Geri Dön

Karbapenemaz üreten klebsiella pneumoniae suşlarının moleküler karakterizasyonu

Molecular characterization of carbapenemase producing k.pneumoniae

PDF İndir

  1. Tez No: 480820
  2. Yazar: SERPİL GENÇ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. FETİYE KOLAYLI
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: K.pneumoniae, OXA-48, NDM, KPC, VIM, IMP, pulsed-field jel elektroforezi, K.pneumoniae, OXA-48, NDM, KPC, VIM, IMP, pulsed-field gel electrophoresis
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Kocaeli Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 111

Özet

Giriş ve amaç Bu çalışma Ocak 2015 - Şubat 2017 tarihleri arasında Kocaeli Üniversitesi Hastanesi Merkez Laboratuvarı Bakteriyoloji Birimi'ne gelen örneklerden izole edilmiş karbapenem dirençli K. pneumoniae suşlarının sahip olduğu aktarılabilir karbapenemaz genlerinin tanımlanmasını ve görülme sıklığını konu alan ilk çalışma olup, hem hastanemiz hem de ülkemiz için epidemiyolojik veri sağlanmayı amaçlamıştır. Gereç ve yöntem Vitek-2 (BioMérieux, Fransa) otomatize sistemi ile karbapenem grubu antibiyotiklerden herhangi birine azalmış duyarlılığı saptanan 100 adet K. pneumoniae izolatı çalışmaya dahil edilmiştir. AMC, TZP ve SXT duyarlılıklarını belirlemek için disk difüzyon yöntemi kullanılmıştır. Diğer antimikrobiyal ajanların (AMP, AK, İPM, MEM, ETP, CAZ, CTX, CİP, KOL, TG, CN) duyarlılıklarını belirlemek amacıyla agar dilüsyon yöntemiyle MİK değerleri saptanmıştır. Ülkemizde görülen blaOXA-48, blaNDM, blaKPC, blaVIM ve blaIMP genlerinin hastanemizdeki sıklığı iki farklı multipleks PZR yöntemiyle araştırılmıştır. Ayrıca hastanemizden izole edilen KDKP suşlarının klonal olarak ilişkisini belirlemek amacıyla PFGE yöntemi kullanılmıştır. Bulgular Tüm suşlar için en yüksek direnç AMP (%100), AMC (%100) ve TZP (%100)'e karşı saptanmıştır. Direnç oranının giderek arttığı belirlenmekle beraber en duyarlı antibiyotik olarak KOL (%42) saptanmıştır. KDKP izolatlarının 95'inin karbapenemaz genlerinden en az birini taşıdığı multipleks PZR ile gösterilmiştir. Genlerin %81.05'inin blaOXA-48, %38.9'unun blaNDM ve %9.47'sinin blaKPC ve %1.05'inin blaVIM olduğu belirlenmiştir. Bir izolatın blaOXA-48 +KPC genini, iki izolatın da blaKPC+NDM genini birlikte taşıdığı ilk kez belirlenmiştir. PFGE ile izolatların 24 farklı klona ayrıldığı tespit edilmiş olup %63.09'unun dört pulsotip (A,B,C,D) içerisinde gruplaştığı saptanmıştır. Sonuç Ülkemizde endemik olarak bulunan OXA-48 pozitif izolatların yanında NDM enzimi taşıyan izolatların görülme sıklığının endemik düzeye ulaşmaya başladığı, ilk kez 2012 yılında belirlenen KPC pozitif suşların NDM pozitifliği kadar olmasada hızla arttığı görülmektedir. Yıllar içinde hızla artan bu yayılımın engellenebilmesi için özellikle riskli bölümlerdeki hastalara, KÜE açısından kontrol dışkı tarama testlerinin yapılması ve enfeksiyon kontrol önlemlerinin uygulanması önerilmektedir.

