Geri Dön

Esbl pozitif ve karbapenemaz üreten klebsiella pneumoniae suşlarındakarbapenem direncinin fenotipik ve moleküler yöntemlerle saptanması

Detection of carbapenem resistance in ESBL-positive and carbapenemase-producingklebsiella pneumonia strains using phenotypic and molecular methods

PDF İndir

  1. Tez No: 938203
  2. Yazar: BÜŞRA KAYIN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. YAVUZ UYAR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 78

Özet

Antimikrobiyal direnç, dünyada ve ülkemizde ciddi bir sağlık sorunudur. Dünya Sağlık Örgütü'nün 2024 yılı listesinde ilk sırada karbapenem dirençli Klebsiella pneumoniae yer almaktadır. K.pneumoniae, YBÜ hastalarında önemli bir mortalite ve mobidite nedeni olan enfeksiyon etkenidir. Bu tez çalışmasına, YBÜ'lerinde yatan hastaların solunum yolu ve kan örneklerinde üreyen Karbapenemlere dirençli ve GSBL pozitif olan K.pneumoniae suşları alındı. PCR yöntemiyle direnç oluşturan KPC, NDM, OXA-48 ve VIM enzimlerinin araştırılması amaçlandı. Çalışmaya, 2023 yılı içinde Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Hastanesi Yoğun Bakım Ünitelerinde yatan 75 hastanın solunum yolu (endotrakeal aspirat, bronko-alveolar lavaj, balgam) ve hemokültür örnekleri dahil edildi. Bu örneklerden izole edilen K.pneumoniae suşlarının tanımlaması için konvansiyonel kültür yöntemlerinin (Kanlı agar, choromoagar, MİO besiyeri) yanı sıra Vitek2 Compact (Biomerieux) ve Maldi-Tof (Bruker) otomatize sistemleri de kullanıldı. Üreyen bakteriler çalışmanın yapılacağı güne kadar -80 °C derin dondurucuda triptik soy broth agar besiyeri içinde saklandı. Daha sonra, saklanan bu örnekler pasajlandı ve üreyen K.pneumoniae izolatları önce ekstraksiyona tabi tutuldu, ardından direnç oluşturan KPC, NDM, OXA-48 ve VIM enzimleri her biri ayrı bir deneyde Real Time PCR yöntemiyle araştırıldı. 75 hastanın 47'si (%62,7) erkek ve 28'i (%37,3) kadındı. Hastaların yaş aralığı 20 yaş ile 93 (62,56 ± 18,29) yaş arasında değişmekteydi. Numunelerin 42'si (%56) solunum yolu örneği (BAL, ETA, balgam, vb.) ve 33'ü (%44) ise hemokültür örneğinden oluşmaktaydı. Karbapenem grubundan imipeneme %52,0 dirençli, %48,0 duyarlı; meropeneme %90,7 dirençli, %9,3 duyarlı olarak belirlendi. Karbapenemaz enzimlerinin bulunma oranları; NDM %92, OXA-48 %84, KPC %81,3 ve VIM %78,7 olarak belirlendi. Karbapenemaz 16 enzimlerinin birlikte olarak bulunma durumları; KPC+OXA-48+NDM+VIM varlığı %70,7, OXA-48 + NDM varlığı %8,0, KPC+OXA-48+NDM varlığı %5,3, KPC+NDM+VIM varlığı %5,3 olarak bulunmuştur. VIM %2,7 ve NDM tek başına %2,7 olarak bulunmuştur. Dört örnekte araştırılan enzimlerin hiçbirisi saptanmadı (%5,3). Cinsiyet, 60 yaş altı ve üstünde olmak ve hastanın yattığı YBÜ'ne göre incelendiğinde; karbapenemaz enzim varlığı açısından istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunamadı (p>0.05). Karbapenemaz üreten bakterilerin neden olduğu YBÜ enfeksiyonları konusunda dikkatli olmak gereklidir. Hastanelerin aralıklı olarak karbapenemaz üreten bakteriler yönünden kesitsel sürveyans yapmasının önemli olduğunu düşünmekteyiz.

