Distribution of hepatitis C virus genotypes and their viral loads in thalassemic patients in province of Erbil/Iraq
Hepatit C virüs genotiplerinin ve viral yüklerinin Irak'ın Erbil bölgesindeki talesemi hastaları içinde dağılımı
- Tez No: 482281
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. SABAHATTİN CÖMERTPAY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Moleküler Tıp, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Hepatit C virüsü (HCV) enfeksiyonu talesemi hastaları için ciddi bir sağlık problemi olarak değerlendirilen kozmopolit bir hastalıktır. HCV kronik hepatitin, karaciğer sirozunun ve hepatoselular karsinomanın dünya genelinde en yaygın nedeni olarak ortaya çıkmıştır. Uygun tedavi stratejilerini geliştirmek için HCV hastalarında viral yükün belirlenmesi ve genotipleme oldukça önemlidir. Bu çalışmanın amacı Erbil, Irak'taki talesemi hastaları arasında HCV genotiplerinin yayılımını ve bu genotiplerin viral yükler ile ilişkisinin belirlenmesidir. 203 HCV-pozitif serum örneği Erbil Talesemi Merkezi'nden toplanmış ve yapılan testte bu örneklerin sadece 107'sinin HCV RNA'sı yönünden pozitif olduğu bulunarak çalışmaya dahil edilmiştir. 107 örneğin 62'si erkek (ortalama yaş: 17.76 ± 6.34) 45'i kadındır (ortalama yaş: 18.33 ± 5.61). HCV enfeksiyonunun varlığını onaylamak ve RT-PCR metoduyla genotipleme yapılabilmesi için RNA izole edilmiştir. Ayrıca örnekler viral yüklerinin tespiti için ayrı bir incelenmeye alınmıştır. İstatiksel analizler GraphPad 7.0 yazılımı ile gerçekleştirilmiştir. Elde edilen sonuçlara dayanarak, çalışılan örneklerde en baskın genotipin, genotip 3 (%43.92) olduğu ve bunu sırasıyla %22.43, %14.95, %0.93, %4.67, %3.73, %2.80, %8.41 olarak belirlenen yüzdeleriyle 1a, 4, karışık (1a+4, 1b+4), 2, 1b ve bilinmeyen genotiplerinin takip ettiği gözlenmiştir. Dahası, tüm HCV genotiplerinin görülme sıklığı erkeklerde daha yüksek bulunmuştr. Her ne kadar cinsiyet ve viral yük arasında istatiksel olarak anlamlı bir ilişki bulunmuşsa da (P<0.001) cinsiyet ve genotip arasında böyle bir ilintiye rastlanmamıştır. Çalışma sonuçlarımızda, Erbil Talesemi Merkezi'ndeki hastaların HCV enfeksiyonlarının %81'ini genotip 3, 1a ve 4'ün oluşturduğu ortaya çıkmıştır. HCV enfeksiyonu taşıtan talesemi hastalarının büyük çoğunluğu yaşları 11 ile 20 arasında değişen çocuk ve gençlerdir.
Özet (Çeviri)
Hepatitis C virus (HCV) infection is a cosmopolitan infection that has been considered a serious health problem for thalassemia patients. HCV has emerged as a leading cause of chronic hepatitis, liver cirrhosis and hepatocellular carcinoma worldwide. Genotyping and assessment of the viral load in HCV patients is important for designing the therapeutic strategies. The aim of the present study is to determine the predominance pattern of the HCV genotypes among this group of thalassemia patients and their correlation with the viral load. 203 HCV-positive serum samples from the patients of Thalassemia Center in Erbil (Iraq) were collected and only 107 HCV RNA positive patients were studied. Of 107, 62 were males (mean age 17.76 ± 0.804) and 45 were females (mean age 18.33 ± 0.836). RNA was isolated to check for HCV genotyping through by use of RT-PCR. Samples were further examined for estimation of viral load. Statistical analysis was done by GraphPad 7.0. On the basis of result observed, genotype 3 was the most prevalent genotype (43.92%) that appeared in infected cases followed by genotypes 1a, 4, mixed (1a+4, 1b+4), 2, 1b and untypeable genotype which were 22.43%, 14.95%, 0.93%, 4.67%, 3.73%, 2.80% and 8.41%, respectively. Moreover, frequency of all different HCV genotypes was higher in male patients compared to female however, the relation between gender and any genotype was statistically insgnifianct even though there was a high positive correlation between genotypes 3 and 1a with viral load P<0.001 as compared to other genotypes.The present study revealed that HCV genotype 3, 1a and 4 accounted for about 81% of the total HCV infection of the group in Erbil Thaalassemia Center. Most of the thalassaemic cases infected with HCV were teenagers with the ages between 11 and 20 years old.
Benzer Tezler
- Sivas yöresindeki anti HCV seropozitif kişilerde HCVRNA düzeylerinin ve genotip dağılımlarının moleküler yöntemlerle araştırılması
Searching the HCV RNA levels and the genotype distributions on anti HCV seropositive persons in sivas region through molecular methods
CEM ÇELİK
Doktora
Türkçe
2010
MikrobiyolojiCumhuriyet ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA ZAHİR BAKICI
- Biochemical and genotyping characteristic of the patients with hepatitis C in the south of Iraq
Irak'ın güneyindeki hepatit C hastalarının biyokimyasal ve genotiplendirme özellikleri
HUDA ABDULKAREEM RAISAN ALMUTAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ OKAN ÜRKER
PROF. DR. AHMAD KHASSAF
- The effect of HLA DPB1 alleles on the immune response in chronic Hepatitis B
Kronik Hepatit B hastalığında HLA DPB1 allelerin hastalığın immun yanıta etkisi
NİLAY GURBET KARATAŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
Tıbbi Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DOÇ. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Kronik hepatit B'li hastalar ile hepatit B'ye karşı spontan bağışıklık kazanan kişiler arasında programlanmış hücre ölüm geni polimorfizimlerinin sıklıklarının ve etkilerinin gösterilmesi
Demonstration of the frequencies and their effects of programmed cell death (PD) gene polymorphisms between chronic hepatitis B patients and individuals who recovered from hepatits B virus infection spontaneously
YAKUP ÜLGER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
GastroenterolojiÇukurova ÜniversitesiDahiliye Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MACİT ÜMRAN SANDIKÇI
- Hepatit B virusu (HBV) ile kronik enfekte hastalarda HBV bazal kor promoter/prekor gen mutasyonları ve genotip değerlendirilmesi
Basal core promoter/precore gene mutations in chronically infected patients with hepatitis B virus and genotype evaluation
SEDA TEZCAN
Doktora
Türkçe
2009
MikrobiyolojiMersin ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜROL EMEKDAŞ