Doğu Akdeniz bölgesi turunçgil üretim alanlarında turunçgil psorosis virüsü (CPsV)'nün yaygınlığının araştırılması, moleküler olarak tanılanması ve karakterizasyonu
Investigation of the prevalence of citrus psorosis virus (CPsV) in the citrus production areas of the Eastern Mediterranean region, and its molecular identification and characterization
- Tez No: 513959
- Danışmanlar: PROF. DR. NÜKET ÖNELGE
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 102
Özet
Bu çalışmada, Doğu Akdeniz Bölgesinde Turunçgil kavlama hastalığı etmeni Citrus psorosis virus (CPsV) ile bulaşık olduğu bilinen turunçgil türlerinden portakal, mandarin ve altıntop bahçelerinde etmenin yaygınlığı belirlenmiş ve alınan bitki örneklerinin biyolojik ve moleküler karakterizasyonu yapılmıştır. CPsV varyantları arasındaki farklılıklar birbirinden ayrılarak nükleotid dizilimleri belirlenmiştir. CPSV'nin tanılanması ve karakterizasyonu için 50 farklı turunçgil ağacından şiddetli kabuk kavlama lezyonu ve genç yapraklarda damar bantlaşması, meşe yaprağı deseni simptomu, yaşlı yaprak ve concave gum simptomları gösteren farklı örnekler toplanmıştır. Toplanan örnekler TT-PZR çalışmalarıyla analiz edilmiştir. Kullanılan farklı primer çiftleri ile CPsV'nin farklı gen bölgeleri belirlenmiştir. Yapılan biyolojik indeksleme çalışmalarında ise tohumdan yetiştirilen 8 aylık Pineapple portakal (Citrus sinensis) fidanlarına CPsV'nin inokulasyonu yapılmış ve enfekteli indikatör bitkilerin ilk gelişen sürgünlerinde CPsV'nin damar bantlaşması ve şok simptomları gözlemlenmiştir. Blast analizi ve NCBI gen bankasındaki CPsV'nin referans genomlarının karşılık gelen bölgeleri ile nükleotid dizilimlerinin %98 oranında benzerliğe sahip olduğu belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
In this study, the prevalence of orange, mandarin and grapefruit orchards in the Eastern Mediterranean region known to be contaminated with Citrus psorosis virus (CPSV) disease has been determined. Biological and molecular characterization of collected plant samples was carried out. The genomic differences between the CPSV variants were separated to determine nucleotide sequences. For the identification and characterization of CPSV, samples were taken from 50 different citrus trees with severe barking lesions, vein banding and oak leaf pattern symptoms on young leaves, old leaves and concave gum symptoms. The collected leaf samples were analyzed by RT-PCR studies. Different gene pairs of CPSV were identified by using different primer pairs.In the biological indexing studies, CPSV was inoculated to 8 month old Pineapple oranges (Citrus sinensis) plants which grown from the seed. Vein banding symtoms and shock reaction of CPSV were observed in the first growth flushes of infected indicator plants during biological indexing assays. Blast analysis showed that CPSV in the NCBI gene bank had 98% similarity to nucleotide sequences with corresponding regions of reference genomes.
Benzer Tezler
- Antalya ili turunçgil alanlarında psorosis virüsünün belirlenmesi, biyolojik ve moleküler karakterizasyonu
Detection, biological and molecular characterization of citrus psorosis virus from different citrus growing regions of Antalya
BENGİ TOPKAYA KÜTÜK
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
ZiraatSüleyman Demirel ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BAYRAM ÇEVİK
- Doğu Akdeniz Bölgesinde turunçgillerde antraknoz etmeni colletotrichum türlerinin morfolojik, patojenik, moleküler karakterizasyonu ve fungisit duyarlılıkları
Morphological, pathogenic, molecular characterization and fungicides sensitivity of colletotrichum species the causal agent of anthracnose on citrus in Eastern Mediterranean Region
AYSUN UYSAL
Doktora
Türkçe
2019
ZiraatHatay Mustafa Kemal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞENER KURT
- Turunçgil klorotik cüceleşme ile ilişkili virüs (Citrus chlorotic Dwarf associated virus; CCDaV)'ün etiolojisi ve moleküler karakterizasyonu
Etiology and molecular characterization of Citrus chlorotic Dwarf associated virus (CCDaV)
ALİ KARANFİL
Doktora
Türkçe
2019
ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SAVAŞ KORKMAZ
- Doğu Akdeniz bölgesi fidanlık ve satsuma bahçelerinde satsuma cücelik virüsü (SDV) ve turunçgil klorotik cüceleşme virüsü (CCDaV) nün araştırılması ve moleküler karakterizasyonu
The research of satsuma dwraf virus (SDV) and citrus chlorotic dwarf virus (CCDaV) in Eastern Mediterranean region nursery and satsuma growing area and molecular characterization
AYKUT ÖZTÜRK
- Farklı turunçgil türlerinin Citrus chlorotic dwarf assocıated vırus (CCDaV)'üne dayanıklılık durumlarının belirlenmesi ve bazı R dayanıklılık genlerinin ekspresyon analizleri
Determination of resistance/susceptibility of important citrus species to Citrus chlorotic dwarf associated virus (CCDaV) and expression analyses of some R genes
BENGİ TOPKAYA
Doktora
Türkçe
2020
ZiraatIsparta Uygulamalı Bilimler ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BAYRAM ÇEVİK