Maruldan izole edilen mikroorganizmaların biyokimyasal ve moleküler yöntemlerle tanılanması, fitaz ve kitinaz aktivitelerinin tayini
Biochemical and molecular identification, chitinase and phytase activity determination of microorganisms isolated from lettuce
- Tez No: 459063
- Danışmanlar: DOÇ. DR. NESLİHAN DİKBAŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Atatürk Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 73
Özet
Biyoteknoloji, günümüzde en popüler ve yeniliklere açık bilimsel alanların başında gelmektedir. Moleküler çalışmalar, mikrobiyal biyoteknoloji çalışmalarında çok önemli boyutlar kazanmıştır. Mikroorganizmalar sınıflandırılırken morfolojik, biyokimyasal ve moleküler yöntemler kullanılmaktadır. Yerel marketlerden elde edilen bozulmuş endüstriyel öneme sahip marul bitkilerinden mikroorganizmalar izole edildi ve saflaştırıldı. Tanılamak amacıyla bakteri izolatlarının yağ asidi metil ester profilleri belirlendi. Bu profiller doğrultusunda tanılamada MIS yöntemi kullanıldı. Hızla gelişen tanı yöntemlerinden biri olan moleküler yöntemler bakteri tanılanmasında en doğru sonuçları veren yöntemdir. Bakterilerin 16S rRNA gen bölgesinin çoğaltılmasını sağlayan evrensel primerler kullanılarak bu genin çoğaltılması ve sekanslanması, filogenetik çalışmalarda standard yöntem olarak kulanılmaya başlanmıştır. Sekans sonuçları BLAST'lama yapılarak kimlik tespitlemesi yapıldı. Sekans dizileri analizi sonucunda Bacillus pumilus, Bacillus suptilis, Bacillus thuringiensis, Bacilus creus, Chryseobacteriumindoltheticum, Bacillus amyloliquefaciens, Pectobacteriume carotovorum, Bacillus laevolacticus ve Bacillus safensis türleri tespit edildi. Bu türler filogenetik ağaç oluşturularak akrabalık ilişkilerine bakıldı. Son aşamada da bu bakterilerin kitinaz ve fitaz aktivitelerine bakılarak bozucu etkileri tespit edildi. Bu çalışmada, ekonomik öneme sahip marul bitkisinin iyi tarım uygulama metodlarına destek vermeye yönelik denemelerin ilk aşaması olan bozucu olduğu düşünülen bakterilerin izolasyonları ve identifikasyonlarının moleküler olarak tanılanması çalışmalarını içermektedir. Tanımlanan mikroorganizmalarda bazı ekstrasellüler ernzimlerin varlığı (Fitaz ve kitinaz) kalitatif olarak incelenmiştir.
Özet (Çeviri)
Biotechnology is currently the most popular scientific area open to innovations. Molecular studies have gained considerable importance in microbial biotechnology studies. Morphological, biochemical and molecular methods are used for the classification of microorganisms. Microorganisms were isolated and purified from deteriorated lettuce plants with industrial importance obtained from local markets. For identification, fatty acid methyl ester profiles of bacterial isolates were determined. The MIS method was used for identification in accordance with these profiles. Molecular methods, one of the rapidly developing diagnostic methods is the most accırate method used in the identification of bacteria. Amplification and sequencing of this gene using universal primers that allow the amplification of the bacterial 16S rRNA gene region has begun to be used as a standard method in phylogenetic studies. Sequence results were analyzed using BLAST to carry out identification. As a result of the sequence analysis, Bacillus pumilus, Bacillus suptilis, Bacillus thuringiensis, Bacillus cereus, Chryseo bacterium indoltheticum, Bacillus amyloliquefaciens, Pectobacteriume carotovorum, Bacillus laevolacticus and Bacillus safensis species were identified. Phylogenetic tree was formed by these species and linkage relations were examined. In the last step, destructive effects were determined based on the chitinase and phytase activity of these bacteria. This study involves the identification of the disruptive organisms which is the first step of the experiment to support the good agricultural practices of the lettuce plant with economic importance, isolation of these microorganisms and the molecular analysis of the identifications. The presence of some extracellular enzymes (phytase and chitinase) in the identified microorganisms has been qualitatively examined.
Benzer Tezler
- Rhodotorula glutinisden ekstrakte edilen karotenoidlerin antimikrobiyal etkisi
Antimicrobial effects of carotenoids extracted from Rhodotorula glutinis
BETÜL SÖZÜBATMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
Gıda MühendisliğiÇukurova ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. ZERRİN ERGİNKAYA
- Salmonella surveillance on fresh produce and inactivation by high hydrostatic pressure
Taze sebzelerde Salmonella incelenmesi ve yüksek hidrostatik basınç ile inaktivasyon
ELİF GÜNEL
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
Gıda MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. YEŞİM SOYER
PROF. DR. HAMİ ALPAS
- Marulda Botrytis cinerea'ya karşı ın vıtro koşullarda biyolojik savaşım olanakları üzerine bir araştırma
An investigation of biological control possibilities against Botrytis cinerea on lettuce in the in vitro conditions
MİRAY DEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
ZiraatNamık Kemal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ARZU COŞKUNTUNA
- Bazı yeşil yapraklı sebzelerin mikroflorası üzerine bir araştırma
A Research on the microflor of some leafy vegetables
Z.SERAY AYDIN
- Pectobacterium carotovorum'un izolasyonu, 16S rRNA ile tanılanması, bakterinin fitaz enzim aktivitesi ve karakterizasyonu
Isolation of pectobacterium carotovorum, identification by 16S rRNA and the characterization of the bacterium by phytase enzyme activity
SAFA MUSTAFA KILIÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
BiyoteknolojiAtatürk ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NESLİHAN DİKBAŞ