Lösemi hastalarında hRgr geninin T-hücre malignite alt gruplarında gen anlatım düzeylerinin incelenmesi
Analyzing hRgr gene expression levels in subtypes of T cell malignancies in leukemic patients
- Tez No: 501337
- Danışmanlar: PROF. DR. BURÇAK VURAL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 115
Özet
Dtr-hRgr (diseased truncated human Ral GDS Related) proteini, hRgr' nin anormal transkripti tarafından üretilmekte ve sadece T hücreli neoplazmlarda ifade edilmektedir. Bu anlatım, Ras ve Ral GTPaz'ların aktivasyonu ile hücresel dönüşümü indükleyebilmektedir. Literatürde geçen bu bulgular doğrultusunda T hücreli malignite alt gruplarında hRgr ve dtr-hRgr anlatım düzeyleri arasındaki farkları belirlemeyi amaçladık ve insan hematopoietik malignansilerinde hRgr' nin anormal transkriptinin (dtr-hRgr) anlatım seviyeleri inceledik. Bu tez çalışmasında, T ve B kökenli lösemi hastaları arasında hRgr geni gen anlatım düzeyindeki farklılıklar, mikroarray veri analizleri ile halka açık sunulan verisetlerinde incelendi. Ardından ıslak laboratuvar yöntemiyle doğrulama yapılabilmesi için T hücreli lösemi, B hücreli lösemi ve anaplastic büyük hücreli lenfomaya sahip çocuk hastalarda ve kemik iliği doku örneklerinden trizol metoduyla total RNA izolasyonu yapıldı. Hücre kültürleri kontrol amaçlı kullanıldı. hRgr, anormal hRgr ve insan GAPDH genlerine özgü oligonükleotitler ile kantitatif eş zamanlı PZR yapıldı. Karşılaştırmalı katsayılar 2-ΔΔCt metoduyla hesaplandı. Kantitatif PZR analiziyle, anormal hRgr transkriptinin yüksek düzeyde anlatımı sadece T-ALL türevi hücre hatlarında ve T-hücreli malignansi içeren insan dokularında gözlendi (p
Özet (Çeviri)
The dtr-hRgr (diseased truncated human Ral GDS Related) protein, produced by the abnormal transcript of hRgr, expression is only observed in T-cell neoplasm. This expression can induce cellular transformation by activating the Ras and Ral GTPases. With these findings, that mentioned in literature previously, we purposed to determine differences between hRgr and dtr-hrgr expression levels in subtypes of T cell malignancies and analyzed the expression levels of human hRgr's abnormal transcript (dtr-hRgr) in a panel of human hematopoietic malignancies. In this thesis project, public microarray datasets were analyzed and the differential expression levels of hRgr for T and B cell origin leukemia samples were examined. After that, for validation via wet-lab techniques, total RNA was extracted from bone marrow samples of pediatric T cell leukemia, B cell leukemia and anaplastic large cell lymphoma. Cell lines were used as controls. Gene specific oligonucleotides were used for the hRgr, abnormal hRgr and human GAPDH in qRT-PCR. Relative fold changes were calculated using the 2-ΔΔCt method. Analysis by qPCR overexpression of the abnormal hRgr transcript is only observed in T-ALL derived cell lines and in human tissues with T-cell malignancies (p
Benzer Tezler
- Lösemi hastalarında kaspaz 3 ve kaspaz 9 gen polimorfizmleri ve enzim düzeylerinin araştırılması
Investigation for polymorphisms of caspase 3 and caspase 9 gene and enzym levels in leukemia patients
MELEK MUNİROĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Tıbbi BiyolojiMersin ÜniversitesiTemel Tıp Bilimleri Bölümü
PROF. DR. ETEM AKBAŞ
- Identification of polymorphisms in multidrug resistance gene in leukemia patients
Lösemi hastalarında çoklu ilaç dirençliliği genindeki polimorfizmlerin belirlenmesi
PELİN KAYA
Yüksek Lisans
İngilizce
2002
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. UFUK GÜNDÜZ
DOÇ. DR. FİKRET ARPACI
- Assessment of anxiety levels in 'Leukemia' patients
Lösemi hastalarında anksiyete düzeylerinin değerlendirilmesi
MAKARIM RAZZAQ SEKHI SEKHI
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
HemşirelikÇankırı Karatekin ÜniversitesiHemşirelik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ NİLAY ŞAHAN
- Lösemi hastalarında mikroarray analizinin tanıya, risk sınıflamasına ve tedaviye katkısının araştırılması
The contribution of microarray analysis to diagnosis, risk classification, and treatment in leukemia patients
MUSTAFA OĞUZ ACAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
GenetikAnkara ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HATİCE ILGIN RUHİ
- Akut lösemi hastalarında vitamin e ve NOX2 düzeylerinin ilişkileri üzerine biyokimyasal çalışma
Biochemical study on the correlation of vitamin E and NOX2 levels in acute leukemia patients
AHMED ABBAS HAMMOOD AL-GBURI
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
BiyokimyaGaziantep ÜniversitesiBiyokimya Bilimi ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FİLİZ ÖZBAŞ GERÇEKER