Van Gölü'nden toplanan sediment örneklerinden metilotrofik bakterilerin izolasyonu ve karakterizasyonu
Isolation and characterization of methyltrophic bacteria from sediment samples collecting Van Lake
- Tez No: 530232
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ERDAL ÖĞÜN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 83
Özet
Bu araştırmada; metilotrofik bakterilerin izolasyonunda kullanılan sediment örneği Van Büyükşehir Belediyesi Atık Su Arıtma tesisinin açıldığı alandan sağlandı. Bu çalışmada metilotrofik bakterilerin izolasyonunda sadece bir izolatın % 1-5 oranında metanol içeren ortamda üredeği gözlemlendi. Halomonas S1 izolatı olarak adlandırılan bu izolatın morfolojik, fizyolojik, biyokimyasal özellikleri belirlenerek 16S rRNA gen bölgesinin dizi analizi gerçekleştirildi. İzolatlardan yalnız S1 kültürünün tek karbon ve enerji kaynağı olarak %1 metanol içeren besi yerinde üreyebildiği görüldü. Daha kesin bir sonuç elde etmek için S1 kültürü NMR tekniği kullanılarak test edildikten sonra S1 kültürürnün metanolü yegane enerji ve karbon kaynağı olarak kullanma yeteneğine sahip olduğu gözlemlendi. 16S rDNA gen bölgesi; filogenetik analizde 1202 nükleotit'lik bir bölgede kıyaslanan S1 izolatının, 16 nükleotid fark ve % 98.6 benzerlik ile Halomonas desiderata (NR 026274)'ya benzediği tespit edilmiştir. Aynı zamanda BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) programı kullanılarak Gen Bankasındaki veritabanı ile karşılaştırılması sonucu suşun %100 benzerlikle Halomonas desiderata olduğu bulunmuştur.
Özet (Çeviri)
In this study, the sediment sample used for the isolation of methylotrophic bacteria was supplied from the area where the Van Metropolitan Municipality Wastewater Enhancement Plant was opened. In this study, bacterial reproduction was observed in the isolation of methylotrophic bacteria only in a medium containing 1-5% methanol of one isolate. Sequence analysis of the 16S rRNA gene region was performed by determining the morphological, physiological and biochemical properties of this isolate called Halomonas S1 isolate. It was observed that only S1 isolate were able to produce only carbon from the isolates and 1% methanol in the feed as energy source. In order to obtain a more precise result, it was observed that S1 culture had the ability to use methanol as the only energy and carbon source after it was tested using NMR technique. The S1 isolate compared to the 1202 nucleotideregion in the 16S rDNA gene region phylogenetic analysis was found to be similar to Halomonas desiderata (NR 026274) with 16 nucleotide differences and 98,6% similarity. İt is also found that the database in the GenBank using BLAST(Basic Local Alignment Search Tool) programe is Halomonas desiderata with 100% similarity to the comparator isolate.
Benzer Tezler
- Van Gölü'nün farklı bölgelerinden toplanan su ve sediment örneklerinden L-asparaginaz ve ürikaz enzimi üreten alkalofilik bakterilerin izolasyonu ve karakterizasyonu
Isolation and characterization of alkalophilic bacteria producing L-asparaginase and uricase enzyme from water and sediment samples collected from different regions of Lake Van
FİRDEVS ESEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyolojiVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiGenel Biyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ERDAL ÖĞÜN
- Source and geochemistry of acidic waters in King George Island, Antarctic peninsula
Antarktika King George Adası'nda gelişen asidik suların kaynağı ve jeokimyası
ŞEVVAL YALÇINKAYA BAY
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Jeoloji Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiKutup Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURGÜL ÇELİK BALCI
PROF. DR. BURCU ÖZSOY
- Van Gölü'nden toplanan su ve sediment numunelerinden izole edilen bakterilerin lakkaz ve mannanaz enzimlerini üretme kabiliyetleri
The production capabilities of laccase and mannanase enzymes of the bacteries isolated from water and sediment samples collected from the Van Lake
NEVROZ ASLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
MikrobiyolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ERDAL ÖĞÜN
- Türkiye'de dağılım gösteren Capoeta cinsine ait türlerin taksonomik revizyonu
Taxonomic revision of the species belong to genus Capoeta distributed in turkey
CÜNEYT KAYA
Doktora
Türkçe
2019
Su ÜrünleriRecep Tayyip Erdoğan ÜniversitesiSu Ürünleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DAVUT TURAN
- Van Gölü havzası Helophorıdae (Coleoptera) faunasının araştırılması
Investigation of helophoridae (Coleoptera) fauna in Lake Van basin
GANİ ERHAN TAŞAR