Geri Dön

Türk popülasyonundaki ülseratif kolitli hastalarda TLR1(RS4833095) gen polimorfizminin hastalıkla ilişkisinin değerlendirilmesi

Evaluation the association between TLR1(RS4833095) gene polymorphism and ulcerative colitis in the turkish population

PDF İndir

  1. Tez No: 522888
  2. Yazar: DİLEK ÇAĞLAYAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. HÜSEYİN ATASEVEN
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Gastroenteroloji, Gastroenterology
  6. Anahtar Kelimeler: ülseratif kolit, toll like reseptör, single nukleotid polimorfizm, ulcerative colitis, toll like receptor, single nukleotid polymorphism
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Necmettin Erbakan Üniversitesi
  10. Enstitü: Meram Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 63

Özet

Giriş:Ülseratif kolit; kolonun mukozal tabakasında sınırlı, tekrarlayan inflamasyon dönemleri ile seyreden bir hastalıktır. Ülseratif kolit; genetik ve çevresel etmenlerin kombine etkisi sonucu ortaya çıkan multifaktöriyel bir hastalıktır. Birçok proinflamatuvar sitokinin ülseratif kolit etyolojisinde rol aldığı gösterilmiştir.(IL 23 R, TNF alpha, IL 27 … ) Toll like reseptörler, mikrobiyal antijenleri saptayan ve antijenlere karşı yanıt oluşturan ökaryotik hücre yüzey molekülleridir. TLR sinyal yolağındaki son ortak yol transkripsiyon faktörlerini içerir; NFB ve aktive edici protein 1 (AP -1) . Bu transkripsiyon faktörleri; önemli proinflamatuvar sitokinleri kodlayan (TNF, IL1, IL6, IL8, IL12 gibi) birçok geni düzenler. Bu çalışmada; Türk popülasyonunda Ülseratif kolitli hastalardaki TLR1(rs4833095) single nükleotid polimorfizminin değerlendirilmesi ve sağlıklı popülasyonla karşılaştırılması, tanımlanan polimorfizmlerin hastalıkla ilişkisinin değerlendirilmesi, tanımlanan single nükleotid polimorfizmlerinin hastalığın yayılımı ve şiddeti ile ilişkisinin değerlendirilmesi amaçlanmaktadır. Materyal metod: Çalışmaya Necmettin Erbakan Üniversitesi Meram Tıp Fakültesi Gastroenteroloji kliniğinde ülseratif kolit tanısıyla takipli 18 yaş üstünde 90 hasta ve 18 yaş üzerinde 90 kişiden oluşan sağlıklı kontrol grubu dahil edildi. Çalışmaya alınan hastaların aldıkları medikal tedavi, laboratuvar verileri, koloskopi raporları ve bulguları, ekstraintestinal manifestasyonları ile ilgili veriler hastane kayıt sistemi retrospektif olarak taranarak elde edildi. Çalışmaya alınan hastalardan ve sağlıklı kontrollerden 3-4 cc kan örneği EDTA'lı tüplere alındı. Örnekler DNA izolasyonu yapılana kadar -80°C' de saklandı. DNA'lar izole edildikten sonra, elde edilen DNA' ların kalitesi nanogen spektrofotometri ile kontrol edildi. Kaliteli DNA' lar RT-PCR ile TLR1(RS 4833095) single nükleotid polimorfizmi açısından değerlendirildi. İstatiksel analizler için IBM SPSS versiyon 22.0 programı kullanıldı. Sayısal değişkenler ortalama ± standart sapma ile kategorik değişkenler ise sayı ve yüzde ile gösterildi. Gruplar arası kategorik verilerin karşılaştırılması için Chi-square testi kullanıldı. Anlamlılık düzeyi p0,05) Türk popülasyonunda TLR1(RS4833095) single nükleotid polimorfizmi ile hastalığın kolondaki yayılımı arasında anlamlı ilişki saptanmadı.(p>0,05) Türk popülasyonunda TLR1(RS4833095) single nükleotid polimorfizmi ile hastalığın şiddeti ve remisyon sağlanması için gerekli tedavi arasında anlamlı ilişki saptanmadı.(p>0,05) Sonuç: Ülseratif kolit çevresel, genetik, konağa bağlı faktörlerin kombine etkisi sonucu meydana gelen bir hastalıktır. Etyopatogenezinde immündisregülasyonun rol oynadığına dair önemli kanıtlar vardır. Bakteriyel veya viral DNA, flagellin veya lipopolisakkarit(LPS) gibi Patojen İlişkili Moleküler Pattern'ler TLR'ler tarafından bağlanabilir ve birçok pro- ve antiinflamatuvar sitokini aktive ederek inflamasyonu indükleyebilir. Bank'ın Danimarkalı kohortta yaptığı çalışmada TLR1(RS4833095) homozigot varyant genotipinin ülseratif kolit gelişimi için artmış riskle ilişkisi bulunmasına rağmen Türk popülasyonunda yapılan çalışmada anlamlı fark bulunmamıştır. Sonuç olarak genetik polimorfizm çalışmaları coğrafik dağılımlara göre farklılık göstermektedir.

