
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
PatolojiKütahya Sağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FİGEN ASLAN
- Malign plevral mezotelyomalı hastalarda inflamasyon skorları ile prognoz ve tedavi yanıtının değerlendirilmesi
Evaluation of prognosis and treatment response with inflammation scores in patients with malignant pleural mesothelioma
SEDA DOĞAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
İç HastalıklarıGazi Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OZAN YAZICI
- Mezotelyomalı olgulara özgü genetik değişikliklerin tüm genom çapında snp array yöntemi kullanılarak araştırılması
Genome-wide scanning of malignant mesothelioma cases with snp array method
TUNÇ TUNCEL
Doktora
Türkçe
2018
Tıbbi BiyolojiEskişehir Osmangazi ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN VEYSİ GÜNEŞ
- Malign plevral mezotelyomalarda doku mikroarray yöntemiyle immünprofilin incelenmesi
A tissue microarray analysis of immunohistochemical profile in malignant mesothelioma
EDA AKPINAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
PatolojiAnkara ÜniversitesiPatoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERPİL DİZBAY SAK
- Malign plevral mezotelyomalı hastaların tedavi takibinde biyomarkırların rolü: Boylamsal analiz
The role of biomarkers in treatment follow-up of malignant pleural mesothelioma patient: Longitudinal analysis
FİLİZ BOĞAR
Doktora
Türkçe
2020
BiyolojiEskişehir Osmangazi ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ADNAN AYHANCİ
PROF. DR. GÜNTÜLÜ AK