Geri Dön

Otofaji yolağıyla ilişkili mikro RNA (miRNA)'ların kolorektal kanserdeki rolünün araştırılması

The investigation role of micro RNAS (miRNA) related to autophaphy pathway in colorectal cancer

PDF İndir

  1. Tez No: 482784
  2. Yazar: ÜMİT YILMAZ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ŞAKİR ÜMİT ZEYBEK
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Moleküler Tıp, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 118

Özet

Kanser vakalarının yaklaşık %10'unu oluşturan kolorektal kanser, tüm dünyada üçüncü en sık görülen kanser türüdür. Otofaji, kendi kendini (auto) yeme (phagy) anlamına gelmektedir ve Beclin-1 otofajide anahtar rol oynayan en önemli proteindir. MiRNA'lar otofajiyi de içeren hemen hemen her hücresel süreçte önemli rol oynarlar ve aynı zamanda Beclin-1 ekspresyonunun düzenlenmesinde kritik bir mekanizma sergilerler. Bu çalışmanın birinci amacı kolorektal kanserli bireylerde miR-17-5p, miR-30b, miR-30d, miR-216a ve miR-216b' nin Beclin-1 geni ve proteini üzerine olan etkilerinin incelenmesidir. İkinci amaç ise bu miRNA' ların kolorektal kanser teşhisinde güvenilir birer biyobelirteç olarak kullanılabilirliğinin belirlenmesidir. Bu çalışmaya, kolorektal kanser tanısı almış 47 hasta ile ailesinde ve kendisinde kanser hikayesi bulunmayan 50 sağlıklı birey dahil edilmiştir. Kolorektal kanser hastalarının serum, tümör ve tümör içermeyen dokularındaki ve sağlıklı kişilerin serumlarındaki miR-17-5p, miR-30b, miR-30d, miR-216a, miR-216b' nin ve Beclin-1 geninin ekspresyon düzeyi qRT-PCR yöntemiyle incelenmiştir. Hasta bireylerden alınan tümör ve tümör içermeyen doku örneklerindeki Beclin-1 protein seviyesi Western Blot yöntemiyle değerlendirilmiştir. Hasta bireylerin tümör dokusunda Beclin-1 geninin, miR-30b'nin ve miR-216a'nın ekspresyonlarının sağlıklı dokuya göre azaldığı, miR-17-5p ve miR-30d düzeylerinin ise arttığı belirlenmiştir (p=0.001). Hasta bireylerin tümör dokularında Beclin-1 protein düzeyi de istatistiksel olarak azalmıştır (p=0,001, %95güven aralığı=0,19-4,71). miR-17-5p, miR-30b, miR-30d, miR-216a ve miR-216b'nin hastaların serum örneklerindeki ekspresyon seviyeleri tümör dokularına göre istatistiksel olarak azalmıştır (p=0.001). Hasta bireyler ile sağlıklı bireylerin serum örneklerinde karşılaştırıldığında ise hasta grubunda miR-30d anlatımının istatistiksel olarak anlamlı düzeyde azaldığı saptanmıştır (p=0,001, %95güven aralığı=1,32-3,52). Çalışmamızın sonuçlarına göre Beclin-1 geninin kolorektal kanserde tümör baskılayıcı olarak davranabileceğini ve miR-17-5p ve miR-30d' nin Beclin-1 ekspresyonunun düzenlenmesinde rol oynayabileceğini söyleyebiliriz. Ayrıca miR-17-5p, miR-30b, miR-30d, miR-216a, miR-216b' nin kolorektal kanser tanısı için serumdan çok güvenilir biyobelirteç olarak kullanılamayacağı sonucuna varılmıştır.

Özet (Çeviri)

Colorectal cancer, which accounts for about 10% of cancer cases, is the third most common type of cancer in the world. Autophagy means self (auto) - eating (phagy) and Beclin-1 is the most important protein that plays a key role in autophagy. MiRNAs play an important role in almost every cellular process, including autophagy, and at the same time, they exhibit a critical mechanism in the regulation of the Beclin-1 expression. The first aim of this study is to investigate the effects of miR-17-5p, miR-30b, miR30d, miR-216a and miR-216b on Beclin-1 gene and protein in colorectal cancer patients. The second aim is to determine whether these miRNAs can be used as reliable biomarkers in the diagnosis of colorectal cancer. Forty seven patients with colorectal cancer and 50 healthy individuals who did not have a cancer history were included in this study. In the serum, tumor and non-tumoral tissues of colorectal cancer patients and serum of healthy subjects, expression levels of miR-17-5p, miR-30b, miR-30b, miR-216a, miR-216b and Beclin-1 gene were detected by qRT-PCR. In tumor and non-tumoral tissue samples of patients, Beclin-1 protein levels were examined by Western Blot method. While Beclin-1, miR-30b and miR-216a expressions were found lower in tumor tissue samples of patients than healthy tissues, it has been detected that miR-17-5p and miR-30d expressions increased (p=0.001). Also, Beclin-1 protein levels statistically decreased in tumor tissue samples of patients (p=0.001, 95% confidence interval=0.19-4.71). It has been reported that miR-17-5p, miR-30b, miR-30d, miR-216a and miR-216b expression levels were statistically decreased in serum samples of patients than tumor tissues (p=0.001). It has been detected that miR-30d expression is statistically significantly decreased among patients when comparing serum samples of patients and healthy controls (p=0.001, 95% confidence interval=1.32-3.52). According to our data, we are suggesting that Beclin-1 gene may acts like a tumor-supressor in colorectal cancer and miR-17-5p and miR-30d may play a role on regulation of Beclin-1 gene expression. Also, it has been considering that miR-17-5p, miR-30b, miR-30d, miR-216a, miR-216b can not use as a highly reliable biomarker in serum for colorectal cancer diagnose.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    770931

    Evolutionary engineering of rapamycin-resistant yeast

    Evrimsel mühendislikle rapamisine dirençli maya eldesi

    ÖMER ESEN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR

  2. Tez No

    494677

    Deneysel polikistik over sendromu (pkos) modelinde tamoksifen ve klomifenin ovaryum dokusu üzerine etkilerinin otofajik açıdan değerlendirilmesi

    Evaluation of the effects of tamoxifen and clomiphene on ovarian tissue in experimental polycystic ovary syndrome (pcos) model in the terms of autophagy

    GÖKÇE CEREN KUŞÇU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Histoloji ve EmbriyolojiEge Üniversitesi

    Histoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALTUĞ YAVAŞOĞLU

  3. Tez No

    421242

    Understanding the interplay between anti-apoptotic BAG-1 and AKT in mTORC1-mediated autophagy in breast cancer cell lines

    mTORC1 aracılı otofajide anti-apoptotik BAG-1-AKT etkileşiminin meme kanseri hücre hatlarında araştırılması

    ILGIN IŞILTAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY

  4. Tez No

    847068

    Deneysel alzheimer modelinde acacetin'in otofaji yolağı ve eksozom salınımı üzerine etkilerinin araştırılması

    Investigation of the effects of acacetin on autophagy pathway and exosome release in an experimental alzheimer model

    NİLÜFER ERÇİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Tıbbi BiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÜLKAN KILIÇ

  5. Tez No

    777164

    Ranibizumab ve aflibercept'in In vitro oküler toksisitesinin araştırılması

    Investigation of In vitro ocular toxicity of ranibizumab and aflibercept

    EREN EKİCİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Farmasötik ToksikolojiAnkara Üniversitesi

    Farmakoloji ve Toksikoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ENDER YARSAN

Geri Dön