Bazı DNA baz çiftleri ile geçiş metal komplekslerinin DFT yöntemiyle iletkenlik hesaplamaları
Conductivity calculations by DFT method of some DNA base pairs and their transition metal complexes
- Tez No: 465241
- Danışmanlar: DOÇ. DR. NURTEN TEZER
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Cumhuriyet Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışma, bazı DNA baz çiftleri ile geçiş metal komplekslerinin iletkenlikleri üzerinedir. Çalışmada doğal ve yapay DNA bazları kullanılmıştır. Doğal DNA bazı olarak guanin, timin ve urasil; yapay DNA bazı olarak da hidroksipridon bazı seçilmiştir. Bu bazların önce dimer yapıları daha sonra metalleşmiş kompleksleri incelenmiştir. Metal olarak 2+ değerlikli Cu2+, Ni2+, Pd2+, Pt2+, Zn2+, Cd2+ ve Hg2+ iyonları seçilmiştir. Oluşturulan baz çiftleri ile komplekslerinin geometrik parametreleri (bağ uzunlukları, açıları gibi) ve enerji değerleri (HOMO, LUMO, Gibbs serbest enerjisi gibi) hesaplanmıştır. Daha sonra DFT yöntemiyle, Band Teorisinden yararlanarak baz çiftleri ile komplekslerinin elektriksel iletkenlikleri nitel olarak tahmin edilmiştir. Baz çiftlerinin tamamının yalıtkan ve Cu-merkezli baz çifti komplekslerinin iletkenliğin iyi olduğu görülmüştür. Bu çalışmanın, DNA nanoteknoljisin gelişimiyle beraber gelecekte yapılacak olan DNA temelli nanoelektronik devrelerin hazırlanması öncesinde öngörüler sunacağı düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
This study is upon conductivity of some DNA bases and their transition metal complexes. In this study, natural and artificial DNA bases have used. It is preferred guanine, thymine and urasil bases as a natural base, hydroxyprydone base as an artificial base. Firstly, dimer structures of mentioned bases are investigated. Then their metal-complexes are examined. In complexes, divalent Cu2+, Ni2+, Pd2+, Pt2+, Zn2+, Cd2+ and Hg2+ ions are selected. It is calculated geometric parameters, energy values of base pairs and metal-DNA base pairs. Additionally, conductivities of these are determined for single nanowires by band theory. It is seen that all dimer are insulator and Cu-mediated base pair complexes are good conductor. This study is expected to be guidance for nanotechnological applications.
Benzer Tezler
- Computational investigation of telomeres and telomerases
Telomerlerin ve telomerazların hesapsal yöntemlerle incelenmesi
AYDIN ÖZMALDAR
Doktora
İngilizce
2023
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DR. ÖĞR. ÜYESİ BÜLENT BALTA
- Carbon fiber based DNA biosensor design
Karbon fiber esaslı DNA biyosensör tasarımı
ERKAN DOĞRU
Doktora
İngilizce
2017
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OSMAN ATİLLA ARIKAN
PROF. DR. ELİF ERHAN
- Targeting and activation of antigen specific CD8+ T cells with peptide-major histocompatibility complex I tetramers
Peptit-majör histokompatibilite kompleks I tetramerleri ile antijen spesifik CD8+ T hücrelerin hedeflenmesi ve aktivasyonu
ŞAFAK CEREN USLU ŞIVGIN
Doktora
İngilizce
2025
BiyoteknolojiHacettepe ÜniversitesiTemel Onkoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HANDE CANPINAR
- Behçet hastalığı etiyopatogenezinde insan ısı şoku proteini 60(HSP60) gen polimorfizmi ve klinik bulgularla ilişkisi
Başlık çevirisi yok
ZEYNEP ÖZBALKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2003
RomatolojiHacettepe Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. A. İHSAN ERTENLİ
- Yeni Cami'nin akustik açıdan performans değerlendirmesi
Evaluation of the acoustical performance of the New Mosque
EVREN YILDIRIM
Yüksek Lisans
Türkçe
2003
Mimarlıkİstanbul Teknik ÜniversitesiMimarlık Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEVTAP YILMAZ DEMİRKALE