Özet (Çeviri)

Antimicrobial resistance is a serious health problem in the world and in our country. Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae is at the top of the World Health Organization's 2024 list. K. pneumoniae is an infectious agent that causes significant mortality and morbidity in ICU patients. Carbapenem-resistant and ESBL-positive K. pneumoniae strains grown in respiratory tract and blood samples of patients hospitalized in ICUs were included in this thesis study. It was aimed to investigate the resistance-inducing enzymes KPC, NDM, OXA- 48 and VIM by PCR method. The study included respiratory tract (endotracheal aspirate, broncho-alveolar lavage, sputum, etc) and hemoculture samples of 75 patients hospitalized in the Intensive Care Units of Cerrahpaşa Medical Faculty Hospital in 2023. In addition, to conventional culture methods (Blood agar, chromoagar, MIO medium), Vitek 2 Compact (Biomerieux) and Maldi-Tof (Bruker) automated systems were also used to identify of K. pneumoniae isolates. The grown bacteria were stored in tryptic soy broth agar medium in a -80 ° C deep freezer until the day 18 of the study. Then, these storage samples were passaged and the grown K. pneumoniae isolates were first subjected to extraction. Then, the resistance-inducing KPC, NDM, OXA-48 and VIM enzymes were investigated by Real Time PCR method in each separate experiment. Of 75 patients, 47 (62.7%) were male and 28 (37.3%) were female. The age range of the patients ranged from 20 to 93 (62.56 ± 18.29) years. 42 (56%) of the samples were respiratory tract samples (BAL, ETA, sputum, etc.) and 33 (44%) were hemoculture samples. From the carbapenem group, imipenem was determined as 52.0% resistant, 48.0% susceptible; meropenem was determined as 90.7% resistant, 9.3% susceptible. The rates of carbapenemase enzymes were determined as NDM 92%, OXA-48 84%, KPC 81.3% and VIM 78.7%. The co-occurrence of carbapenemase enzymes; The presence of KPC+OXA-48+NDM+VIM was found to be 70.7%, OXA-48 + NDM was found to be 8.0%, KPC+OXA-48+NDM was found to be 5.3%, KPC+NDM+VIM was found to be 5.3%. VIM was found to be 2,7% and NDM alone was found to be 2,7%. None of the enzymes investigated were detected in the four samples (5.3%). When examined according to gender, being under and over 60 years of age and the ICU where the patient was admitted; no statistically significant difference was found in terms of the presence of carbapenemase enzyme (p>0.05). It is necessary to be careful about ICU infections caused by carbapenemase-producing bacteria. We believe that it is important for hospitals to conduct cross-sectional surveillance for carbapenemase-producing bacteria at regular intervals.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    591824

    Üriner enfeksiyon etkeni klebsiella pneumoniae izolatlarında fosfomisin duyarlılığının farklı yöntemlerle saptanması

    Determination of fosfomycin susceptibility in urinary klebsiella pneumoniae isolates using different methods

    ZEYCAN SEMERCİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiMarmara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEYNEP ARZU İLKİ

  2. Tez No

    365399

    Hacettepe Üniversitesi erişkin hastanesinde 2004-2012 yılları arasında kan kültürlerinde üreyen enterobacteriaceae üyelerinin genişletilmiş spektrumlu betalaktamaz ve karbapenemaz pozitifliklerinin değerlendirilmesi

    Evaluation of extended spectrum beta lactamase and carbapenemase positivity rates of enterobacteriaceae causing bacteremia between years 2004-2012 in Hacettepe University faculty of medicine

    ÖZANT HELVACI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıHacettepe Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MURAT AKOVA

  3. Tez No

    785217

    Çocuk ve yenidoğan yoğun bakım ünitelerinden izole edilen karbapenem dirençli klebsiella suşlarının moleküler epidemiyolojisi

    Molecular epidemiology of carbapenem resistant klebsiella species isolated from pediatric and neonatal intensive care units

    AYŞE HANDE TÜRK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DEVRAN GERÇEKER

  4. Tez No

    887146

    Piperasilin- tazobaktam ve karbapenem kullanımının karbapeneme dirençli enterobacterales ile fekal kolonizasyon gelişmesi üzerindeki etkisinin karşılaştırılması

    Comparison of the effect of carbapenem and piperacillin-tazobactam on the development of fecal colonisation with carbapenem resistant enterobacterales

    TUĞBA PAMUKÇU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÖKHAN METAN

  5. Tez No

    926711

    Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi'ndeki hastaların endotrakeal ve trakeal aspirat örneklerinden izole edilmiş Klebsiella pneumoniae suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının incelenmesi

    Investigation of antibiotic susceptibility of Klebsiella pneumoniae strains isolated from endotracheal and tracheal aspirate samples of patients at

    HÜSNİYE BİLBİL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    MikrobiyolojiErciyes Üniversitesi

    Klinik Araştırmalar Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÜLAY SEZER

Geri Dön