The analysis of the structural similarity of some antidepressants and anti-inflammatory molecules
Bazı antidepresan ve antienflamatuvar moleküllerin yapı benzerliklerinin tayini
- Tez No: 535885
- Danışmanlar: DOÇ. DR. FİLİZ ESRA ÖNEN BAYRAM
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Eczacılık ve Farmakoloji, Pharmacy and Pharmacology
- Anahtar Kelimeler: antidepresan, antienflamatuvar, yapı, benzerlik, komorbid hastalık, Antidepresif ajanlar, Antiinflamatuar ajanlar, Depresyon, Komorbidite, Moleküler yapı, İnflamasyon, antidepressant, anti-inflammatory, structure, similarity, comorbid diseases, Antidepressive agents, Anti inflammatory agents, Depression, Comorbidity, Molecular structure, Inflammation
- Yıl: 2018
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Farmasötik Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Günümüzde birçok çalışma depresyon ile enflamasyon hastalıklarını ilişkilendirmekte ve bu bağlantının temelini oluşturan mekanizmaları aydınlatmaktadır. Ayrıca aynı anda seyredebilen bu iki hastalığın tedavi stratejilerinde antienflamatuvar (AI) ve antidepresan (AD) moleküllerinin beraber kullanılması da önerilmektedir. Ancak, bildiğimiz kadarıyla, bu iki hastalığın tedavisinde kullanılan bileşiklerin yapılarının benzerliğini araştıran bir çalışma henüz gerçekleştirilmemiştir. Bu nedenle, bu çalışma AI ve AD bileşiklerinin yapı benzerliklerinin bilgisayar ortamında araştırmayı hedeflemektedir. Çalışmada kullanılacak yapılar Clarivates Analytics veritabanı (Web of Science) 2008-2017 aralığında taranarak elde edilmiştir. Elde edilen yapıların benzerlikleri önce manüel olarak daha sonra da bilgisayar ortamında cosine ve Tanimoto katsayıları hesaplanarak belirlenmiştir. Çalışma yapısal benzerlik gösteren birçok molekül ortaya çıkarmış ve bunlardan özellikle ikisinin olduça yakın yapıda olduklarını saptamıştır. Benzer bulunan yapılar KMUP-1 olarak da bilinen 7-{2-[4-(2-klorofenil)piperazin-1-il]butil}-1,3-dimetilpürin-2,6-dion (AI8) ve 7-{4-[4-(3-klorofenil)piperazin-1-il]butil}-1,3-dimetilpürin-2,6-diondur (AD10) 96% benzerlik gösterdi. Çalışma ayrıca AD16 ve AD17 kumarin türevlerinin de AI12 türeviyle %80 oranında yapı benzerliği gösterdiğini ortaya koymuştur.
Özet (Çeviri)
Currently many studies link depression to inflammation and mechanism that underlie this connection are being elucidated. Also new treatment strategies for these comorbid diseases that combine the use of antidepressants (AD) with anti-inflammatory agents (AI) are being suggested. However, to the best of our knowledge, no study yet investigated the structural similarity of the compounds used to treat these two diseases. Thus, in this study we examined whether there is any structural similarity between AD and AI molecules in silico. We gathered from the literature the AI and AD derivatives using Clarivates Analytics database (Web of Science) and we covered the period from 2008-2017. Then we did a manual search and obtained the most similar structures. In order to be able to discuss our results we also used computational methods and measured the similarity of the compounds using the cosine and Tanimoto similarity coefficients. By this method, we found 12 similar structures two of these, which are 7-{2-[4-(2-chlorophenyl)piperazin-1-yl]ethyl}-1,3-dimethylpurine-2,6-dione known as (KMUP-1) (AI8), and 7-{4-[4-(3-chlorophenyl)piperazin-1-yl]butyl}-1,3-dimethylpurine-2,6-dione (AD10), their similarity was 96%. We found also that the coumarin derivatives AD16 and AD17 are 80% similar to the compound AI12.
Benzer Tezler
- Bazı gentianella türlerinin fitokimyasal analizleri ve sekonder metabolitlerinin BDNF (Beyin-türevli nörotrofik faktör) üzerindeki etkileri
Phytochemical analysis of some gentianella species and their secondary metabolites' effects on BDNF (brain-derived neurotrophic factor)
PINAR İKİZ
Doktora
Türkçe
2022
Eczacılık ve FarmakolojiHacettepe ÜniversitesiFarmakognozi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FUNDA NURAY YALÇIN
- The diffusion and institutionalization of professional personnel/human resources management discourse in Turkey: A narrative approach, 1900-1999
Türkiye'deki profesyonel personel/insan kaynakları yönetimi söyleminin yayılımı ve kurumsallaşması: Bir anlatı yaklaşımı, 1900-1999
MEHMET ERÇEK
- Thomas Ades'in Living Toys eserinin birinci bölümünün kümesel analizi
The pitch-class set theory analysis of the first movement of living toys by thomas ades
BURAKCAN OLÇARAY
- Türkiye'de popüler müziğin benzerliğini oluşturan ortak unsur: Ritim yapıları
The common element that forms the similarity of popular music in Turkey: Rhythm structures
ERKAN KANAT
Doktora
Türkçe
2023
Müzikİstanbul Teknik ÜniversitesiMüzikoloji ve Müzik Teorisi Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. SONGÜL KARAHASANOĞLU
- Betonarme binaların tam ölçekli test modellerinin sonlu elemanlar yöntemi ile deprem analizi
Seismic analysis of full-scale test models of reinforced concrete buildings using the finite element method
ONUR ÖZDOĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
İnşaat MühendisliğiSakarya Üniversitesiİnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERKAN ÇELEBİ
