Optimization of agrobacterium tumefaciens-mediated transformation in onion (Allium cepa L.)
Soğanlarda (Allium cepa L.) agrobacterium tumefaciens ile transformasyonunun optimizasyonu
- Tez No: 457237
- Danışmanlar: Assist. Prof. Dr. ALİ FUAT GÖKÇE
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışma,soğanda Agrobacterium tumefaciens aracılığıyla gerçekleştirilen transformasyona etki eden, farklı soğan çeşitleri, eksplant tipi, kallus indükleyici ve rejenerasyon ortamlarında kullanılan farklı bitki büyüme düzenleyicisi gibi faktörlerin optimize etmek amacıyla yürütülmüştür. LBA4404 Agrobacterium ırkıve pBIN19 ikili vektörü bitkileri enfekte etmekte kullanılmıştır. pBIN19 vektörü, aday transgenik sürgünleri erken aşamada teşhis etmek için kullanıla nuidA (intronlabölünmüş) geni ve kamaisine dirençlilği sağlayan nptII genini içermektedir. Yapılan çalışma sonunda, soğan transformasyonunun genotip ve eksplan tipine bağlı olduğun görülmüştür. 355 birincil transformantta yapılan PZR analizleri sonucu 87 bitkinin pozitif olduğu gözlenmiştir. Bu 87 bitkinin 51 tanesi Kral çeşidine aittir ve bu çeşidin genetik olarak geliştirilebilme potansiyelinin daha yüksek olduğunu göstermektedir. Moleküler analizlerlere (PZR) göre, transgenik bitki oluşturma sıklığı sırasıyla olgun embriyolar, tohumlar ve soğan tabanıdır. Literatür taramasında soğan tohumlarının eksplant olarak kullanıldığına dair bir çalışmaya rastlanmamıştır. Bu faktörlerin optimizasyonu soğana arzulanan özelliklerin aktarılmasında yeni bir kapı açacaktır.
Özet (Çeviri)
This systematic study was undertaken to optimize the various factors affecting Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation in onion, such as response of different onion cultivars, type of explants and composition of different plant growth regulators in callus inducing and regeneration media. Agrobacterium strain LBA4404 harboring binary vectorpBIN19 was used to infect explants. The pBIN19 vector contained uidA gene (interrupted by an intron) to identify putative transgenic shoots at earlier stage; it also contained nptII gene that encodes resistance against kanamycin. The results exhibited the genotype and explant dependency in onion transformation. Out of 355 primary transformants, 87 plants were recorded as positive when subjected to PCR assays; 51 belonging to cultivar Kral showing the tendency of genotype to genetic improvement. Molecular analysis (PCR) demonstrated that highest frequency of transgenic plants was contributed by mature embryos followed by seeds and basal plates. Onion seed as explant has been used for first time as no evidence in literature was found. The optimization of these factors in will provide a gateway to introduce any desired trait in onion.
Benzer Tezler
- Optimization of tissue culture, regeneration and Agrobacterium mediated transformation parameters in winter wheat cultivars (Kızıltan-91 and Bezostaja-01)
Kışlık buğdaylarda (Kızıltan-91 ve Bezostaja-01) doku kültürünün, rejenerasyonun ve agrobakteriuma dayalı transformasyon parametrelerinin optimizasyonu
MUSA KAVAS
Yüksek Lisans
İngilizce
2005
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. HÜSEYİN AVNİ ÖKTEM
PROF.DR. MERAL YÜCEL
- Optimization of regeneration and Agrobacterium mediated transformation of wheat (Triticum aestivum L.cv. Yüreğir 89)
Buğdayda (Triticum aestivum L.cv. Yüreğir 89) rejenerasyonun ve Akrobakteriuma dayalı transformasyonun optimizasyonu
DİDEM DEMİRBAŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2004
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MERAL YÜCEL
PROF. DR. HÜSEYİN AVNİ ÖKTEM
- Genetic transformation of lentil (Lens culinaris M. cv. Sultan.1) with a transcription factor regulator (MBF1c) and analysis of transgenic plants
Mercimeğin (Lens culinaris M. cv. Sultan.1) transkripsiyon faktör regülatör proteini (MBF1c) ile genetik transformasyonu ve transgenik bitkilerin analizi
HAMDİ KAMÇI
Doktora
İngilizce
2011
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiPROF. DR. MERAL YÜCEL
YRD. DOÇ. DR. UFK ÇELİKKOL AKÇAY
- Solanum lycopersicum L. bitkisi ile agroinfiltrasyon ve CRİSPR/Cas9 yöntemi kullanarak pds genini susturma çalışmaları
Utilizing agroinfiltration and CRİSPR/Cas9 method to silence studies the pds gene in Solanum lycopersicum L. plant
HALİME EDA SUBAŞI
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
GenetikGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YELDA ÖZDEN ÇİFTÇİ
- Development and optimization of agrobacterium-mediated transformation method for CRISPR/Cas9-based genome editing in banana plant
Muz bitkisinde CRISPR/Cas9 tabanlı genom düzenleme için agrobacterium aracılı dönüşüm yönteminin geliştirilmesi ve optimizasyonu
BESTE GELSİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2025
BiyolojiÜsküdar ÜniversitesiMoleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ CİHAN TAŞTAN