Geri Dön

Tiroid kanserinin bazı glikanlar ve bazı eser elementler ile ilişkisinin spektroskopik yöntemler kullanılarak belirlenmesi

Determining the relationship between thyroid cancer and some glycans and some trace elements using spectroscopic methods

PDF İndir

  1. Tez No: 540095
  2. Yazar: ÖMER FARUK KOÇAK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. YÜCEL KADIOĞLU
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Kimya, Eczacılık ve Farmakoloji, Chemistry, Pharmacy and Pharmacology
  6. Anahtar Kelimeler: Biyobelirteçler-tümör, Eser elementler, Glikomikler, Karsinoma-papiller, Kütle spektroskopisi, Neoplazmlar, Parafine gömme-doku kesitleri, Spektrofotometri, Tiroid hastalıkları, Tiroid neoplazmları, Biomarkers-tumor, Trace elements, Glycomics, Carcinoma-papillary, Mass spectroscopy, Neoplasms, Paraffin embedding, Spectrophotometry, Thyroid diseases, Thyroid neoplasms
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Atatürk Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Analitik Kimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Amaç: Papiler Tiroid Kanseri tüm dünyada görülme insidansı artan bir tiroid kanseri türüdür. PTK'nın teşhis ve tedavisinin iyileştirilebilmesi ve bu kanser türünün varyantları hakkında detaylı bilgiye sahip olmak için yeni çalışmalara ihtiyaç duyulmaktadır. Bu çalışmada PTK tanısı almış hastalara ait kanserli ve sağlıklı tiroid dokusu örneklerinin proteinlerinin MALDI-TOF-MS yöntemi ile N-glikolizasyon profillerinin ve yine aynı dokuların eser element konsantrasyonlarının ICP-MS yöntemi ile belirlenmesi amaçlanmaktadır. Materyal ve Metot: Formalinle sabitlenmiş parafine gömülü doku örnekleri ksilen ile deparafinize ve etanol ile rehidrasyona maruz bırakıldı. Örnekler bu aşamada ikiye ayrılarak N-glikan ve eser element analizlerinde kullanıldı. N-glikan analizi için alınan numunaler denatürasyon işleminin ardından PNGase-F enzimi ile N-glikan yapılarının peptidlerden koparılarak serbest hale geçmesi sağlandı. Etiketleme, saflaştırma ve zenginleştirme işlemlerinin sonrasında N-glikanlar MALDI-TOF-MS cihazı ile pozitif, reflectron modda) analiz edildiler. Eser element analizi için ise mikro dalga yöntemi kullanılarak ICP-MS sisteminde 1550 W'lık bir radyo frekansında, 15 L/dak argon (Ar) plazma gaz akış hızı ile analiz edildiler. Sonuçlar istatistiksel analizlerle yorumlandı. Bulgular: Yapılan analizler sonucunda kanserli ve sağlıklı gruplar arasında N-glikan, N-glikan grupları ve eser elementler açısından anlamlı(p<0,05) ya da çok anlamlı (p<0,001) farklılıklar gözlemlenmiştir. Ayrıca papiler tiroid kanserinin varyantlarına göre de incelenen analiz sonuçları, en sık görülen üç varyanta ait kanserli ve sağlıklı dokuda ki N-glikan, N-glikan grubu ve eser element miktarları açısından da anlamlı farklılıklar göstermiştir. Yapılan korelasyon analizinde ise bazı eser elementler ile N-glikanlar arasında önemli ilişkiler olduğu ortaya koyulmuştur. Sonuç: N-glikan gruplarından 6 tanesinin kanserli ve sağlıklı dokularda biyobelirteç olacak kadar etkili olduğu görülmüştür. Eser elementlerin ve N-glikanların kanserli dokularda farklılık gösterdiği, PTK'nın varyantları açısından da etkili oldukları gözlemlenmiştir.