Özet (Çeviri)

Introduction and purpose This is the first study indicated that definition and incidence of transferable carbapenemase genes of carbapenem resistant K. pneumoniae at the University Hospital of Kocaeli. Strains collected from Kocaeli University Hospital Central Microbiology Laboratory between January 2015 and February 2017. The purpose of this study, providing epidemiologic data for both our hospital and country. Materials and methods The study was included 100 isolates of K. pneumoniae that detected reduced susceptibility to any of the carbapenem group antibiotics with automated system Vitek-2 (BioMérieux, France). The disc diffusion method was used to determine the AMC, TZP and SXT sensitivities. MIC values were determined by agar dilution method to determine the sensitivities of other antimicrobial agents (AMP, AK, İPM, MEM, ETP, CAZ, CTX, CIP, KOL, TG, CN). The frequencies in our hospital for blaOXA-48, blaNDM, blaKPC, blaVIM and blaIMP genes which frequently detected in our country have been investigated by two different multiplex PCR methods. In addition, PFGE method was used to determine the carbapenem resistant K. pneumoniae (CRKP) strains clonal relationship isolated from our hospital. Results The highest resistance for all strains was determined against AMP (100%), AMC (100%) and TZP (100%). Although KOL resistance rate is rising, it (42%) is detected as the most sensitive antibiotic. It was determined that 95 CRKP isolates carry at least one of the carbapenemase genes. 81.05% of the genes were identified as blaOXA-48, 38.9% as blaNDM, 9.47% as blaKPC and 1.05% as blaVIM. One isolate was identified for the first time carrying the blaOXA-48+KPC gene and the two isolates were identified for the first time carrying the blaKPC+NDM gene. With PFGE, it was determined that the isolates were divided into 24 different clones, and 63.09% were grouped into four pulse types (A, B, C, D). Conclusion In addition to blaOXA-48 gene positive isolates found endemic in our country, the incidence of blaNDM gene-carrying isolates is beginning to reach endemic levels. Although as much as not blaNDM, blaKPC gene positive strains isolated for the first time 2012, spreading rapidly. In order to prevent this spread which is increasing rapidly over the years, it is suggested to carry out control stool screening tests and to take infection control measures especially in terms of the carbapenemase producing Enterobacteriacae on patients in the risk areas.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    541266

    Gram negatif çomaklarda karbapenamazların moleküler yöntemlerle araştırılması

    Molecular detection of carbapenemases in gram negative rods

    AYHAM M.A ABULAILA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    Prof. Dr. ZERRİN AKTAŞ

  2. Tez No

    785217

    Çocuk ve yenidoğan yoğun bakım ünitelerinden izole edilen karbapenem dirençli klebsiella suşlarının moleküler epidemiyolojisi

    Molecular epidemiology of carbapenem resistant klebsiella species isolated from pediatric and neonatal intensive care units

    AYŞE HANDE TÜRK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DEVRAN GERÇEKER

  3. Tez No

    435455

    Yoğun bakım hastalarında rektal sürüntü örneklerinden izole edilen karbapenem dirençli klebsiella pneumoniae escherichia coli suşlarının araştırılması

    İnvestigation of carbapenem resistant klebsiella pneumoniae and esherichia coli strains i̇solated from rectal swap samples of i̇ntensive care unit patients

    ÖZGÜR EZİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    MikrobiyolojiDicle Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEZAHAT AKPOLAT

  4. Tez No

    406881

    Süleyman Demirel Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarında çeşitli klinik örneklerden izole edilen klebsiella pneumoniae suşlarındaki karbapenemaz varlığının araştırılması

    Investigation of carbapenemase presence in klebsiella pneumoniae isolates obtained from various clinical samples in Microbiology Laboratory of Süleyman Demirel University of Faculty of Medicine hospital

    ESRA ÇİFTÇİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    MikrobiyolojiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EMEL SESLİ ÇETİN

  5. Tez No

    623018

    Yoğun bakıma yatan hastalarda vankomisin dirençli enterokok (VRE) ve karbapenemaz üreten Klebsiella pneumoniae (KPC) taşıyıcılığının araştırılması

    Başlık çevirisi yok

    GÖKHAN KARAŞİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    MikrobiyolojiYüzüncü Yıl Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MEHMET PARLAK

Geri Dön