Identification of general transcription factor-two-E and mediator complex interactions in the context of pre-initiation complex formation
Genel transkripsiyon faktörü II-E ve mediator kompleksinin etkileşiminin başlama öncesi kompleksi oluşumu bağlamında tanımlanması
- Tez No: 504699
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MURAT ALPER CEVHER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyokimya, Biology, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Transkripsiyon birçok proteinin ve protein kompleksinin gerekli olduğu çok basamaklı bir olaydır. Transkripsiyonu sağlayan proteinler, olayın yapay ortamda yapılmasına olanak sağlayabilecek kadar saptandı. Ancak, transkripsiyon sisteminin oluşumu ve bu oluşumu sırasında proteinlerin etkileşimlerinin neler olduğu hala tam olarak anlaşılmış değil. Genel Transkripsiyon Faktörleri (GTFler) transkripsiyon olması için temel elementler olarak tanımlandı ancak bu elementlerin de promoter bölgesine nasıl getirildiği tam olarak bilinmemekte. Mediator kompleksinin ise arttırıcı sekanslardan aldığı sinyali Başlama Öncesi Kompleksi denen transkripsiyon sistemine ilettiği biliniyor. Bu çalışmada, Transcription Factor-iki-E'nin TATA promoter bölgesine nasıl getirildiğini, bu olayın Mediator kompleksiyle güçlü bir ilgisi olduğunu göstererek karakterize etmeyi amaçladık. Ayrıca Transcription Factor-iki-E'nin Mediator TATA promoter bölgesine getirilmesi için fonksiyonel çekirdek alt birimlerine ek olarak birden fazla Mediator Kompleksi alt birimine ihtiyaç duyulabileceğini belirttik. Ayrıca, literatürdeki var olan bilgilere uygun olarak, Transcription Factor-iki-E'nin RNA Polimeraz II (RNAP II) ve TFIIH ile de birlikte çöktüğünü doğruladık. Her ne kadar bu etkileşimlerin detayı ve doğası henüz tam olarak aydınlatılamamış olsa da bu etkileşimlerin tanımlanmasının Başlama Öncesi Kompleksinin oluşumuna veya daha önceden oluşmuş holoenzim multi proteinlerine dair fikir vereceği ümit edilmektedir.
Özet (Çeviri)
Transcription is a multistep process which requires the presence of many different proteins and protein complexes. The minimal protein components enabling transcription to happen are identified to execute the event in vitro. However, formation of the transcriptional machinery and the interactions of the proteins while forming the machinery are still not fully understood. General Transcription Factors (GTFs) are identified as the essential elements required for the transcription yet, it is still not clearly known how they are being recruited to the promoter site. Mediator Complex is known to relay the signal received from enhancer sequences to the transcription machinery which is called the Pre-Initiation Complex (PIC) right before the transcription. Here, we are aimed to characterize how Transcription Factor-Two-E is being recruited to TATA promoter by showing this recruitment is strongly corelated with Mediator complex. Besides, this recruitment of Transcription Factor-Two-E to TATA promoter may require more than one subunit of Mediator complex in addition to functional core. Also, here we confirm that Transcription Factor-Two-E co-precipitates with RNA Polymerase II (RNAP II) and TFIIH which are consistent with the existing data in literature. However, the details and the nature of these interactions are yet to be clarified. Identification of these interaction will hopefully result in insights about the sequential formation of PIC or pre-formed holoenzyme multi proteins.
Benzer Tezler
- A comparative analysis of Ashik Saz and Ashik Music in West and East Azerbaijan provinces of Iran
İran'ın Batı ve Doğu Azerbaycan bölgelerindeki Aşık Sazı ve Aşık Müziği'nin karşılaştırmalı incelemesi
FARHAD SHIDFAR
Doktora
İngilizce
2015
İstanbul Teknik ÜniversitesiMüzikoloji ve Müzik Teorisi Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
Yükleniyor...
- Бишкек шаарында COVID-19 инфекциясын пцр методу менен диагностикалоонун жыйынтыктарын талдоо
PCR yöntemi ile bişkek şehrinde COVID-19 teşhisinin sonuçlarının araştırılması
AYCAN SADIRBAEVA
- Identification of novel genes involved in planar cell polarity establishment in the Drosophila eye
Drosophila gözünde düzlemsel hücre kutuplaşması kurulmasında rol oynayan yeni genlerin tespit edilmesi
DUYGU KOLDERE
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
Boğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
Yükleniyor...
- Identıfıcatıon of ınhıbıtors targetıng adeabc eflux pump regulators aders ın acınetobacter baumannıı
Acınetobacter baumannıı'de adeabc dışa atım pompası düzenleyicisi olan aders proteinlerini hedefleyen inhibitörlerin tanımlanması
FATİH KEMALOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2026
İstanbul Teknik ÜniversitesiHesaplamalı Bilim ve Mühendislik Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
Yükleniyor...
- Structure and interaction in Cretan leaping dances: Connecting ethnography and computational analysis
Girit danslarının yapısı ve etkileşimi: Etnoğrafya ve bilişimsel analizin bağlantısı
ANDRE HOLZAPFEL