Özet (Çeviri)

Aim: Papillary Thyroid Cancer (PTC) is a type of thyroid cancer whose incidences have increased all over the world. New studies are needed to improve the diagnosis and treatment of PTC and to acquire detailed information about the variants of this type of cancer. In this study, the aim is to determine the proteins of the cancerous and healthy sample tissues of patients diagnosed with PTC using the MALDI-TOF-MS method and to determine the N-glycolization profiles and trace element concentrations of the same tissues with ICP-MS method. Material and Method: Samples of paraffin-embedded tissue fixed with formaldehyde were subjected to deparaffinization with xylene and rehydration with ethanol. At this stage, the samples were divided into two and used in N-glycan and trace element analysis. After the samples taken for N-glycan analysis went through the denaturation process, The PNGase-F enzyme and N-glycan structures were separated from the peptides and released state was achieved. After labelling, purification and enrichment, N-glycans were analysed using the MALDI-TOF-MS device in positive, refrectron mode. For the trace element analysis, they were analyzed with 15 l/min argon (Ar) plasma gas flow rate using the the microwave method at a radio frequency of 1550 W in the ICP-MS system. The results were interpreted using statistical analysis. Results: As a result of the analyses, significant differences(p<0,05) or very significant differences (p<0,001) were observed between the cancerous and healthy groups. In addition, the analysis results inspected according to the papillary thyroid cancer variants has shown significant differences in the N-glycan, N-glycan group and trace element amounts of the cancerous and healty tissues belonging to the three most commonly observed variants. In the correlation analysis, it was revealed that there are important relationships between some trace elements and N-glycans. Conclusion: 6 N-glycan groups have been observed to be effective enough to be a biomarker in cancerous and healthy tissues. It has been observed that trace elements and N-glycans differ in cancerous tissues and that they are also effective concerning variations of PTC.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    468979

    Tiroid kanserinin obezite ile ilişkisi ve GLP-1, IGF-1 ve leptin'in rolü

    Relationship between thyroid cancer and obesity; and the role of GLP-1, IGF-1 and leptin

    FATMA BAŞIBÜYÜK ŞAHİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıAnkara Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA ŞAHİN

  2. Tez No

    659740

    Tiroid kanserlerinde miRNA oluşum yolağındaki genlerin ekspresyon düzeylerinin araştırılması

    Investigation of the expression levels of genes in the miRNA formation pathway in thyroid cancers

    SİBEL ÖZALP

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Tıbbi BiyolojiMersin Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET EMİN ERDAL

  3. Tez No

    316934

    Diferansiye tiroid kanserlerinde insülin direnç gen polimorfizmlerinin araştırlması

    Investigation of insulin resistance gene polymorphisms in differentiated thyroid cancers

    MUSTAFA AKKER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıTrakya Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SİBEL GÜLDİKEN

  4. Tez No

    514071

    Diferansiye tiroid karsinomunda radyoaktif iyot tedavisinin kemik iliği üzerine etkileri ve sekonder kanser gelişimi

    The effects of radioactive iodine treatment on bone marrow in differentiated thyroid carcinoma and secondary cancer development

    HAKAN CENSUR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Aile HekimliğiBaşkent Üniversitesi

    Aile Hekimliği Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ CİHAN FİDAN

  5. Tez No

    285790

    Diferansiye Tiroid Kanserlerinde Phosphatase and tensin homolog (PTEN), Phosphoinositide-3 kinase (PI3K), mammalian target of rapamycin (mTOR), KRAS ekspresyonlarının değerlendirilmesi ve klinik prognostik önemi

    Clinic and prognostic significance of Phosphatase and tensin homolog (PTEN), Phosphoinositide 3 kinase (PI3K), mammalian target of rapamycin (MTOR), KRAS expression in differentiated thyroid cancer

    BERNA BOZKURT DUMAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    OnkolojiÇukurova Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. I. OĞUZ KARA

Geri Dön