Use of KASP assay in sex determination of Pistacia
Pistacia genus'unda cinsiyet ayrımının KASP yöntemiyle belirlenmesi
- Tez No: 506330
- Danışmanlar: PROF. DR. AHU ALTINKUT UNCUOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyomühendislik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 62
Özet
Pistacia cinsi Anacardiaceae (Cashew) ailesine ait çok yıllık bir bitkidir. Türlere ait meyveler, gıda, sağlık ve fırıncılık endüstrisinde hammadde değeri itibariyle çok önemlidir. Türler membranöz veya deri yaprak, her mevsim yeşil veya kışın yaprak döken gibi farklı karakterlere sahipken, bilinen en yaygın genel özellikleri bireylerinin çift evcikli (dioik) oluşudur. Dioik karakter (erkek / dişi ) bireylerin anatomik veya yapısal özelliklerini etkilemektedir; örneğin meyve toplanma mevsimi veya meyve boyutu bireyin erkek veya dişi oluşuna göre aynı türde değişiklik gösterir, bu durum ise üreticiler için çok önemlidir. Markör destekli seleksiyon (MAS) umut verici bir yöntemdir. Cinsiyetin veya diğer birçok karakterin belirlenmesinde bitkilerin çoğalma aşamasına gelmesini ve biçimsel özellikler gösteresini beklemeden kısa süre içerisinde kesin sonuçlar almamıza yardımcı olur. Bu araştırmada, sekiz farklı Pistacia türü için KASP (Kompetitif Allel Spesifik PZR) analiz teknolojisi kullanılmış ve tek nükleotid polimorfizmine (SNP) dayalı olası cinsiyetler markörlerine odaklanılmıştır. Kapsamlı bir literatür taramasından sonra 3 muhtemel SNP, KASP primer çiftlerine dönüştürüldü. KASP analizleri sonucunda, 167992 (A/T) SNP primerinin P. atlantica, P. vera ve P. terebinthus türlerinin dişi bireylerini, 133396 (C/G) SNP primerinin sadece P. vera dişi bireyini ayır ederken, 176863 (A/G) SNP primeri için herhangi bir polimorfizm görülmediğini gözlemlendi. Bu sonuçlar, Pistacia'nın ZW/ZZ (Dişi/Erkek) cinsiyet belirleme sistemini de tüm ayrım görülen dişi bireylerin heterezigot karakter göstermesi yönünden desteklemiştir. Çalışmadan elde edilen veriler, bitki üreticilerini zaman açısından doğrudan etkileyebileceği gibi ve moleküler cinsiyet belirteçlerinde gelecek çalışmalara öncül niteliğindedir. Bu araştırma Marmara Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi (Proje No: FEN-C-YLP-090217-0049) tarafından desteklenmiştir.
Özet (Çeviri)
The genus Pistacia is a perennial plant and belongs to Anacardiaceae (Cashew) family. The fruits of species have an extreme importance in food, health and baking industry as a raw material. While the species have different characters like membranous, leather, deciduous or evergreen, the most common known character is dioecism of individuals. The dioecious character (being a male/female) affects the anatomical or structural traits of individuals like picking season or fruit size so identify the individual is very crucial for producers. Marker Assisted Selection (MAS) is a promising process and may help to screen the sex or many other traits of plant seedlings quickly before they reach reproduction stage or show morphological data in more than several years. In this research, eight different Pistacia species were analyzed with Competitive Allele Specific PCR (KASP) assay technology as a marker screening system and it was focused on gender determination based on single nucleotide polymorphism (SNP). After the comprehensive literature search, 3 possible SNP were converted to KASP Primer according to their positions. On the result of KASP assay, 167992 (A/T) SNP discriminated the 3 female individuals of Pistacia which are P. atlantica Desf, P. vera L. and P. terebinthus L., 133396 (C/G) SNP primer discriminated only P.vera L. female and any polymorphism was not seen for SNP 176863 (A/G) position. These results were supportive to Pistacia's ZW/ZZ (female/male) sex determination system because all discriminated females showed heterozygous character as reported. The data obtained from the study can directly influence the plant producers in terms of time and may be the predecessors of the upcoming studies about molecular sex markers. This research has been supported by Marmara University Research Foundation (Project No: FEN-C-YLP-090217-0049).
Benzer Tezler
- Endodontik tedavi görmüş molar dişlerin farklı tekniklerle yapılan restorasyonların kasp hareketine ve kırılma dayanımına etkilerinin değerlendirilmesi
Evaluation of the influence of restoration of endodontically treated molars with different techniques on cusp deflection and fracture strength
MERVE AKSOY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Diş HekimliğiGazi ÜniversitesiRestoratif Diş Tedavisi Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ CEMİLE KEDİCİ ALP
- Ayçiçeği (Helianthus annuus L.)'nde oleik asit içeriğinin KASP markörleri ile belirlenmesi
Determination of oleic acid content in sunflower (Helianthus annuus L.) by KASP markers
MUHAMMED BİLALOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyolojiMarmara ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YILDIZ AYDİN
PROF. DR. AHU ALTINKUT UNCUOĞLU
- Evaluations of clinically important snps and polymorphisms of serotonin transporter (SERT) gene
Serotonin taşıyıcı geninde (SERT) klinik öneme sahip genetik değişimlerin değerlendirilmesi
HATİCE KÜBRA ŞENGÜL
- Dişsiz mandibulada kısa ve açılı implantlarla desteklenen tedavi seçeneklerinin stres dağılımlarının incelenmesi
Investigation of stress distributions of treatment options supported by short and tilted implants in the edentulous mandibula
MURAT ÇOLAK
Doktora
Türkçe
2019
Diş HekimliğiBezm-i Alem Vakıf ÜniversitesiAğız Diş ve Çene Cerrahisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERDEM KILIÇ
- Bankacılıkta döviz pozisyonu yönetiminde forward ve swap
Use of forward and swaps by banks as foreign exchange position management
Ş. AYSEL ATİLA
Yüksek Lisans
Türkçe
1999
BankacılıkMarmara ÜniversitesiSermaye Piyasası ve Borsa Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİYAZİ BERK
