Salmonella ınfantis suşlarının oluşturduğu biyofilm üzerine çevresel ve genetik faktörlerin etkisinin araştırılması
Effect of environmental and genetic factors on biofilm formation of the salmonella infantis strains in turkey
- Tez No: 462845
- Danışmanlar: DOÇ. DR. H.KAAN MÜŞTAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 58
Özet
Biyofilm oluşumu, endüstriyel, çevresel, halk sağlığı ve tıbbi alanlarda ciddi sorunlara neden olmaktadır. Salmonella serotipleri arasında biyofilm oluşturma yeteneği ve miktarı arasında farklılıklar vardır ve bu özellikler çeşitli çevresel ve genetik faktörlere bağlı değişiklikler göstermektedirler. Son yıllarda yapılan çalışmalarda Salmonella Infantis'in ülkemizdeki kanatlı kümes ve kesimhanelerinde en sık gözlenen serotip olduğu belirlenmiştir. Bu tez çalışmasında, 100 S. Infantis suşu ile bazı Salmonella serotiplerinin (5 Salmonella Kentucky, 5 Salmonella Hadar, 5 Salmonella Enteritidis, 5 Salmonella Typhimurium) biyofilm morfotipleri belirlenerek biyofilm oluşumu üzerine sıcaklık, pH, tuz konsantrasyonu gibi çevresel etkilerin ve bazı genetik faktörlerin etkisi araştırıldı. Morfotip olarak S. Infantis'te rdar (%96), S. Typhimurium (%100), S. Kentucky (%100) ve S. Enteritidis (%100) serotiplerinin biyofilm morfotipleri rdar, S. hadar (%100) ise bdar morfotipinde bulundu. S. Infantis için biyofilm oluşturma süresi uygun şartlar altında 72 saat olarak belirlenirken, optimum sıcaklık 20°C, pH 6,6 ve tuz konsantrasyon oranı %0,5 olarak belirlendi. pH 4,5'te ve %0,5'in üzerindeki tuz konsantrasyonlarında ise tüm serotiplerin biyofilm oluşturmadığı görüldü. Bu tez çalışmasında daha önce S. Infantis için araştırılmamış olan csrB, csrC, fimA ve fimB genleri hem S. Infantis serotip hem de S. Typhimurium, S. Enteritidis, S. Hadar ve S. Kentucky serotipleri için araştırılarak bu genlerin tüm serotiplerde var olduğu belirlendi. Salmonella Infantis için ilk kez yapılan bu araştırma sonucu elde edilen bulguların, bu serotipin biyofilm yapılarının eradikasyonu için yapılacak çalışmalarda, doğru parametrelerin belirlenmesi açısından yol gösterici olacağı düşünüldü.
Özet (Çeviri)
Biofilm formation causes serious problems in industrial, environmental, public health and medical fields. There are differences between Salmonella serotypes' ability to form biofilm quantity; these characteristics change due to various environmental factors. Because of the existing of Salmonella Infantis as the most common poultry serotype in recent years, it is a need to investigate the genetic and environmental factors' effects on the biofilm formation of this serotype. In this thesis, the environmental impacts such as different salt concentrations, temperature and pH and some of genetic factors on biofilm formation of Salmonella Infantis and other 4 different serotypes (S. Enteritidis, S. Kentucky, S. Typhimurium, S. Hadar) which is the most common serotype in poultry in Turkey were used to show the environmental impacts such as different salt concentrations, temperature and pH and some of genetic factors on biofilm. The most common morphotype was shown as rdar at rate of %96 for S. Infantis, rdar for S. Typhimurium (%100), S. Kentucky (%100) and S. Enteritidis (%100), bdar for S. Hadar (%100). For the S. infantis, the optimal temperature was 20°C, pH 6,6, and the salt concentration ratio was 0.5%, while the biofilm formation time was 72 hours under appropriate conditions. At pH 4,5 and salt concentrations above 0,5%, all serotypes did not form biofilms. In this thesis study, csrB, csrC, fimA and fimB genes which have not been previously investigated for S. Infantis were investigated for both S. Infantis serotype and S. Typhimurium, S. Enteritidis, S. Hadar and S. Kentucky serotypes and found that these genes exist in all serotypes determined. The findings of this first study for Salmonella Infantis will show the determination of the correct parameters in studies to eradicate this serotype biofilm constructs.
Benzer Tezler
- Türkiye'den izole edilen Salmonella suşlarının biyofilm oluşturma özelliklerinin tanımlanması
Identification of biofilm forming abilities of Salmonella strains isolated from Turkey
BAŞAR KARACA
- Tavuk kökenli salmonella infantis suşlarının antibiyotik duyarlılığı
Anti̇bi̇oti̇c suscepti̇bi̇li̇ty of salmonella infantis strai̇ns of chi̇cken ori̇gi̇n
ÖZGE YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KADİR SERDAR DİKER
- Kanatlı kökenli salmonella infantis suşlarının MLST ile filogenetik analizi
Phylogenetic analysis of salmonella infantis strains from poultry by MLST
SEYYİDE SARIÇAM
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. H.KAAN MÜŞTAK
- Kanatlı orijinli Salmonella ınfantis suşlarında CRISPR analizi
CRISPR analysis in Salmonella infantis strains of poultry origin
ÖZGE ERDOĞAN
Doktora
Türkçe
2023
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET AKAN
- Kanatlı orijinli salmonella infantis suşlarında virulens genlerinin moleküler analizi
Moleculer analysis of virulence genes of salmonella infantis isolated from poultry
NURDAN KARACAN
Doktora
Türkçe
2017
Veteriner HekimliğiAnkara ÜniversitesiMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET AKAN