Geri Dön

Hayvansal gıdalardan izole edilen vankomisin dirençli Enterococcus, Pediococcus ve Weissella suşlarının potansiyel risk faktörlerinin fenotipik ve genotipik olarak araştırılması

Phenotypic and genotypic investigations of potantial risk factors of vancomycin resistant Enterococcus, Pediococcus and Weissella strains isolated from animal foods

PDF İndir

  1. Tez No: 487796
  2. Yazar: DİDEM AKPINAR KANKAYA
  3. Danışmanlar: PROF. DR. YASİN TUNCER
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Gıda Mühendisliği, Food Engineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Süleyman Demirel Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 225

Özet

Bu çalışmanın amacı Türkiye genelinde farklı illerden temin edilen çeşitli hayvansal gıdalardan (340 adet) vankomisin dirençli enterokokların (VRE) izolasyonu ve izolatların antibiyotik direncinin, virülens faktörlerinin, biyofilm ve biyojen amin üretim özelliklerinin fenotipik ve genotipik olarak belirlenmesidir. Bu amaçla hayvansal gıdalardan izole edilen 47 adet muhtemel VRE izolatı 16S rDNA sekans analizi ve türe özgü primerler ile E. casseliflavus (3 suş), E. gallinarum (21 suş), E. casseliflavus/E. gallinarum (2 suş), P. acidilactici (6 suş), P. pentosaceus (12 suş), W. cibaria (1 suş), W. confusa (1 suş) ve W. minor (1 suş) olarak tanımlandı. Disk difüzyon test sonuçlarına göre Enterococcus izolatlarının % 53.85'inin 2 ile 6 arasında, Pediococcus ve Weissella izolatlarının tamamının sırasıyla 3 ile 8 arasında ve 4 ile 5 arasında antibiyotiğe karşı çoklu direnç gösterdiği tespit edildi. İzolatların % 57.45'inin siprofloksasin, % 53.19'unun norfloksasin, % 44.68'inin vankomisin, % 44.68'inin teikoplanin antibiyotiklerine karşı dirençli oldukları belirlendi. İzolatlarda en yaygın gözlenen antibiyotik direnç genlerinin gyrA (% 87.23), vanC1 (% 46.81), tetM (% 23.40) ve ermB (% 19.15) olduğu tespit edildi. Enterococcus izolatlarında gözlenen en yaygın virülens genler hyl (% 80.77), ccf (% 38.46), gelE (% 30.77) ve acm (% 30.77), Pediococcus izolatlarında cylM (% 44.44) ve gelE (% 33.33) olarak tespit edilirken, Weissella izolatlarında kullanılan primerlerle herhangi bir virülens genin varlığı tespit edilmedi. İncelenen izolatların % 97.87'sinde biyofilm üretimi tespit edilmiş olmakla birlikte 4 adet izolatın (E. gallinarum DYE7, DYE8, DYE13 ve W. confusa DYE25) güçlü biyofilm üretici olduğu belirlendi. İncelenen 8 adet biyofilm üretim geninden epaB 4 adet Enterococcus izolatında, epaE 1 adet Enterococcus izolatında tespit edildi. İzolatlardan sadece E. gallinarum DYE22 suşunda tiramin üretimi tespit edilirken, aynı izolatta tdc geninin varlığı belirlendi. Diğer izolatlarda fenotipik olarak biyojen amin üretimi belirlenmediği gibi, kullanılan primerlerle de herhangi bir biyojen amin üretim geninin varlığı tespit edilmedi.

Özet (Çeviri)

The aim of this study was to isolate vancomycin resistant enterococci (VRE) from various animal foods (340) provided from different cities in Turkey and determine phenotypic and genotypic characteristics of antibiotic resistance, virulence factors, biofilm and biogenic amine production of isolates. For this purpose, 47 presumptive VRE isolates, isolated from animal foods, were identified at species levels as E. casseliflavus (3 strains), E. gallinarum (21 strains), E. casseliflavus/E. gallinarum (2 strains), P. acidilactici (6 strains), P. pentosaceus (12 strains), W. cibaria (1 strain), W. confusa (1 strain) and W. minor (1 strain) by 16S rDNA sequence analysis and species-specific primers. The disc diffusion test results showed that 53.85 % of the Enterococcus isolates had multiple antibiotic resistance between 2 to 6 and all of the Pediococcus and Weissella isolates showed multiple antibiotic resistance between 3 to 8 and 4 to 5, respectively. It was determined that 57.45 % of isolates were resistant to ciprofloxacin, 53.19 % of isolates norfloxacin, 44.68 % of isolates vancomycin and 44.68 % of isolates teicoplanin antibiotics. The most common antibiotic resistance genes in the isolates were determined gyrA (87.23%), vanC1 (46.81%), tetM (23.40%) and ermB (19.15%). The most common virulence genes were observed hyl (80.77 %), ccf (38.46 %), gelE (30.77 %) and acm (30.77 %) in Enterococcus isolates, cylM (44.44 %) and gelE (33.33 %) in Pediococcus isolates while no virulence gene was detected with the primers used in Weissella isolates. Biofilm production was detected in 97.87 % of examined isolates in addition four isolates (E. gallinarum DYE7, DYE8, DYE13, and W. confusa DYE25) were found to be high biofilm producers. The epaB gene was observed in four Enterococcus isolates and epaE gene was in one Enterococcus isolate from the 8 biofilm production genes examined. Tyramine production was detected only in E. gallinarum DYE22 strain while the tdc gene was determined in the same isolate. The production of biogenic amine was not detected in other isolates as phenotypically as well as any biogenic amine production gene was found with primers used in none of the isolates.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    390162

    Hayvansal kaynaklı gıdalarda enterokokların varlığı, tür düzeyinde identifikasyonları ve antibiyotik dirençliliklerinin belirlenmesi

    Presence of enterococci in animal originated foods, species level identification and determination of antibiotic resistance

    TÜLAY ELAL MUŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MikrobiyolojiUludağ Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FİGEN ÇETİNKAYA

  2. Tez No

    409909

    Sinop ilinde satışa sunulan gıdalardan izole edilen bakterilerin antibiyotik direnç genlerinin belirlenmesi

    Detection of antibiotic resistance genes of isolated bacteria from foods offered for sale in the sinop province

    SEYHAN CİVEK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyolojiSinop Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İSMET BERBER

  3. Tez No

    338205

    Determination of presence and some pathogenic characteristics of motile Aeromonas species in fish and ground beef marketed in Bolu

    Bolu'da tüketime sunulan balık ve kıymalarda hareketli Aeromonas türlerinin varlığının ve bazı patojenite kriterlerinin belirlenmesi

    RUMEYSA KÜÇÜKSARI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    BiyolojiAbant İzzet Baysal Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SEZA ARSLAN

  4. Tez No

    550421

    Çeşitli kaynaklardan izole edilen staphylococcus aureus'un bazı virulens özelliklerinin belirlenmesi

    Determination of some virulence features of staphylococcus aureus isolated from various sources

    PELİN KOÇAK KIZANLIK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Besin Hijyeni ve TeknolojisiAydın Adnan Menderes Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERGÜN ÖMER GÖKSOY

  5. Tez No

    247527

    Gıdalardan izole edilen Staphylococcus aureus suşlarının çeşitli antibiyotiklere karşı duyarlılıklarının araştırılması

    The investigation on the antibiotic sensitivity of Staphlococcus aureus strains isolated from food

    ÇAĞATAY ÇELİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    Besin Hijyeni ve Teknolojisiİstanbul Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HARUN AKSU

Geri Dön