Geri Dön

Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi'nde saptanan hıv-1 izolatlarında sekans analizi yöntemi ile alt grupların saptanması

The determination of sub-groups of hiv-1 isolates with method of the sequence analysis which is detected in Faculty of Medicine Hospital of Gaziantep University

PDF İndir

  1. Tez No: 455227
  2. Yazar: İHSAN DEVECİ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. YASEMİN ZER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2016
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 91

Özet

Keşfedileli çok az zaman olmuş olmasına rağmen Human Immunodeficiency Virus(HIV) günümüzde enfeksiyon hastalıkları etkenleri içerisinde önemli bir yere oturmuştur. Özellikle CD4+T lenfositleri hedef alan virüsün, sahip olduğu bazı enzimatik mekanizmalarla konak hücre DNA'sına integre olmasıyla seyreden süreç, virüsün tüm bağışıklık mekanizmalarını yetersiz hale getirmesi, ardından gelişen malignite ve enfeksiyonlar ile hastanın ölümüne kadar giden bir seyir göstermektedir. Virüsün HIV-1 ve HIV-2 olarak iki alt türü tanımlanmış olup, coğrafik olarak dünya üzerindeki dağılımları farklılık göstermektedir. Gaziantep ili son yıllarda göçmen hareketliliğinin sık rastlandığı illerden biri olup, bu çalışma ilimizde saptanan HIV izolatlarının alt-tür dağılımının belirlenmesi ve HIV enfeksiyonlarındaki epidemiyolojik bulguların (bulaş kaynağı, yaş dağılımı, vb.) irdelenmesi amacıyla yapılmıştır. Mart-Kasım 2015 tarihleri arasında laboratuarımıza HIV RNA testi çalışılması amacıyla gönderilen ve RNA testi >1000 kopya/mL olarak saptanan 35 hasta çalışmaya dahil edildi. HIV-1 RNA testi real-time PCR ile QIAsymphony SP/Artus HIV-1 QS-RGQ Kit (QIAGEN GmbH, Almanya), kiti kullanılarak yapıldı. Çalışmaya dahil edilen hastalardan 2'sinde amplifiye edilen RNA dizileri, sekans için uygun olmadığından 33 örnekte sekanslama yapılarak subtip analizi ve filogenetik değerlendirme yapıldı. HIV-1 (ters transkriptaz domaini, kodon 41-232) dizilenmesinde, TheFrench ANRS (National Agency for AIDS Research) AC11 Direnç Grubu'nun PCR ve dizileme algoritmasından yararlanıldı. Filogenetik analiz çalışmaları sonucunda HIV-1 subtiplendirmesi sonucunda 33 hastanın 22'si (% 66.6) subtip B olarak saptanmıştır. Hastaların 7'sinde (% 21.21) subtip A1 saptanmıştır. Hastaların 3'ünde (% 9.09) CRF02_AG olarak saptanmıştır. Bir (% 3.03) hastada ise subtip C olarak saptanmıştır. Dünya üzerinde eskiye oranla sık yaşanan insan hareketliliğinin, enfeksiyon etkenlerinin dağılımına da etkisi olacağından, HIV'in subtip analizlerinin yapılması virüsün yayılımını gözlemlemek açısından önemlidir.

Özet (Çeviri)

Although it has discovered currently Human Immunodeficiency Virus has an important place among the agents of infectious diseases today. Especially the process beholding the integration to host cell DNA by some enzymatic mechanisms of the virus in particular targets CD4 T lymphocytes indicates a trend leading up the patient's death by making all the immune mechanism deficient, developing malignancy and infections. The virus has two sub-types such as HIV-1 and HIV-2 that the geographical distributions in the world of these have differences. This study was conducted to determine the distribution of sub-species of HIV isolates and to examine the epidemiological findings (transmission source, age distribution, etc.,) in HIV infections detected in Gaziantep which is one of the provinces that has frequent immigrant mobility in recent years. A total of 35 patients sent to our laboratory between March and November 2015 for HIV RNA testing and having the RNA test results of >100 copies/mL were included in the study. HIV-1 RNA test was conducted with real-time PCR by using QIAsymphony SP/Artus HIV-1 QS-RGQ Kit (QIAGEN GmbH, Germany). Since the amplified RNA sequences are not suitable for sequencing in 2 patients included in the study, sub-type analysis and phylogenetic evaluation were performed in 33 samples by sequencing. In the sequencing of HIV-1 (reverse transcriptase domain, cord 41-232) the PCR and sequencing algorithm of“The French ANRS (National Agency for AIDS Research) AC11 Resistance Group”was used. As a result of the phylogenetic analysis in order to determine the sub-types of HIV-1 22 of 33 patients (66.6%) found as sub-type B. In 7 patients (21.21%) A1 subtype was determined. In 3 patients (9.09%) CRF02_AG was determined. In 1 patient (3.03%) C subtype was determined.Since the frequent human mobility compared to the past has an affect on the distribution of infection agents, the sub-type analyzes of HIV are important for the observation of the distribution of virus.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    293615

    Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Merkezi Yoğun Bakım Ünitesi'nde saptanan kan dolaşımı enfeksiyonları ve risk faktörlerinin irdelenmesi

    Evaluation of blood stream infections and risk factors detected in Central Intensive Care Unit of Gaziantep University Medical Faculty

    AYNUR SÜNER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıGaziantep Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İLKAY KAROĞLAN

  2. Tez No

    870220

    Tiroidektomili hastaların nodüler durumlarına göre retrospektif analizi

    Başlık çevirisi yok

    OSMAN GÖKALP KOYUNCU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıGaziantep Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SUZAN TABUR

  3. Tez No

    359619

    Kan kültür sonuçlarını etkileyen faktörlerin değerlendirilmesi

    Evaluation of factors affecting results of blood cultures

    AYŞE BÜYÜKTAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MikrobiyolojiGaziantep Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YASEMİN ZER

  4. Tez No

    490012

    Gluten enteropati ile tırnak kapilleroskopi bulguları ve hastalık aktivasyonu arasındaki ilişki

    The relationship between gluten enteropaty and nailfold capillaryoscopy findings and disease activity

    BURAK OKYAR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    GastroenterolojiGaziantep Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ABDULLAH EMRE YILDIRIM

  5. Tez No

    224901

    Kanserli çocuklarda nötropenik ateş ampirik tedavisinde sefoperazon/sulbaktam ve meropenemin etkinlik ve maliyet analizi

    The effect of cefoperazone/sulbactam and meropenem ampırıc therapy ın neutropenıc fever of cancer and the cost analyses

    YILMAZ KÖR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıGaziantep Üniversitesi

    Pediatri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ELİF GÜLER

Geri Dön