Özet (Çeviri)

Introduction: Ulcerative colitis is a disease, limited to the mucosal layer of the colon and characterized by recurring inflammatory periods of the colon. Ulcerative colitis is a multifactorial disease that results from combined effects of genetic and environmental factors. Several proinflammatory cytokines have been shown to play a role in the etiology of ulcerative colitis. (IL 23 R, TNF alpha, IL 27 … ) Toll-like receptors are eukaryotic cell surface molecules that detect microbial antigens and respond to antigens. The last common pathway in the TLR signaling pathway involves transcription factors; NFB and activating protein 1 (AP -1). These transcription factors regulate genes which encodes important proinflammatory cytokines (such as TNF IL1 , IL 6, IL 8, IL 12...). In this trial, we aim to evaluate TLR1 (rs4833095) single nucleotide polymorphism in patients with ulcerative colitis and to compare with healthy population in the Turkish population. We also aim to evaluate the relation between the defined polymorphism and the risk of developing disease and the severity of the disease and the extension of the colon of the disease in the Turkish population. Materials and method: 90 patients, up to 18 years old, with ulcerative colitis that are outpatients in the gastroenterology clinic of the N.E.U. Meram Faculty of Medicine are included into the trial. 90 healthy controls, up to 18 years old, also are included. Data, which is about medical treatment, laboratory findings, colonoscopy reports and findings, extraintestinal manifestations of patients, is obtained by scanning hospital registry system retrospectively. 3-4 cc blood samples were taken into the tube, which has EDTA, from participants. All samples were kept at -80°C. After DNA isolation, the quality of obtained DNAs was checked by nanogen spectrophotometry. The DNAs of all patients and the control group were evaluated for polymorphism by using RT-PCR. SPSS 22.0 software program is used for the data entry and analysis, for the summary of the data concerning categorical variables the numbers and percentages are used. Mean ± standard deviation and median values were used for the numerical variables. Pearson Chi-square test was used to determine the relationships between the categorical data. The results were found to be statistically significant, with 95% confidence interval and the p-value less than 0.05. Findings: TLR1(rs4833095) single nucleotid polymorphisms weren't associated with increased risk of ulcerative colitis in the Turkish population(p>0,05). TLR1(rs4833095) single nucleotid polymorphisms weren't associated with extension of the colon of the disase in the Turkish population(p>0,05). TLR1(rs4833095) single nucleotid polymorphisms weren't associated with the severity of the disease in the Turkish population (p>0,05). Conclusion: Chronic inflammatory bowel diseases (IBD), Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC), are complex diseases that result from the interaction of numerous genetic and environmental factors TLR signaling pathways are involved in the autoimmune response to Pathogen-Associated Molecular Patterns (PAMPs) such as bacterial or viral DNA, flagellin or lipopolysaccharide (LPS). PAMPs can be bound by the membrane bound TLRs and induce inflammation by activating a number of pro- and anti-inflammatory cytokines The homozygous variant genotype of TLR1 743 T>C (rs4833095) (p = 0.004) was associated with increased risk of UC in the Danish cohort in the trial by Bank and friends. But in the Turkish population, there was no association between the homozygous variant genotype of TLR1 743 T>C (rs4833095) and the risk of ulcerative colitis (p>0,05). As a result, the trials of the genetic polymorphism are differed by geographical distribution.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    298763

    İltihabi barsak hastalıklarında interlökin 23 reseptör ve atg16l1 gen polimorfizmleri ve klinikle ilişkisi

    Interleukin 23 receptor, and atg16l polymorphisms in ınflammatory bowel diseases, and relationship with the clinical course

    GÖKHAN KABAÇAM

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    GastroenterolojiAnkara Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MURAT TÖRÜNER

  2. Tez No

    163173

    İnflamatuar barsak hastalıklarında peroksizom proliferator aktivite resptör - gamma (PPAR-γ) geninde Pro12Ala polimorfizmin sıklığı

    Başlık çevirisi yok

    ÖZLEN ATUĞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    GastroenterolojiMarmara Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. HÜLYA ÖVER HAMZAOĞLU

  3. Tez No

    732375

    İnflamatuvar barsak hastalıklarında TLR2 (rs111200466) ve TLR9 (rs187084) gen polimorfizmlerinin araştırılması

    Investigation of TLR2 (rs111200466) and TLR9 (rs187084) gene polymorphisms in inflammatory bowel diseases

    ROSELINE EKE EMELE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyoteknolojiNiğde Ömer Halisdemir Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SONGÜL BUDAK DİLER

  4. Tez No

    150371

    İnflamatuvar Barsak hastalığında sitokin gen polimorfizmleri

    Başlık çevirisi yok

    YASEMİN ÇELİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Disiplinlerarası Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MİTHAT BOZDAYI

  5. Tez No

    688658

    Türk popülasyonundaki obez bireylerde subkortikal yapıların MriCloud yöntemi ile volümetrik analizi

    Volumetric analysis of subcortical structures in obse individuals in turkish population with MriCloud method

    BEYZA NUR URUL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Anatomiİstanbul Medipol Üniversitesi

    Anatomi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TUĞRUL ÖRMECİ

    PROF. DR. ALPER ATASEVER

Geri Dön